ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Heterosigma akashiwo chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010772	AAT	4	498	508	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_010772	TAA	4	1044	1055	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095289
3	NC_010772	AT	6	1292	1303	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	189095289
4	NC_010772	TA	8	1534	1548	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_010772	ATAA	3	3670	3681	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010772	AGGT	3	5053	5064	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010772	ATTT	3	6616	6626	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_010772	ATA	4	7298	7308	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_010772	TTATT	3	10194	10208	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	189095294
10	NC_010772	AAAT	3	11404	11414	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	189095294
11	NC_010772	ATT	4	11677	11687	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_010772	AT	6	12772	12782	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_010772	ATTT	3	15215	15226	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_010772	CTTA	3	15730	15740	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	189095297
15	NC_010772	CTG	4	16762	16773	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	189095298
16	NC_010772	AAG	4	17026	17037	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	189095298
17	NC_010772	A	18	17898	17915	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
18	NC_010772	TTTAT	3	18057	18070	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_010772	AATT	3	18073	18084	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	193735610
20	NC_010772	GCT	4	18139	18150	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	193735610
21	NC_010772	CAC	4	18911	18922	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	193735610
22	NC_010772	TAA	4	19939	19950	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095300
23	NC_010772	AAT	4	20381	20392	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095300
24	NC_010772	TAA	4	20535	20545	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_010772	AAAT	3	20661	20671	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_010772	ATTA	3	20706	20717	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_010772	TAA	4	21244	21256	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_010772	AGA	4	22433	22444	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	189095302
29	NC_010772	AGAAA	3	23167	23180	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	189095304
30	NC_010772	TTAT	3	24599	24610	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	189095308
31	NC_010772	TAT	4	25241	25252	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095309
32	NC_010772	AAT	4	26368	26380	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	189095310
33	NC_010772	ATTT	3	27968	27978	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_010772	A	14	28880	28893	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	189095311
35	NC_010772	AT	8	29463	29477	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_010772	AT	6	30642	30653	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	189095313
37	NC_010772	TAA	4	33588	33599	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_010772	AATT	3	33662	33673	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_010772	ATTA	3	34108	34119	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	189095315
40	NC_010772	AATT	3	36141	36152	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	189095317
41	NC_010772	AATT	3	37097	37107	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_010772	GCA	4	38138	38149	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	189095319
43	NC_010772	CAC	4	38382	38393	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	189095319
44	NC_010772	TAAA	3	38422	38432	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	189095319
45	NC_010772	TTAA	3	39061	39072	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_010772	AAT	4	39434	39445	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_010772	TTAA	3	40269	40280	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_010772	TAA	5	40744	40758	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	189095321
49	NC_010772	TTGA	3	40911	40921	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_010772	TAA	4	41150	41161	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_010772	TAA	4	41186	41197	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_010772	ATTT	3	41253	41265	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_010772	AATT	3	41386	41396	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_010772	TAAA	3	41713	41724	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_010772	TAAA	3	41985	41996	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_010772	TA	8	42061	42076	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_010772	TA	6	43157	43170	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_010772	CAA	4	44456	44466	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	189095324
59	NC_010772	AAATT	4	45127	45146	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
60	NC_010772	ATTA	4	45329	45344	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_010772	TAAGAA	3	46015	46032	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
62	NC_010772	ATT	4	46061	46071	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_010772	TTAAA	3	46753	46767	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_010772	ATTT	3	47161	47173	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	189095329
65	NC_010772	TAAA	3	47299	47310	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	189095329
66	NC_010772	AGT	5	47769	47782	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	189095330
67	NC_010772	TTG	4	48430	48441	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	189095330
68	NC_010772	ATTAAA	3	48894	48911	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010772	ATA	4	48961	48972	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_010772	ACA	4	52913	52925	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	189095332
71	NC_010772	TAAA	3	53535	53545	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	189095332
72	NC_010772	ATTA	3	53819	53829	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_010772	ACAA	3	55878	55888	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
74	NC_010772	TTAA	3	56344	56355	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010772	AATT	3	56600	56610	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_010772	ATT	4	56768	56779	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_010772	TAAAAA	3	56802	56820	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
