ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Cryptomeria japonica chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010548	A	12	3134	3145	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010548	AT	9	3150	3167	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010548	AT	8	10964	10979	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010548	TCA	4	11258	11269	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172072882
5	NC_010548	AGT	4	14941	14952	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010548	T	13	15468	15480	13	0 %	100 %	0 %	0 %	172072888
7	NC_010548	AT	10	16343	16362	20	50 %	50 %	0 %	0 %	172072889
8	NC_010548	TA	6	18676	18687	12	50 %	50 %	0 %	0 %	172072891
9	NC_010548	T	19	20695	20713	19	0 %	100 %	0 %	0 %	172072891
10	NC_010548	T	13	24099	24111	13	0 %	100 %	0 %	0 %	172072891
11	NC_010548	A	12	24191	24202	12	100 %	0 %	0 %	0 %	172072891
12	NC_010548	TA	8	28181	28196	16	50 %	50 %	0 %	0 %	172072891
13	NC_010548	A	12	28247	28258	12	100 %	0 %	0 %	0 %	172072891
14	NC_010548	T	17	28386	28402	17	0 %	100 %	0 %	0 %	172072891
15	NC_010548	TATG	3	30358	30369	12	25 %	50 %	25 %	0 %	172072891
16	NC_010548	T	16	33965	33980	16	0 %	100 %	0 %	0 %	172072891
17	NC_010548	A	12	36652	36663	12	100 %	0 %	0 %	0 %	172072891
18	NC_010548	TCTA	3	36729	36740	12	25 %	50 %	0 %	25 %	172072891
19	NC_010548	ACAT	3	39985	39996	12	50 %	25 %	0 %	25 %	172072891
20	NC_010548	TTA	5	40456	40470	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172072891
21	NC_010548	TTGA	3	42718	42729	12	25 %	50 %	25 %	0 %	172072891
22	NC_010548	AAAG	3	44534	44545	12	75 %	0 %	25 %	0 %	172072891
23	NC_010548	T	13	45886	45898	13	0 %	100 %	0 %	0 %	172072891
24	NC_010548	AT	6	46229	46240	12	50 %	50 %	0 %	0 %	172072891
25	NC_010548	AT	10	58616	58635	20	50 %	50 %	0 %	0 %	172072891
26	NC_010548	TAAA	3	63714	63725	12	75 %	25 %	0 %	0 %	172072891
27	NC_010548	TA	7	65460	65473	14	50 %	50 %	0 %	0 %	172072891
28	NC_010548	AT	6	78629	78640	12	50 %	50 %	0 %	0 %	172072891
29	NC_010548	TAGA	3	79286	79297	12	50 %	25 %	25 %	0 %	172072891
30	NC_010548	A	12	82764	82775	12	100 %	0 %	0 %	0 %	172072891
31	NC_010548	TA	23	86601	86646	46	50 %	50 %	0 %	0 %	172072891
32	NC_010548	ATA	4	86910	86921	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172072891
33	NC_010548	T	13	92202	92214	13	0 %	100 %	0 %	0 %	172072891
34	NC_010548	A	12	94683	94694	12	100 %	0 %	0 %	0 %	172072891
35	NC_010548	T	12	95547	95558	12	0 %	100 %	0 %	0 %	172072891
36	NC_010548	TTTC	3	96322	96333	12	0 %	75 %	0 %	25 %	172072891
37	NC_010548	A	12	98580	98591	12	100 %	0 %	0 %	0 %	172072891
38	NC_010548	CTAC	3	101876	101887	12	25 %	25 %	0 %	50 %	172072891
39	NC_010548	AT	9	107900	107917	18	50 %	50 %	0 %	0 %	172072891
40	NC_010548	A	13	108485	108497	13	100 %	0 %	0 %	0 %	172072891
41	NC_010548	A	15	108746	108760	15	100 %	0 %	0 %	0 %	172072891
42	NC_010548	AT	10	108897	108916	20	50 %	50 %	0 %	0 %	172072891
43	NC_010548	T	13	109623	109635	13	0 %	100 %	0 %	0 %	172072891
44	NC_010548	A	15	111889	111903	15	100 %	0 %	0 %	0 %	260780630
45	NC_010548	TTTA	3	122307	122318	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010548	AT	9	131404	131421	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010548	CAAT	3	131679	131690	12	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Cryptomeria japonica chloroplast