ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Dictyostelium fasciculatum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010653	TA	6	157	167	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	18776406
2	NC_010653	TA	6	644	654	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	18776406
3	NC_010653	TTATA	3	784	797	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	18776406
4	NC_010653	ATT	4	1426	1437	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18776406
5	NC_010653	AAAT	3	1718	1729	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	18776406
6	NC_010653	TA	7	1766	1778	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	18776406
7	NC_010653	TAT	4	1789	1800	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	18776406
8	NC_010653	TTTA	3	2347	2357	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	18776406
9	NC_010653	TTTA	3	2738	2750	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	18776406
10	NC_010653	TTTA	3	2897	2909	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	18776406
11	NC_010653	ATA	4	3234	3244	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	18776406
12	NC_010653	TAAA	3	3424	3436	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	18776406
13	NC_010653	AT	6	3564	3575	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	18776406
14	NC_010653	ATA	4	3706	3716	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	18776406
15	NC_010653	TAA	4	3950	3960	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	18776406
16	NC_010653	AAAT	3	4532	4543	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_010653	TAT	5	5390	5404	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	18776406
18	NC_010653	ATG	4	5488	5498	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	18776406
19	NC_010653	TATT	4	6151	6166	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	18776406
20	NC_010653	TAT	4	6477	6487	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18776406
21	NC_010653	GAAAA	3	6600	6613	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	18776406
22	NC_010653	ATT	5	6647	6661	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	18776406
23	NC_010653	AGA	4	7022	7033	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	18776406
24	NC_010653	AAAT	3	7716	7727	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	18776406
25	NC_010653	TTA	4	8961	8971	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18776406
26	NC_010653	GTAGGA	3	8987	9004	18	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	5 %	18776406
27	NC_010653	ATT	5	9392	9406	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	18776406
28	NC_010653	TATTT	3	10243	10257	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	18776406
29	NC_010653	AAAT	5	11174	11192	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	18776407
30	NC_010653	AAAT	3	11231	11242	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	18776407
31	NC_010653	TTTTAT	3	11284	11302	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	18776407
32	NC_010653	TAGT	3	11808	11818	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_010653	CAAA	4	12537	12551	15	75 %	0 %	0 %	25 %	6 %	18776407
34	NC_010653	TTTA	3	12752	12763	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	18776407
35	NC_010653	ATAA	3	14193	14204	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_010653	TATAA	3	14240	14253	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_010653	AAAT	3	14554	14565	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_010653	AGAA	3	14715	14727	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_010653	GAAA	3	15509	15520	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_010653	AAT	4	17000	17011	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18776407
41	NC_010653	AT	6	17172	17182	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	18776407
42	NC_010653	TA	6	17278	17288	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	18776407
43	NC_010653	TTTAAG	3	17732	17749	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	18776407
44	NC_010653	AAT	4	17750	17761	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18776407
45	NC_010653	ATA	6	17903	17919	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	18776407
46	NC_010653	AAAC	3	18000	18010	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	18776407
47	NC_010653	AAT	4	18271	18281	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	18776407
48	NC_010653	ATA	4	18674	18685	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18776407
49	NC_010653	TA	6	18702	18712	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	18776407
50	NC_010653	TGTT	3	18759	18770	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	18776407
51	NC_010653	TAT	4	18862	18873	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18776407
52	NC_010653	ATAAA	8	19481	19520	40	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_010653	AGCAGG	4	19615	19638	24	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	8 %	18776407
54	NC_010653	AAGT	3	19903	19915	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_010653	TA	6	20770	20780	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_010653	AT	6	21722	21732	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_010653	TA	6	22103	22114	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_010653	GAT	4	22154	22164	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_010653	GAT	4	22987	22997	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_010653	TTAA	3	24604	24615	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_010653	TA	6	25707	25717	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	18776407
62	NC_010653	CAG	4	26460	26470	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	18776407
63	NC_010653	TA	6	26539	26549	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	18776407
64	NC_010653	AAAAT	3	27067	27080	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	18776408
65	NC_010653	AAAAAT	4	27738	27760	23	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	18776408
66	NC_010653	TAT	4	27916	27926	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18776408
67	NC_010653	AATTTT	3	28046	28063	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	18776408
68	NC_010653	AACA	3	28804	28814	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	18776408