78	NC_010772	ATTT	3	56834	56845	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_010772	ATA	4	56910	56921	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_010772	ATT	4	58349	58360	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_010772	ACAA	3	58813	58824	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
82	NC_010772	TTTA	3	58940	58951	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	189095339
83	NC_010772	ATT	4	59204	59216	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	189095339
84	NC_010772	ATT	5	59418	59431	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_010772	AGAAA	3	59797	59811	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	189095341
86	NC_010772	TAA	4	60182	60194	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_010772	TTA	4	60909	60921	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_010772	TAAT	3	61448	61459	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_010772	ATTT	3	61494	61504	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_010772	TTA	4	61620	61630	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_010772	TTA	4	61774	61785	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095344
92	NC_010772	TTA	4	62215	62226	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095344
93	NC_010772	GGT	4	63242	63253	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	193735611
94	NC_010772	TGG	4	63322	63333	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	193735611
95	NC_010772	GCA	4	64016	64027	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	193735611
96	NC_010772	AATT	3	64081	64092	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	193735611
97	NC_010772	T	15	64253	64267	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010772	TCT	4	65128	65138	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	189095346
99	NC_010772	CAG	4	65392	65403	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	189095346
100	NC_010772	ATTT	3	66990	67001	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_010772	AT	6	69221	69231	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_010772	AATT	3	70370	70380	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_010772	AATT	3	70393	70403	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_010772	ATTT	3	70751	70761	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	189095350
105	NC_010772	GAT	4	71941	71952	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	189095350
106	NC_010772	AAATT	3	71961	71975	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	189095350
107	NC_010772	AAGA	3	72112	72124	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	189095351
108	NC_010772	AAAT	3	75539	75549	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_010772	CTAC	3	77099	77110	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010772	TA	8	80617	80631	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
111	NC_010772	TTTA	3	80859	80870	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_010772	TAT	4	81108	81119	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095355
113	NC_010772	TAT	4	82167	82178	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_010772	CAA	4	82478	82489	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	189095356
115	NC_010772	TAA	4	82988	83000	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_010772	AATT	3	83042	83053	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_010772	TTA	4	84023	84034	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095357
118	NC_010772	TTTA	3	84203	84214	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	189095357
119	NC_010772	TAT	4	84481	84491	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	189095357
120	NC_010772	TTAA	3	84663	84674	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	189095357
121	NC_010772	ATTT	3	84973	84983	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	189095357
122	NC_010772	TAT	4	85260	85271	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095357
123	NC_010772	CAC	4	85494	85505	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	189095357
124	NC_010772	TTTTC	3	85523	85536	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	189095357
125	NC_010772	AAC	4	85870	85881	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	189095357
126	NC_010772	TTTA	3	86497	86507	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	189095357
127	NC_010772	ATT	4	86846	86858	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	189095357
128	NC_010772	TTAAAT	3	86883	86901	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	189095358
129	NC_010772	T	19	88812	88830	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	189095359
130	NC_010772	TTTCTT	6	88902	88937	36	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	189095359
131	NC_010772	TTC	4	90784	90795	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	189095359
132	NC_010772	GAAC	3	91302	91313	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	189095359
133	NC_010772	TTTTA	3	92443	92458	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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135	NC_010772	TA	6	93002	93013	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_010772	ATT	5	93033	93047	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
137	NC_010772	TTA	5	93043	93057	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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139	NC_010772	ACTA	3	95421	95431	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
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165	NC_010772	TTAT	3	113823	113834	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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231	NC_010772	A	13	150799	150811	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
232	NC_010772	ACG	4	151880	151891	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	189095435
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240	NC_010772	TAA	6	155611	155627	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
241	NC_010772	TTTA	3	155826	155837	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	189095440
242	NC_010772	TGAA	3	157765	157776	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
243	NC_010772	ATTT	3	157792	157804	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
244	NC_010772	TAA	4	158369	158380	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095443
245	NC_010772	AT	9	158467	158483	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
246	NC_010772	TAAA	3	159004	159014	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	189095444
247	NC_010772	TAA	4	159167	159179	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
248	NC_010772	TA	7	159218	159230	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Heterosigma akashiwo chloroplast