ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Welwitschia mirabilis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010654	AAGC	3	1358	1369	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_010654	ATC	4	1807	1817	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	187763086
3	NC_010654	CA	6	2982	2993	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
4	NC_010654	CAT	4	3077	3088	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_010654	ATTT	3	3419	3430	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_010654	TAAA	3	3469	3480	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_010654	CTTT	4	3738	3754	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
8	NC_010654	TAT	4	3964	3975	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_010654	A	13	4195	4207	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_010654	A	18	4578	4595	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
11	NC_010654	CTTT	3	4682	4693	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
12	NC_010654	A	12	4856	4867	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_010654	CTTTTT	4	5148	5170	23	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	4 %	Non-Coding
14	NC_010654	GAAT	3	5834	5844	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_010654	CTTTTT	3	5846	5863	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
16	NC_010654	GAAA	3	7399	7410	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	187763088
17	NC_010654	TTTG	3	7483	7493	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	187763088
18	NC_010654	TA	6	7498	7508	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	187763088
19	NC_010654	CTTAT	3	7755	7768	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	187763088
20	NC_010654	TCTT	3	7780	7791	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	187763088
21	NC_010654	GA	6	8397	8408	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_010654	T	12	8677	8688	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010654	ATTT	3	9231	9242	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_010654	AGAA	3	9278	9289	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_010654	AGA	4	9765	9776	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_010654	CAAA	3	10050	10061	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	187763091
27	NC_010654	ATG	4	11156	11166	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	187763091
28	NC_010654	AATG	3	12646	12657	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	187763092
29	NC_010654	GCA	4	13051	13062	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	187763092
30	NC_010654	ATG	4	13377	13387	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	187763092
31	NC_010654	TTA	4	15044	15054	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	187763093
32	NC_010654	TTTG	3	16678	16689	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_010654	TAAGA	3	16801	16814	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_010654	AT	6	17381	17392	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	187763094
35	NC_010654	TA	6	17868	17878	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_010654	A	14	18363	18376	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_010654	T	13	18486	18498	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010654	GAA	4	19044	19054	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	187763097
39	NC_010654	AGAA	3	19545	19555	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	187763097
40	NC_010654	AACAG	3	20261	20274	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	187763097
41	NC_010654	GAT	4	21471	21482	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	187763097
42	NC_010654	AACA	3	21779	21790	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	187763097
43	NC_010654	GAAA	3	25571	25581	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	187763099
44	NC_010654	AT	6	25769	25779	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	187763099
45	NC_010654	TA	6	26002	26013	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	187763099
46	NC_010654	AATTC	4	26321	26341	21	40 %	40 %	0 %	20 %	9 %	187763099
47	NC_010654	AGA	4	26834	26845	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	187763099
48	NC_010654	AGA	4	26849	26860	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	187763099
49	NC_010654	CAAAAA	3	26974	26991	18	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	5 %	187763099
50	NC_010654	ATCA	3	28005	28015	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	187763099
51	NC_010654	AAG	5	29063	29080	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	187763099
52	NC_010654	CAAA	3	29210	29220	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_010654	AAATA	3	29438	29451	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	187763100
54	NC_010654	ATACT	3	30422	30437	16	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	187763101
55	NC_010654	AGA	4	30669	30680	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	187763101
56	NC_010654	AAAC	3	31329	31339	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
57	NC_010654	CTG	4	31411	31422	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	187763102
58	NC_010654	GAAAA	3	35359	35373	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_010654	AAAAT	3	35627	35641	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_010654	TC	6	36207	36218	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
61	NC_010654	GAAA	3	36329	36340	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	187763106
62	NC_010654	TTAA	3	36398	36409	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_010654	AGAT	3	36543	36553	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_010654	AGAA	3	36616	36626	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	187763107
65	NC_010654	ATA	4	36970	36981	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_010654	ATT	4	36978	36990	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_010654	CTTT	3	39648	39660	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
68	NC_010654	AAGA	3	40033	40044	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_010654	AAGA	3	42435	42446	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	187763109
