ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Sthenoteuthis oualaniensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010636	TAT	4	111	122	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	186920084
2	NC_010636	ATT	4	630	641	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	186920084
3	NC_010636	TTG	4	725	736	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	186920084
4	NC_010636	TAT	4	1032	1044	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	186920085
5	NC_010636	TATAA	3	1699	1712	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	186920086
6	NC_010636	TTTGC	3	2570	2583	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	186920086
7	NC_010636	AT	6	3069	3082	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	186920087
8	NC_010636	TATT	3	3959	3969	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	186920089
9	NC_010636	AATA	3	4556	4567	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	186920089
10	NC_010636	TAT	4	4576	4586	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_010636	TCAA	3	5127	5138	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
12	NC_010636	ATA	7	6180	6200	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_010636	TA	11	6192	6212	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_010636	TAT	4	6512	6523	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	186920090
15	NC_010636	ATT	4	7031	7042	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	186920090
16	NC_010636	TTG	4	7126	7137	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	186920090
17	NC_010636	ATA	4	7178	7188	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	186920090
18	NC_010636	TAT	4	8420	8433	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	186920091
19	NC_010636	TATAA	3	8721	8734	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	186920092
20	NC_010636	TTTGC	3	9592	9605	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	186920092
21	NC_010636	AT	6	10091	10104	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	186920093
22	NC_010636	TATT	3	10981	10991	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	186920095
23	NC_010636	TAT	4	12450	12461	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	186920096
24	NC_010636	AT	6	13590	13601	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	186920097
25	NC_010636	ATT	4	13804	13815	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	186920097
26	NC_010636	TA	6	14306	14316	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	186920097
27	NC_010636	AAAT	3	14425	14435	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	186920097
28	NC_010636	AAAG	3	16028	16038	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	215982787
29	NC_010636	TAA	4	16393	16405	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	186920100
30	NC_010636	AAAT	3	16556	16567	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	186920100
31	NC_010636	AT	6	16612	16623	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	186920100
32	NC_010636	CAAA	3	17081	17091	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	186920101
33	NC_010636	AAC	4	17280	17291	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	186920101
34	NC_010636	ATA	4	17498	17508	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	186920101
35	NC_010636	AAAAGC	3	17754	17772	19	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	10 %	186920101
36	NC_010636	ATA	4	17962	17972	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_010636	TAAA	3	18418	18428	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_010636	ATTT	3	19219	19231	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_010636	TAA	4	19657	19667	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_010636	ATA	7	20085	20105	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_010636	TA	11	20097	20117	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Sthenoteuthis oualaniensis mitochondrion