ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Tilletia walkeri mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010651	TA	6	68	79	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_010651	AT	6	508	519	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_010651	TAAA	3	622	632	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_010651	TTAT	3	797	807	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_010651	TA	6	1362	1373	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_010651	ATA	4	1691	1701	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_010651	AT	6	1788	1799	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_010651	TTTTTC	3	2003	2021	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
9	NC_010651	A	13	2025	2037	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_010651	TA	6	2236	2246	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_010651	TA	6	2545	2555	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_010651	TAA	5	2632	2645	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_010651	AT	7	3156	3168	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_010651	ATT	4	3648	3659	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_010651	TTATT	3	3737	3750	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_010651	A	12	4254	4265	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_010651	AAAT	3	5055	5065	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_010651	TAT	4	6288	6299	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_010651	TAA	4	6400	6410	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_010651	TTA	5	6507	6522	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_010651	TAAA	3	7226	7238	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_010651	TAA	4	7881	7893	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_010651	TA	6	9281	9291	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_010651	ATT	4	9630	9641	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_010651	TA	7	9855	9868	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_010651	TA	6	10281	10291	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_010651	TA	8	10843	10858	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_010651	ATA	4	10885	10896	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_010651	TTA	5	11593	11607	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_010651	GCTATT	4	12704	12726	23	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	8 %	18737313
31	NC_010651	TA	6	13721	13731	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_010651	TA	7	13973	13986	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_010651	TTC	4	14553	14565	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
34	NC_010651	TTTA	5	14568	14587	20	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
35	NC_010651	TA	6	14590	14601	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_010651	ATAA	3	14629	14640	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010651	TA	6	14942	14952	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_010651	CAAA	3	15057	15068	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
39	NC_010651	TATT	3	15162	15172	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_010651	TTCT	3	15778	15789	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	18737314
41	NC_010651	TAAA	3	16646	16658	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_010651	TTA	4	16793	16803	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_010651	G	13	16835	16847	13	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_010651	GAT	4	16968	16979	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	18737314
45	NC_010651	TA	8	17796	17810	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_010651	TTTA	3	17962	17972	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_010651	TA	6	17988	17998	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_010651	TTTA	3	18134	18145	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_010651	ATA	4	19083	19095	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_010651	GAAA	3	19410	19420	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_010651	TTTA	3	19475	19485	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_010651	TAT	4	19539	19550	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_010651	ATTATA	3	19698	19716	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
54	NC_010651	TAT	4	19744	19756	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_010651	T	12	20008	20019	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_010651	TA	6	20082	20092	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_010651	CATA	3	20128	20138	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
58	NC_010651	AAG	4	20252	20263	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_010651	TAAATA	3	20975	20993	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
60	NC_010651	AT	6	21692	21703	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_010651	TTTA	3	21786	21796	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_010651	TA	7	21940	21952	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_010651	TA	6	22111	22122	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_010651	ATGTAT	7	22177	22218	42	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	4 %	Non-Coding
65	NC_010651	TA	7	22641	22653	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_010651	ATA	5	22712	22725	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_010651	TA	7	23512	23524	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	18737314
68	NC_010651	TAA	4	23629	23643	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_010651	TAA	4	24081	24093	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_010651	ATT	4	24162	24173	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_010651	AT	7	25304	25316	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	18737314
72	NC_010651	TAATA	3	27146	27160	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	18737314
73	NC_010651	CTT	4	27493	27505	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	18737314
74	NC_010651	TAATA	3	28659	28672	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	18737314
75	NC_010651	CAAA	3	28798	28808	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
