ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Aphrocallistes vastus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010769	AATA	3	31	41	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_010769	AAT	4	231	243	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_010769	ATAAA	3	317	331	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010769	AAAT	3	440	450	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_010769	TACAA	3	623	637	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
6	NC_010769	AAAT	3	739	749	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_010769	TAA	4	1758	1769	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_010769	TCTA	3	1840	1850	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
9	NC_010769	TAA	4	1909	1920	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095557
10	NC_010769	TAA	4	2083	2094	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095557
11	NC_010769	AAAAT	4	2161	2180	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
12	NC_010769	ATA	4	2479	2491	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	189095558
13	NC_010769	TAAA	3	3094	3105	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	189095558
14	NC_010769	TACCA	3	3106	3119	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	189095559
15	NC_010769	AAT	4	3972	3983	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095560
16	NC_010769	ATA	4	4153	4164	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095560
17	NC_010769	CCTA	3	4328	4338	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	189095560
18	NC_010769	CAAAA	3	4831	4844	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	189095560
19	NC_010769	ACAA	3	5653	5664	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	189095561
20	NC_010769	ATA	4	5681	5691	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	189095561
21	NC_010769	AGAA	3	5968	5978	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	189095561
22	NC_010769	TAA	4	6390	6401	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095561
23	NC_010769	CAA	4	6486	6496	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	189095561
24	NC_010769	CTA	4	6559	6570	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	189095561
25	NC_010769	ATA	4	7131	7142	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095562
26	NC_010769	TAA	4	7294	7304	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	189095562
27	NC_010769	AAT	4	7439	7450	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095562
28	NC_010769	AT	7	7650	7662	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	189095562
29	NC_010769	AATA	3	7816	7827	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	189095562
30	NC_010769	TAA	4	9031	9042	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	189095563
31	NC_010769	AAAC	3	9262	9272	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	189095563
32	NC_010769	AAGAAT	3	9637	9654	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	189095564
33	NC_010769	CTA	4	9779	9790	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	189095564
34	NC_010769	ATA	4	9962	9973	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	189095564
35	NC_010769	CATGA	3	10197	10210	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	189095564
36	NC_010769	ATT	4	10504	10515	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	189095564
37	NC_010769	CTA	4	10790	10800	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	189095564
38	NC_010769	AAG	4	10810	10821	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	189095564
39	NC_010769	TAA	4	11803	11813	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_010769	AAAT	3	11836	11847	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_010769	AATT	3	11939	11950	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_010769	AAC	4	12200	12210	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_010769	TAA	4	12355	12366	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_010769	ATT	4	12597	12608	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_010769	ATAA	4	12666	12681	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_010769	TTAT	3	13209	13220	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010769	ATA	5	13380	13393	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_010769	TAA	4	13886	13897	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_010769	AAAAT	4	13913	13933	21	80 %	20 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_010769	AATAT	3	14430	14444	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	189095567
51	NC_010769	AGG	4	15525	15536	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	189095568
52	NC_010769	ATA	5	16425	16439	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	189095568
53	NC_010769	CA	6	16511	16521	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
54	NC_010769	ATA	4	16655	16666	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_010769	AAT	5	16842	16856	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	189095569
56	NC_010769	TCAA	3	17141	17151	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	189095569
57	NC_010769	TCAT	3	17337	17348	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	189095569

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Aphrocallistes vastus mitochondrion