ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Guizotia abyssinica chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010601	TTTA	3	130	140	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_010601	TCT	4	793	803	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	183217721
3	NC_010601	AAGT	3	1163	1173	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	183217721
4	NC_010601	TAAA	3	1779	1790	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_010601	TCATT	3	1858	1871	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
6	NC_010601	AAAT	3	1937	1948	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010601	T	12	1951	1962	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010601	TTC	4	2152	2163	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	183217722
9	NC_010601	GAA	4	2957	2968	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	183217722
10	NC_010601	A	17	4391	4407	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
11	NC_010601	TAAA	3	4457	4467	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_010601	GATA	3	5010	5021	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_010601	TCTCT	3	5297	5310	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	183217723
14	NC_010601	TCAA	3	6604	6615	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_010601	ATA	4	6900	6912	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_010601	TAA	4	7304	7315	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_010601	TTCT	3	7772	7782	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	183217724
18	NC_010601	AAAT	3	8451	8462	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_010601	TTA	4	8644	8655	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_010601	A	15	9780	9794	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_010601	AAAT	3	10297	10308	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_010601	ATA	4	10519	10530	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_010601	TTCT	3	11068	11080	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
24	NC_010601	AAG	4	12408	12420	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_010601	A	14	12568	12581	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_010601	T	18	12791	12808	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010601	A	12	13482	13493	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	183217728
28	NC_010601	ATTC	3	16958	16968	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	270040421
29	NC_010601	TTTC	3	17167	17178	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	270040421
30	NC_010601	GGA	4	17487	17498	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	270040421
31	NC_010601	GAA	4	17534	17544	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	270040421
32	NC_010601	A	13	18540	18552	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	270040421
33	NC_010601	TA	6	18763	18774	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	270040421
34	NC_010601	AT	6	19764	19775	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	183217730
35	NC_010601	AACA	3	23760	23770	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	183217731
36	NC_010601	ATAA	3	24185	24196	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_010601	ACTT	3	24432	24442	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	183217732
38	NC_010601	GTT	5	24916	24930	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	183217732
39	NC_010601	AAAT	3	25519	25529	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_010601	ATCAA	3	25543	25556	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
41	NC_010601	TA	6	26774	26785	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_010601	TAT	4	28141	28152	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_010601	T	12	28149	28160	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010601	TGT	4	28396	28407	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	183217735
45	NC_010601	TAAA	3	29741	29753	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_010601	A	15	30297	30311	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_010601	TAAA	3	30790	30802	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_010601	TTTG	4	31117	31132	16	0 %	75 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_010601	AATA	3	31184	31195	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_010601	TAA	4	32079	32090	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_010601	ATTT	3	33091	33102	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	183217736
52	NC_010601	GAAA	3	33747	33758	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	183217737
53	NC_010601	GAG	4	33867	33877	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	183217737
54	NC_010601	TTC	4	34597	34608	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	183217737
55	NC_010601	AT	8	34804	34819	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_010601	AG	6	34954	34964	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_010601	AT	8	35151	35165	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_010601	TGTA	3	35282	35292	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_010601	TC	6	35542	35552	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	183217738
60	NC_010601	AAAT	3	35666	35676	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_010601	CTT	4	35703	35714	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
62	NC_010601	AT	8	35808	35822	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_010601	TAAAAT	3	35974	35992	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
64	NC_010601	GATC	3	36317	36327	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
65	NC_010601	AATT	3	38015	38025	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	183217740
66	NC_010601	ATG	4	38169	38179	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	183217740
67	NC_010601	AATG	3	39662	39673	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	183217741
68	NC_010601	GCA	4	40067	40078	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	183217741
69	NC_010601	TTTAT	3	42340	42355	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	183217742
70	NC_010601	CTTT	3	42836	42846	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	183217742
71	NC_010601	ATTT	3	43732	43743	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	183217742
72	NC_010601	A	12	44049	44060	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_010601	AGA	4	44595	44606	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_010601	AAT	4	44773	44783	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_010601	TATT	3	45863	45874	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_010601	T	18	46497	46514	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010601	A	16	46516	46531	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_010601	ATTTT	3	47963	47977	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_010601	TA	6	50187	50197	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_010601	TTA	4	50903	50914	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_010601	TTC	4	51364	51374	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
82	NC_010601	TAG	4	53828	53839	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	183217748
83	NC_010601	ATA	4	53856	53866	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_010601	TTG	4	54552	54563	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_010601	GGATAA	4	56022	56045	24	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	4 %	183217749
86	NC_010601	TA	6	56157	56168	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_010601	TTA	5	56378	56393	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_010601	TGAT	3	58217	58227	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_010601	GAA	4	58511	58521	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_010601	TAA	4	58617	58629	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_010601	TA	6	58672	58682	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_010601	ATA	4	58727	58738	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_010601	ATCT	3	58896	58908	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
94	NC_010601	TA	8	58908	58923	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_010601	AATA	3	60507	60517	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_010601	ATTG	3	61139	61149	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	183217753
97	NC_010601	AT	6	61612	61622	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	183217754
98	NC_010601	TTC	4	62410	62421	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	183217754
99	NC_010601	CTTT	4	62701	62716	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
100	NC_010601	TAT	5	63078	63091	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_010601	TTTG	3	63668	63679	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	183217756
102	NC_010601	TAAA	3	64950	64960	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_010601	AAGA	3	65998	66009	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_010601	ATA	4	66273	66284	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_010601	ATCT	3	66878	66889	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
106	NC_010601	TA	8	67287	67301	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
107	NC_010601	TATT	3	67345	67356	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010601	AAGA	3	67823	67834	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_010601	TGAA	3	68348	68359	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_010601	AATA	4	69744	69758	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	183217720
111	NC_010601	TTTA	3	69845	69856	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	183217720
112	NC_010601	ATTT	4	69944	69959	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	183217720
113	NC_010601	T	15	69953	69967	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	183217720
114	NC_010601	AAT	4	70030	70040	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	183217720
115	NC_010601	A	22	70563	70584	22	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	183217720
116	NC_010601	ATTG	3	70749	70760	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	183217720
117	NC_010601	CATAGT	3	71766	71782	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	183217720
118	NC_010601	CTTT	3	71813	71823	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	183217720
119	NC_010601	GGTT	3	72851	72862	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	183217720
120	NC_010601	TCT	4	73222	73233	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	183217720
121	NC_010601	TAAA	3	73647	73657	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	183217720
122	NC_010601	AAGT	3	74964	74974	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	183217720
123	NC_010601	AGAA	3	76454	76464	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	183217720
124	NC_010601	T	17	77535	77551	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	183217720
125	NC_010601	AATC	4	77653	77668	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	183217720
126	NC_010601	CTG	4	78257	78269	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	183217720
127	NC_010601	ATA	4	78326	78337	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	183217720
128	NC_010601	T	13	79959	79971	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	183217720
129	NC_010601	TATGAA	3	79983	80000	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	183217720
130	NC_010601	ATCA	3	81476	81487	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	183217720
131	NC_010601	TTCT	3	81757	81768	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	183217720
132	NC_010601	AT	6	81874	81884	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	183217720
133	NC_010601	TTAT	3	81945	81956	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	183217720
134	NC_010601	ATTT	3	82116	82126	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	183217720
135	NC_010601	CAAT	3	82241	82251	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	183217720
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183	NC_010601	CTTA	3	129107	129117	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	183217804
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Guizotia abyssinica chloroplast