76	NC_010651	TAAAA	3	28828	28842	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_010651	T	12	29327	29338	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010651	TA	11	29720	29741	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_010651	ATT	5	30170	30184	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_010651	TAT	5	30214	30228	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_010651	ATT	4	30256	30266	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_010651	ATA	4	30295	30306	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_010651	TTA	4	30470	30481	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010651	TA	7	30639	30651	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_010651	GAA	4	30673	30684	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_010651	TA	6	30698	30708	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_010651	TA	7	31010	31023	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_010651	TAAA	3	31528	31540	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_010651	AT	6	32350	32361	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_010651	TATT	3	33114	33125	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_010651	TTA	4	33187	33198	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_010651	ATA	4	33468	33478	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_010651	TAA	4	33876	33887	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_010651	G	16	33979	33994	16	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_010651	TAA	4	34744	34755	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_010651	AAAT	4	34967	34982	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	18737314
97	NC_010651	TATG	3	35494	35504	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	18737314
98	NC_010651	TCTT	3	35825	35835	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	18737314
99	NC_010651	GCT	4	36012	36023	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	18737314
100	NC_010651	ATTAT	3	36087	36102	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	18737314
101	NC_010651	GTAT	3	36622	36633	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	18737314
102	NC_010651	TAT	4	37001	37011	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_010651	CCCCT	3	37389	37402	14	0 %	20 %	0 %	80 %	7 %	Non-Coding
104	NC_010651	TA	6	37553	37563	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_010651	TTTA	3	37795	37805	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_010651	TA	11	38229	38249	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_010651	TAAAA	3	38348	38362	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010651	TA	8	38519	38533	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
109	NC_010651	TTAAC	3	38913	38927	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
110	NC_010651	TGGAAT	3	39018	39035	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	18737314
111	NC_010651	TTAT	3	39611	39622	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_010651	TTA	4	39694	39704	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_010651	TAT	4	39893	39903	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_010651	ATA	4	39970	39981	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_010651	AAT	4	41563	41573	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_010651	TTTTAT	3	41959	41977	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
117	NC_010651	TAA	4	42373	42384	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_010651	AGT	4	46317	46327	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	18737314
119	NC_010651	TAGA	3	47086	47096	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	18737314
120	NC_010651	TAA	4	47287	47297	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	18737314
121	NC_010651	TAA	4	47605	47616	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18737314
122	NC_010651	TAC	4	48990	49000	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	18737314
123	NC_010651	ATA	4	50375	50387	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_010651	TTTATT	3	50406	50424	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
125	NC_010651	AT	7	50616	50628	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_010651	TA	6	50638	50649	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_010651	TA	6	50652	50662	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_010651	TCT	4	50832	50843	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
129	NC_010651	TA	6	50875	50885	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_010651	TA	7	51213	51225	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_010651	TA	7	51431	51443	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_010651	TAT	4	51814	51825	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_010651	TCT	4	52361	52371	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
134	NC_010651	A	12	52528	52539	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_010651	TTA	4	53052	53063	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_010651	CCTA	3	53163	53175	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
137	NC_010651	CCTT	3	53452	53463	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
138	NC_010651	TA	7	53464	53477	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
139	NC_010651	GA	6	53600	53611	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_010651	CAT	4	54739	54751	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	18737315
141	NC_010651	AAAG	3	54858	54869	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010651	TA	6	54946	54956	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
143	NC_010651	A	12	55486	55497	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
144	NC_010651	AATTA	3	55695	55708	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
145	NC_010651	TTAT	3	55723	55735	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
146	NC_010651	TAT	4	56123	56134	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18737315
147	NC_010651	ACT	4	56621	56632	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	18737315
148	NC_010651	C	13	56915	56927	13	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
149	NC_010651	TTTTA	3	56981	56994	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
150	NC_010651	TTA	4	57453	57464	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
151	NC_010651	AT	7	57469	57481	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
152	NC_010651	AT	6	57793	57803	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
153	NC_010651	CTT	4	57811	57822	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
154	NC_010651	CTA	4	58865	58875	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	18737315
155	NC_010651	TAT	4	58956	58968	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	18737315
156	NC_010651	CTTA	3	58975	58985	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	18737315
157	NC_010651	TTAT	3	59338	59350	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	18737315

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Tilletia walkeri mitochondrion