70	NC_010654	A	12	42469	42480	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010654	AGC	4	43054	43065	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	187763110
72	NC_010654	TGCA	3	43777	43789	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	187763110
73	NC_010654	ATT	4	44688	44699	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_010654	TGA	4	44991	45001	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_010654	TTA	4	46032	46043	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	187763113
76	NC_010654	AG	6	46796	46807	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_010654	AT	6	46808	46818	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_010654	GAAA	3	46864	46874	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	187763114
79	NC_010654	TTTC	3	48784	48795	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010654	TAA	4	49350	49360	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_010654	TAA	4	49774	49785	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_010654	ATA	4	49990	50000	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_010654	TGAT	3	50032	50043	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_010654	AAGA	3	50989	51000	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	187763122
85	NC_010654	TTAA	3	51495	51506	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	187763123
86	NC_010654	AATA	3	52255	52265	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_010654	ATGG	3	52667	52678	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_010654	T	13	52931	52943	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	187763125
89	NC_010654	TCT	4	53079	53090	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	187763125
90	NC_010654	ATT	4	53828	53838	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	187763125
91	NC_010654	T	14	53881	53894	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	187763125
92	NC_010654	ATT	4	54113	54124	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	187763125
93	NC_010654	ATC	27	54238	54318	81	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	187763125
94	NC_010654	ATC	5	54322	54336	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	187763125
95	NC_010654	ATC	4	54352	54363	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	187763125
96	NC_010654	TTC	5	54775	54789	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187763125
97	NC_010654	AGTTTC	3	54835	54852	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	187763125
98	NC_010654	TAAA	3	55232	55243	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	187763125
99	NC_010654	TTCC	3	55373	55384	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	187763125
100	NC_010654	ACG	5	55564	55578	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	187763125
101	NC_010654	TA	12	55852	55873	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	187763125
102	NC_010654	TATT	3	56555	56566	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	187763125
103	NC_010654	GATGGA	3	57122	57140	19	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	10 %	187763125
104	NC_010654	GTTG	3	57147	57158	12	0 %	50 %	50 %	0 %	0 %	187763125
105	NC_010654	CTTTT	4	57505	57525	21	0 %	80 %	0 %	20 %	9 %	187763125
106	NC_010654	AAAT	4	57807	57822	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	187763125
107	NC_010654	ATC	38	57961	58070	110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	187763125
108	NC_010654	AT	6	58680	58690	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	187763125
109	NC_010654	AATG	3	61318	61329	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	187763125
110	NC_010654	TTTC	3	62152	62162	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	187763125
111	NC_010654	ATATCT	6	62550	62585	36	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	187763125
112	NC_010654	GAATA	3	63322	63335	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	187763125
113	NC_010654	TTCT	3	63548	63558	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	187763125
114	NC_010654	TTCG	3	63666	63677	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	187763125
115	NC_010654	A	14	64266	64279	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	187763125
116	NC_010654	TTTG	3	64731	64742	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	187763125
117	NC_010654	T	14	65535	65548	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	187763125
118	NC_010654	T	13	65660	65672	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	187763125
119	NC_010654	ATTA	3	65971	65983	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	187763125
120	NC_010654	GTTTT	3	66657	66671	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	187763125
121	NC_010654	T	13	66958	66970	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	187763125
122	NC_010654	T	14	66999	67012	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	187763125
123	NC_010654	TCC	4	67463	67473	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	187763125
124	NC_010654	TA	6	67612	67623	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	187763125
125	NC_010654	TTAT	3	67693	67703	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	187763125
126	NC_010654	ATT	5	67768	67781	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	187763125
127	NC_010654	CTTTT	3	68272	68287	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	187763125
128	NC_010654	TGTTT	3	68729	68742	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	187763125
129	NC_010654	GATA	3	68879	68891	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	187763125
130	NC_010654	TAA	4	69529	69539	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	187763125
131	NC_010654	AGA	4	69642	69652	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	187763125
132	NC_010654	AGA	4	69660	69670	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	187763125
133	NC_010654	AGA	4	69678	69688	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	187763125
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199	NC_010654	AAACA	3	119541	119554	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Welwitschia mirabilis chloroplast