ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Heterosigma akashiwo chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010772	AAT	4	498	508	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_010772	TAA	4	1044	1055	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095289
3	NC_010772	ATA	4	7298	7308	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_010772	ATT	4	11677	11687	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_010772	CTG	4	16762	16773	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	189095298
6	NC_010772	AAG	4	17026	17037	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	189095298
7	NC_010772	GCT	4	18139	18150	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	193735610
8	NC_010772	CAC	4	18911	18922	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	193735610
9	NC_010772	TAA	4	19939	19950	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095300
10	NC_010772	AAT	4	20381	20392	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095300
11	NC_010772	TAA	4	20535	20545	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_010772	TAA	4	21244	21256	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_010772	AGA	4	22433	22444	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	189095302
14	NC_010772	TAT	4	25241	25252	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095309
15	NC_010772	AAT	4	26368	26380	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	189095310
16	NC_010772	TAA	4	33588	33599	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_010772	GCA	4	38138	38149	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	189095319
18	NC_010772	CAC	4	38382	38393	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	189095319
19	NC_010772	AAT	4	39434	39445	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_010772	TAA	5	40744	40758	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	189095321
21	NC_010772	TAA	4	41150	41161	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_010772	TAA	4	41186	41197	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_010772	CAA	4	44456	44466	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	189095324
24	NC_010772	ATT	4	46061	46071	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_010772	AGT	5	47769	47782	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	189095330
26	NC_010772	TTG	4	48430	48441	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	189095330
27	NC_010772	ATA	4	48961	48972	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_010772	ACA	4	52913	52925	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	189095332
29	NC_010772	ATT	4	56768	56779	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_010772	ATA	4	56910	56921	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_010772	ATT	4	58349	58360	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_010772	ATT	4	59204	59216	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	189095339
33	NC_010772	ATT	5	59418	59431	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_010772	TAA	4	60182	60194	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_010772	TTA	4	60909	60921	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_010772	TTA	4	61620	61630	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_010772	TTA	4	61774	61785	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095344
38	NC_010772	TTA	4	62215	62226	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095344
39	NC_010772	GGT	4	63242	63253	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	193735611
40	NC_010772	TGG	4	63322	63333	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	193735611
41	NC_010772	GCA	4	64016	64027	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	193735611
42	NC_010772	TCT	4	65128	65138	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	189095346
43	NC_010772	CAG	4	65392	65403	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	189095346
44	NC_010772	GAT	4	71941	71952	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	189095350
45	NC_010772	TAT	4	81108	81119	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095355
46	NC_010772	TAT	4	82167	82178	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_010772	CAA	4	82478	82489	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	189095356
48	NC_010772	TAA	4	82988	83000	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_010772	TTA	4	84023	84034	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095357
50	NC_010772	TAT	4	84481	84491	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	189095357
51	NC_010772	TAT	4	85260	85271	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095357
52	NC_010772	CAC	4	85494	85505	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	189095357
53	NC_010772	AAC	4	85870	85881	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	189095357
54	NC_010772	ATT	4	86846	86858	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	189095357
55	NC_010772	TTC	4	90784	90795	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	189095359
56	NC_010772	TAA	4	92866	92877	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_010772	ATT	5	93033	93047	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_010772	TTA	5	93043	93057	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_010772	TAA	4	93615	93626	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_010772	TTA	4	95860	95870	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_010772	TAT	5	97000	97014	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_010772	TAT	4	97517	97528	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095366
63	NC_010772	GAA	4	98989	99000	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	189095369
64	NC_010772	TTG	4	103109	103120	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	189095374
65	NC_010772	GAA	4	103598	103609	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	189095375
66	NC_010772	AGA	4	104920	104931	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	189095375
67	NC_010772	TAA	4	105654	105664	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	189095376
68	NC_010772	TAT	6	107515	107531	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_010772	CTT	4	108645	108656	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	189095380
70	NC_010772	ATA	4	109071	109083	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_010772	TTG	4	112422	112433	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	189095386
72	NC_010772	ATT	4	113550	113562	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_010772	TAT	5	114058	114072	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_010772	GAA	4	114664	114675	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	189095387
75	NC_010772	ATA	4	115042	115053	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095387
76	NC_010772	CAT	4	119321	119332	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	189095390
77	NC_010772	TAT	4	123586	123597	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_010772	ATA	4	123654	123665	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_010772	ACC	4	125995	126005	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	189095397
80	NC_010772	TCT	4	126835	126845	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	189095398
81	NC_010772	ATA	4	126881	126891	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	189095398
82	NC_010772	ATG	4	127955	127966	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	189095400
83	NC_010772	GCT	4	128252	128263	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	189095400
84	NC_010772	TTA	4	128392	128403	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_010772	GTT	4	130366	130377	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	189095402
86	NC_010772	ATT	4	131237	131248	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095402
87	NC_010772	TAT	4	132465	132476	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095404
88	NC_010772	ATA	4	134433	134444	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095405
89	NC_010772	CTT	5	135710	135723	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	189095407
90	NC_010772	TCA	4	136255	136266	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	189095407
91	NC_010772	TTA	4	136747	136758	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_010772	TAA	5	137899	137913	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_010772	AAT	4	138656	138666	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	189095412
94	NC_010772	CAA	4	142983	142994	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	189095418
95	NC_010772	ATT	4	144958	144969	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095422
96	NC_010772	AAT	4	145711	145721	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	189095424
97	NC_010772	CAA	4	146036	146047	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	189095425
98	NC_010772	AAT	4	148186	148197	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095431
99	NC_010772	ACG	4	151880	151891	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	189095435
100	NC_010772	AAT	4	153083	153094	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095436
101	NC_010772	TAA	4	153176	153187	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095436
102	NC_010772	ATA	8	153527	153549	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095436
103	NC_010772	TAT	4	153941	153952	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095436
104	NC_010772	ATA	4	154411	154422	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095436
105	NC_010772	TAA	6	155611	155627	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
106	NC_010772	TAA	4	158369	158380	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095443
107	NC_010772	TAA	4	159167	159179	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Heterosigma akashiwo chloroplast