Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Fagopyrum esculentum subsp. ancestrale chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_010776ATA42242361366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
2NC_010776CAG4103010411233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %189162251
3NC_010776TAT4445444661333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
4NC_010776ATA4764576561266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_010776TAT5773977521433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
6NC_010776CAT417390174001133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %189162261
7NC_010776TTA418357183681233.33 %66.67 %0 %0 %8 %189162261
8NC_010776TCT42145821468110 %66.67 %0 %33.33 %9 %189162262
9NC_010776GTT42290522916120 %66.67 %33.33 %0 %8 %189162262
10NC_010776TAC426501265131333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
11NC_010776TTA426693267041233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
12NC_010776AAT427091271031366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
13NC_010776TAT429759297701233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
14NC_010776GCA440661406721233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %189162271
15NC_010776ATA443844438551266.67 %33.33 %0 %0 %8 %260780631
16NC_010776TTA445955459671333.33 %66.67 %0 %0 %7 %189162273
17NC_010776CAA451585515951166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
18NC_010776TAA451711517221266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
19NC_010776TAT452388523981133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
20NC_010776TAG455243552541233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %189162278
21NC_010776TTG45601556025110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
22NC_010776AGA559776597891466.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
23NC_010776TAG464268642781133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
24NC_010776TAT567173671881633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
25NC_010776GTA467202672161533.33 %33.33 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
26NC_010776ATA468599686091166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
27NC_010776CTT47477074780110 %66.67 %0 %33.33 %9 %189162334
28NC_010776TAA476347763581266.67 %33.33 %0 %0 %8 %189162334
29NC_010776GGA480953809651333.33 %0 %66.67 %0 %7 %189162334
30NC_010776CTT48509885109120 %66.67 %0 %33.33 %8 %189162334
31NC_010776GAT485566855761133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %189162334
32NC_010776GAT489603896141233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %189162334
33NC_010776CTT48987289883120 %66.67 %0 %33.33 %8 %189162334
34NC_010776CTT49084890859120 %66.67 %0 %33.33 %0 %189162334
35NC_010776TGA491855918651133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %189162334
36NC_010776GAT491910919211233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %189162334
37NC_010776GAT491982919921133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %189162334
38NC_010776GAA51098221098361566.67 %0 %33.33 %0 %6 %189162295
39NC_010776TTC4110652110663120 %66.67 %0 %33.33 %8 %189162295
40NC_010776AGA41107661107771266.67 %0 %33.33 %0 %8 %189162295
41NC_010776ATT41110771110881233.33 %66.67 %0 %0 %8 %189162295
42NC_010776AAT41178291178391166.67 %33.33 %0 %0 %9 %189162295
43NC_010776GAA41180891180991166.67 %0 %33.33 %0 %9 %189162295
44NC_010776AAT41198081198201366.67 %33.33 %0 %0 %7 %189162295
45NC_010776ATT41200571200691333.33 %66.67 %0 %0 %7 %189162295
46NC_010776AAT41231901232011266.67 %33.33 %0 %0 %8 %189162295
47NC_010776CTT5128874128887140 %66.67 %0 %33.33 %7 %189162295
48NC_010776CTT4132545132556120 %66.67 %0 %33.33 %8 %189162295
49NC_010776AAT41333941334051266.67 %33.33 %0 %0 %8 %189162295
50NC_010776TCT4133702133713120 %66.67 %0 %33.33 %8 %189162295
51NC_010776GAA41338161338271266.67 %0 %33.33 %0 %8 %189162295
52NC_010776TTC6134639134657190 %66.67 %0 %33.33 %10 %189162295
53NC_010776ATT41348261348371233.33 %66.67 %0 %0 %8 %189162295
54NC_010776ATC41524871524971133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %189162331
55NC_010776ATC41525581525691233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %189162331
56NC_010776AAG41536201536311266.67 %0 %33.33 %0 %0 %189162331
57NC_010776AGA41545971546081266.67 %0 %33.33 %0 %8 %189162331
58NC_010776AGA41546461546571266.67 %0 %33.33 %0 %8 %189162331
59NC_010776ATC41548651548761233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %189162331
60NC_010776ATC41589031589131133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %189162333
61NC_010776GAA51593691593831566.67 %0 %33.33 %0 %6 %189162333