Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cryptomeria japonica chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_010548TAA485961266.67 %33.33 %0 %0 %8 %172072869
2NC_010548TAT4788778981233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
3NC_010548CTT41058310594120 %66.67 %0 %33.33 %8 %172072880
4NC_010548TCA411258112691233.33 %33.33 %0 %33.33 %0 %172072882
5NC_010548ATA414275142861266.67 %33.33 %0 %0 %8 %172072886
6NC_010548AGT514941149541433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
7NC_010548TCT41567015680110 %66.67 %0 %33.33 %9 %172072888
8NC_010548CCT41715217162110 %33.33 %0 %66.67 %9 %172072889
9NC_010548CTT42016020170110 %66.67 %0 %33.33 %9 %172072891
10NC_010548AAG420398204081166.67 %0 %33.33 %0 %9 %172072891
11NC_010548ATC425989260001233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %172072891
12NC_010548GTT43547035480110 %66.67 %33.33 %0 %9 %172072891
13NC_010548AGG435920359301133.33 %0 %66.67 %0 %9 %172072891
14NC_010548TTA438599386101233.33 %66.67 %0 %0 %8 %172072891
15NC_010548ATT439950399601133.33 %66.67 %0 %0 %9 %172072891
16NC_010548TAT440273402831133.33 %66.67 %0 %0 %9 %172072891
17NC_010548TTA640456404731833.33 %66.67 %0 %0 %5 %172072891
18NC_010548GCT44130541316120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %172072891
19NC_010548ATA442035420461266.67 %33.33 %0 %0 %8 %172072891
20NC_010548ATC442782427921133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %172072891
21NC_010548ATG443870438811233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %172072891
22NC_010548AAT449130491421366.67 %33.33 %0 %0 %7 %172072891
23NC_010548CTG45903159042120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %172072891
24NC_010548ATT462422624331233.33 %66.67 %0 %0 %8 %172072891
25NC_010548TAT464288642981133.33 %66.67 %0 %0 %9 %172072891
26NC_010548TCA465543655531133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %172072891
27NC_010548AGA468920689311266.67 %0 %33.33 %0 %8 %172072891
28NC_010548GCT47686676877120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %172072891
29NC_010548ATT477460774701133.33 %66.67 %0 %0 %9 %172072891
30NC_010548ATA482742827541366.67 %33.33 %0 %0 %7 %172072891
31NC_010548TAA484859848691166.67 %33.33 %0 %0 %9 %172072891
32NC_010548GGA486442864531233.33 %0 %66.67 %0 %8 %172072891
33NC_010548ATA586910869231466.67 %33.33 %0 %0 %7 %172072891
34NC_010548TAA488319883291166.67 %33.33 %0 %0 %9 %172072891
35NC_010548CAG489441894511133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %172072891
36NC_010548GAA491247912571166.67 %0 %33.33 %0 %9 %172072891
37NC_010548GGA497600976101133.33 %0 %66.67 %0 %9 %172072891
38NC_010548AAT498488984981166.67 %33.33 %0 %0 %9 %172072891
39NC_010548CAA41038101038221366.67 %0 %0 %33.33 %7 %172072891
40NC_010548CTT4104780104792130 %66.67 %0 %33.33 %7 %172072891
41NC_010548TCT4105020105031120 %66.67 %0 %33.33 %8 %172072891
42NC_010548TAT41082791082901233.33 %66.67 %0 %0 %8 %172072891
43NC_010548GTA41092201092311233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %172072891
44NC_010548GAA41105231105331166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
45NC_010548TAT41136391136501233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
46NC_010548GAA41148301148411266.67 %0 %33.33 %0 %8 %172072948
47NC_010548AGA41197641197751266.67 %0 %33.33 %0 %8 %172072948
48NC_010548GAA41203861203971266.67 %0 %33.33 %0 %8 %172072948
49NC_010548ATA41215921216041366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
50NC_010548ATA41217641217761366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
51NC_010548TCA41228751228861233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %172072949
52NC_010548AGA41247481247591266.67 %0 %33.33 %0 %8 %172072949
53NC_010548AAG41267351267461266.67 %0 %33.33 %0 %8 %172072949
54NC_010548ATA41275371275481266.67 %33.33 %0 %0 %8 %172072949
55NC_010548AGA41280531280631166.67 %0 %33.33 %0 %9 %172072949
56NC_010548GAA41312181312301366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding