ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Cryptomeria japonica chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010548	AT	11	3150	3170	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_010548	TA	6	6591	6601	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	172072877
3	NC_010548	AT	9	10964	10981	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
4	NC_010548	TA	6	11289	11299	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	172072882
5	NC_010548	AT	9	13417	13433	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	172072885
6	NC_010548	AT	6	14681	14692	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	172072886
7	NC_010548	AT	18	16342	16375	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	172072889
8	NC_010548	TA	7	18676	18689	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	172072891
9	NC_010548	AT	6	20628	20638	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	172072891
10	NC_010548	TA	6	23846	23856	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	172072891
11	NC_010548	TA	9	28181	28197	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	172072891
12	NC_010548	TA	6	28441	28452	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	172072891
13	NC_010548	TA	6	39970	39981	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	172072891
14	NC_010548	AT	11	46228	46248	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	172072891
15	NC_010548	AT	6	49981	49992	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	172072891
16	NC_010548	TA	6	58032	58042	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	172072891
17	NC_010548	AT	12	58616	58638	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	172072891
18	NC_010548	CT	6	58771	58781	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	172072891
19	NC_010548	AG	6	59547	59558	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	172072891
20	NC_010548	AT	6	62765	62776	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	172072891
21	NC_010548	TA	8	65460	65475	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	172072891
22	NC_010548	GA	6	72491	72502	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	172072891
23	NC_010548	TA	6	78616	78628	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	172072891
24	NC_010548	AT	7	78629	78643	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	172072891
25	NC_010548	TA	6	80704	80716	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	172072891
26	NC_010548	GA	6	82699	82710	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	172072891
27	NC_010548	TA	29	86596	86652	57	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	172072891
28	NC_010548	AT	6	96604	96615	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	172072891
29	NC_010548	TA	6	98115	98125	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	172072891
30	NC_010548	AT	8	98401	98416	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	172072891
31	NC_010548	TA	7	99827	99839	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	172072891
32	NC_010548	TG	6	105629	105640	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	172072891
33	NC_010548	AT	9	107900	107918	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	172072891
34	NC_010548	AT	11	108895	108918	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	172072891
35	NC_010548	GT	6	109537	109547	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	172072891
36	NC_010548	CT	6	113682	113693	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
37	NC_010548	AT	13	129956	129980	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_010548	AT	11	131402	131423	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_010548	AT	7	131568	131580	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Cryptomeria japonica chloroplast