69	NC_010653	CAA	4	29224	29235	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	18776408
70	NC_010653	TAAA	3	30392	30402	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	18776408
71	NC_010653	A	12	30695	30706	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	18776408
72	NC_010653	TTTA	3	30910	30921	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	18776408
73	NC_010653	ATT	4	31069	31079	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18776408
74	NC_010653	ACAA	3	31458	31469	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	18776408
75	NC_010653	T	13	32120	32132	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	18776408
76	NC_010653	AGAAA	3	34112	34125	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	18776409
77	NC_010653	AT	8	34323	34337	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	18776409
78	NC_010653	AAAAT	3	34442	34456	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	18776409
79	NC_010653	AAAT	3	34871	34881	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	18776409
80	NC_010653	ATA	4	35115	35126	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18776409
81	NC_010653	TTTA	3	36475	36485	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	18776409
82	NC_010653	TAA	4	36842	36853	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18776409
83	NC_010653	A	12	37146	37157	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	18776409
84	NC_010653	A	13	37408	37420	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	18776409
85	NC_010653	TAA	4	37418	37429	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18776409
86	NC_010653	TTAA	3	37672	37683	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	18776409
87	NC_010653	AAAG	3	37825	37835	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	18776409
88	NC_010653	AAATT	3	38159	38173	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	18776409
89	NC_010653	ATAAAA	3	38748	38765	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	18776409
90	NC_010653	TTA	5	38969	38983	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	18776409
91	NC_010653	AATA	3	39309	39319	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	18776409
92	NC_010653	AAAT	3	39401	39411	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	18776409
93	NC_010653	TAAA	3	39671	39682	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	18776409
94	NC_010653	CAAAA	3	39975	39988	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	18776409
95	NC_010653	A	14	40484	40497	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	18776409
96	NC_010653	GTT	4	40527	40538	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	18776409
97	NC_010653	ATA	4	41238	41249	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18776409
98	NC_010653	TAAA	3	41334	41345	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	18776409
99	NC_010653	AAAG	3	41894	41905	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	18776410
100	NC_010653	TGA	4	41942	41952	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	18776410
101	NC_010653	AAAG	3	42656	42667	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	18776410
102	NC_010653	A	13	42681	42693	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	18776410
103	NC_010653	AACA	5	43057	43076	20	75 %	0 %	0 %	25 %	10 %	18776410
104	NC_010653	TATAT	3	43299	43313	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	18776410
105	NC_010653	ATTT	3	43324	43336	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	18776410
106	NC_010653	A	13	43476	43488	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	18776410
107	NC_010653	A	12	44415	44426	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	18776410
108	NC_010653	A	12	45023	45034	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	18776410
109	NC_010653	GAAA	3	45645	45655	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	18776410
110	NC_010653	ATA	4	45822	45833	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18776410
111	NC_010653	AAT	4	46289	46300	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18776410
112	NC_010653	TAAATA	4	46519	46542	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	18776410
113	NC_010653	CAAA	3	46779	46790	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	18776410
114	NC_010653	AAAATT	3	46924	46941	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	18776410
115	NC_010653	A	19	46988	47006	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	18776410
116	NC_010653	AAAT	3	48170	48180	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	18776410
117	NC_010653	AAAT	3	48633	48643	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	18776410
118	NC_010653	TAA	4	49226	49237	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18776410
119	NC_010653	AATA	3	49300	49311	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	18776410
120	NC_010653	TTA	4	50854	50865	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18776410
121	NC_010653	ATT	4	51123	51134	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18776410
122	NC_010653	TGCA	3	51182	51192	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	18776410
123	NC_010653	ATT	4	51409	51421	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	18776410
124	NC_010653	TCTA	3	51548	51559	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	18776410
125	NC_010653	ATA	4	52232	52243	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18776410
126	NC_010653	A	13	52245	52257	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	18776410
127	NC_010653	A	13	52464	52476	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	18776410
128	NC_010653	AAAT	3	53242	53252	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	18776410
129	NC_010653	TTAAA	3	53256	53270	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	18776410
130	NC_010653	ATTA	4	53687	53701	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	18776410
131	NC_010653	AAAT	3	53759	53770	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	18776410
132	NC_010653	AAAAAT	3	54047	54065	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	18776410
133	NC_010653	TA	6	54245	54255	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	18776410
134	NC_010653	TAT	4	54299	54309	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18776410

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Dictyostelium fasciculatum mitochondrion