ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Nephtys sp. 'San Juan Island' YV-2008 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010559	TTAT	3	584	595	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	172088178
2	NC_010559	TAT	4	2312	2322	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	172088180
3	NC_010559	TAA	4	2873	2884	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	172088180
4	NC_010559	TCA	4	2979	2993	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	172088180
5	NC_010559	TAA	4	3144	3155	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	172088180
6	NC_010559	TAT	5	3730	3743	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	172088180
7	NC_010559	TCTCC	4	4433	4453	21	0 %	40 %	0 %	60 %	9 %	172088182
8	NC_010559	CAA	4	4555	4567	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	172088182
9	NC_010559	TAT	4	4587	4599	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	172088182
10	NC_010559	TCT	4	4684	4695	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	172088182
11	NC_010559	AT	6	4736	4746	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	172088182
12	NC_010559	AATT	3	6110	6121	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_010559	AACT	3	6151	6162	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
14	NC_010559	TATAA	4	7299	7318	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_010559	TAT	7	8170	8190	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_010559	ATAATT	3	8193	8210	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_010559	TAATA	3	8265	8280	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_010559	TA	6	8294	8304	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_010559	TA	7	8323	8338	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_010559	TA	7	8340	8352	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_010559	AG	6	8370	8380	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_010559	TTC	4	10266	10277	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	172088184
23	NC_010559	CTT	4	10678	10688	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	172088185
24	NC_010559	AAT	4	11097	11108	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	172088185
25	NC_010559	ATT	4	11185	11196	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	172088185
26	NC_010559	TTC	5	12045	12058	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	172088186
27	NC_010559	GGA	4	12137	12147	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	172088186
28	NC_010559	AATT	3	12922	12933	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	172088186
29	NC_010559	AT	6	13536	13546	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	172088186
30	NC_010559	CTT	4	13557	13568	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	172088186
31	NC_010559	TTTATT	3	14680	14698	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	172088186
32	NC_010559	ATT	5	15112	15125	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	172088187
33	NC_010559	CTCTT	3	16521	16535	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	172088189

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Nephtys sp. 'San Juan Island' YV-2008 mitochondrion