ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Fagopyrum esculentum subsp. ancestrale chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010776	TCTT	3	157	168	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_010776	ATA	4	224	236	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_010776	CAG	4	1030	1041	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	189162251
4	NC_010776	AAGT	3	1136	1146	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	189162251
5	NC_010776	A	14	4292	4305	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_010776	TAT	4	4454	4466	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_010776	A	14	4585	4598	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_010776	TTTG	3	4826	4837	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_010776	TTTA	3	5144	5154	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	189162253
10	NC_010776	TCTCT	3	5184	5197	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	189162253
11	NC_010776	TA	9	5346	5362	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	189162253
12	NC_010776	ATTC	3	5576	5586	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	189162253
13	NC_010776	CTTT	3	6738	6750	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
14	NC_010776	AAGA	3	6801	6811	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_010776	TATT	3	6876	6887	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	189162254
16	NC_010776	ATA	4	7645	7656	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_010776	TAT	5	7739	7752	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_010776	AGTA	3	7753	7763	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_010776	TTAAA	3	7884	7898	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_010776	TTCG	3	8528	8538	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
21	NC_010776	AT	6	9647	9658	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_010776	GTCT	3	10703	10714	12	0 %	50 %	25 %	25 %	0 %	189162256
23	NC_010776	AAAT	3	13365	13376	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_010776	CTTT	3	13398	13408	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
25	NC_010776	ATTCA	3	13519	13532	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
26	NC_010776	AAGA	3	13879	13889	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_010776	AATT	3	14832	14844	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_010776	A	13	15645	15657	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_010776	CAT	4	17390	17400	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	189162261
30	NC_010776	T	14	17826	17839	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	189162261
31	NC_010776	TTGAA	3	18215	18228	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	189162261
32	NC_010776	TTA	4	18357	18368	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189162261
33	NC_010776	TCT	4	21458	21468	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	189162262
34	NC_010776	GTT	4	22905	22916	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	189162262
35	NC_010776	CCTA	3	23825	23835	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	189162263
36	NC_010776	GAAA	3	25550	25562	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	189162263
37	NC_010776	TAC	4	26501	26513	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
38	NC_010776	GAGAAA	3	26661	26677	17	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_010776	TTA	4	26693	26704	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_010776	TCAAT	3	26840	26853	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
41	NC_010776	TA	7	26988	27000	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_010776	TA	6	27014	27024	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_010776	TA	6	27027	27037	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_010776	AAT	4	27091	27103	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_010776	A	13	27301	27313	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_010776	T	12	27461	27472	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_010776	ATCA	3	27749	27759	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
48	NC_010776	TA	6	27791	27802	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_010776	TAT	4	29759	29770	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_010776	TA	7	30147	30160	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_010776	ATTT	3	30387	30397	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_010776	TCTT	3	32341	32352	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
53	NC_010776	AT	6	32669	32679	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_010776	TTGC	3	34742	34752	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	189162267
55	NC_010776	AG	6	35600	35610	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_010776	AT	7	35811	35826	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_010776	ATTT	3	36128	36138	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	189162268
58	NC_010776	AT	8	36466	36480	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_010776	AATG	3	40256	40267	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	189162271
60	NC_010776	GCA	4	40661	40672	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	189162271
61	NC_010776	CTTT	3	43029	43039	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	260780631
62	NC_010776	ATA	4	43844	43855	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	260780631
63	NC_010776	CTTT	3	44424	44435	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	260780631
64	NC_010776	TTA	4	45955	45967	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	189162273
65	NC_010776	AT	6	46775	46785	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_010776	AATT	3	46798	46809	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_010776	ATAA	3	46810	46821	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_010776	A	13	46884	46896	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_010776	AAAAT	3	46911	46925	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_010776	TTAAGA	3	47585	47601	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_010776	CAA	4	51585	51595	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
72	NC_010776	GTTT	3	51618	51630	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_010776	TAA	4	51711	51722	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_010776	TAT	4	52388	52398	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_010776	AAAG	3	53299	53309	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_010776	TAG	4	55243	55254	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	189162278
77	NC_010776	AT	6	55569	55579	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_010776	TTG	4	56015	56025	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_010776	TGCA	3	56945	56957	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	189162279
80	NC_010776	TA	6	57712	57723	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_010776	AGA	5	59776	59789	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_010776	TAAA	3	61835	61845	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_010776	AATG	4	62591	62606	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	189162283
84	NC_010776	AAGG	3	62697	62708	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_010776	TA	7	62876	62888	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	189162284
86	NC_010776	AAATA	3	63233	63246	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	189162284
87	NC_010776	TA	6	64031	64041	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_010776	TAG	4	64268	64278	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_010776	CTTT	3	66398	66409	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
90	NC_010776	TA	7	66814	66827	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_010776	T	13	67151	67163	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010776	TAT	5	67173	67188	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_010776	GTA	4	67202	67216	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010776	AAAGA	3	67482	67496	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_010776	TATT	3	67987	67998	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_010776	TTTCT	3	68055	68068	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
97	NC_010776	TA	7	68397	68410	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_010776	AT	6	68498	68508	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_010776	ATA	4	68599	68609	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_010776	AACA	3	69076	69087	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	189162293
101	NC_010776	TGAA	3	69690	69701	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	189162294
102	NC_010776	CTAA	3	69708	69719	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
103	NC_010776	AATA	3	69931	69942	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_010776	TTTA	3	71206	71217	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	189162334
105	NC_010776	ATAA	4	72106	72121	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	189162334
106	NC_010776	A	14	72194	72207	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	189162334
107	NC_010776	A	12	72931	72942	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	189162334
108	NC_010776	CTT	4	74770	74780	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	189162334
109	NC_010776	TAA	4	76347	76358	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189162334
110	NC_010776	TCGG	3	76832	76842	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	189162334
111	NC_010776	TAATT	3	77690	77703	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	189162334
112	NC_010776	AT	6	78062	78073	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	189162334
113	NC_010776	TGAA	3	78740	78751	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	189162334
114	NC_010776	TAAA	3	78785	78795	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	189162334
115	NC_010776	TTTC	3	80907	80917	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	189162334
116	NC_010776	GGA	4	80953	80965	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	189162334
117	NC_010776	GAAA	3	81997	82007	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	189162334
118	NC_010776	AT	6	82606	82616	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	189162334
119	NC_010776	AGTT	4	83384	83398	15	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	189162334
120	NC_010776	T	14	84645	84658	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	189162334
121	NC_010776	CTT	4	85098	85109	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	189162334
122	NC_010776	GAT	4	85566	85576	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	189162334
123	NC_010776	A	12	87729	87740	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	189162334
124	NC_010776	TTCT	3	88294	88304	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	189162334
125	NC_010776	CTTT	3	89457	89467	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	189162334
126	NC_010776	GAT	4	89603	89614	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	189162334
127	NC_010776	CTT	4	89872	89883	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	189162334
128	NC_010776	AGAA	3	90277	90288	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	189162334
129	NC_010776	CTT	4	90848	90859	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189162334
130	NC_010776	TGA	4	91855	91865	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	189162334
131	NC_010776	GAT	4	91910	91921	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	189162334
132	NC_010776	GAT	4	91982	91992	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	189162334
133	NC_010776	AATA	3	92243	92255	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	189162334
134	NC_010776	GGAT	3	93199	93209	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	189162334
135	NC_010776	CTTT	3	93374	93385	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	189162334
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Fagopyrum esculentum subsp. ancestrale chloroplast