ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Metaperipatus inae mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010961	TTTTAT	3	210	227	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	190349580
2	NC_010961	TA	6	251	261	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	190349580
3	NC_010961	TTTTAT	3	779	797	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	190349581
4	NC_010961	ATAA	3	1036	1047	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	190349582
5	NC_010961	TTTA	3	1433	1443	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	190349582
6	NC_010961	TA	6	1757	1767	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	190349583
7	NC_010961	TAA	4	1839	1850	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	190349583
8	NC_010961	ATT	4	1955	1966	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	190349583
9	NC_010961	TAT	4	2429	2439	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	190349583
10	NC_010961	ATA	4	2661	2674	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	190349583
11	NC_010961	ATTT	3	2691	2701	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	190349583
12	NC_010961	TTAA	3	2757	2769	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	190349583
13	NC_010961	TAA	4	2911	2921	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	190349583
14	NC_010961	ATT	4	3239	3249	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	190349584
15	NC_010961	TA	6	4003	4013	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	190349584
16	NC_010961	TCAT	3	4020	4031	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	190349584
17	NC_010961	TAAA	3	4161	4171	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_010961	AT	6	4406	4416	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_010961	TA	7	4424	4436	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_010961	TTA	4	4511	4522	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_010961	ATT	5	4559	4574	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_010961	ATA	4	4829	4840	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_010961	TA	14	4846	4873	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_010961	TAT	4	4898	4908	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_010961	TA	8	4973	4987	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_010961	TAT	4	5130	5142	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_010961	ATTT	3	5670	5680	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	190349585
28	NC_010961	TAAT	3	5952	5964	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	190349585
29	NC_010961	AT	7	5987	5999	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	190349585
30	NC_010961	ATT	5	6247	6260	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	190349585
31	NC_010961	ATATT	3	6407	6421	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	190349585
32	NC_010961	AG	6	6802	6812	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	190349586
33	NC_010961	ATTT	3	8194	8205	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	190349587
34	NC_010961	ATT	4	8237	8248	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	190349587
35	NC_010961	TATT	4	8731	8746	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	190349587
36	NC_010961	TAAATT	3	8897	8914	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	190349588
37	NC_010961	TTA	4	9156	9166	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	190349588
38	NC_010961	ATTT	3	9172	9183	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	190349588
39	NC_010961	AATT	3	9297	9308	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010961	ATT	4	9997	10009	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_010961	AT	9	10398	10414	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
42	NC_010961	ATTT	3	10561	10572	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010961	TTTA	3	11348	11358	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	190349590
44	NC_010961	AAT	4	11643	11653	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	190349590
45	NC_010961	TAA	4	12079	12089	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	190349590
46	NC_010961	TAA	4	12227	12237	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	190349590
47	NC_010961	ATA	4	12269	12280	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	190349590
48	NC_010961	CAG	4	12379	12390	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	190349590
49	NC_010961	ATTT	3	12391	12401	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	190349590
50	NC_010961	AAT	4	12686	12697	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	190349590
51	NC_010961	TAT	5	12927	12941	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	190349591
52	NC_010961	TTTA	3	13123	13134	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	190349591
53	NC_010961	ATT	4	13706	13717	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	190349592
54	NC_010961	TAA	4	14047	14058	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	190349592
55	NC_010961	TA	6	14432	14442	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	190349592
56	NC_010961	AT	6	14533	14543	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_010961	ATTT	3	15120	15131	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_010961	TAT	5	15146	15161	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_010961	ATT	4	15162	15172	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Metaperipatus inae mitochondrion