ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cryptopygus antarcticus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010533	TTTA	3	244	255	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	171473635
2	NC_010533	CTAT	3	804	816	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	171473635
3	NC_010533	ATTT	3	1051	1062	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	171473635
4	NC_010533	ATTT	3	2829	2839	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	171473636
5	NC_010533	GCC	4	2858	2868	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	171473636
6	NC_010533	AACT	3	3816	3827	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_010533	TCT	4	4036	4046	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	171473639
8	NC_010533	TAT	4	5561	5572	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	171473641
9	NC_010533	TTAA	3	5595	5607	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	171473641
10	NC_010533	TTTTA	3	5828	5843	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	171473641
11	NC_010533	AATAAA	3	6335	6353	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	171473642
12	NC_010533	TAA	4	6872	6882	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	171473642
13	NC_010533	TTA	4	7156	7167	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	171473642
14	NC_010533	ATTT	3	7600	7610	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	171473642
15	NC_010533	ATCA	3	8270	8281	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	171473643
16	NC_010533	AT	6	8443	8453	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	171473643
17	NC_010533	ATT	4	8495	8506	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	171473643
18	NC_010533	TAA	4	8684	8695	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	171473643
19	NC_010533	TAA	4	8930	8941	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	171473643
20	NC_010533	TCT	4	9244	9255	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	171473643
21	NC_010533	AT	6	9378	9388	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	171473643
22	NC_010533	TAAAAA	3	9408	9425	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	171473643
23	NC_010533	ATTA	3	9428	9438	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	171473643
24	NC_010533	AAAT	3	9681	9691	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	171473644
25	NC_010533	ATTTT	4	9988	10007	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	171473645
26	NC_010533	TAAAT	3	10075	10090	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	171473645
27	NC_010533	ACTAA	3	10180	10194	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	171473645
28	NC_010533	T	13	10660	10672	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	171473646
29	NC_010533	GCT	4	11267	11277	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	171473646
30	NC_010533	AAAAT	4	11741	11760	20	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	171473647
31	NC_010533	TAAA	3	13527	13538	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_010533	TAAA	3	13891	13902	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_010533	ATA	4	14440	14450	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_010533	TAAA	3	14571	14581	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_010533	AAAAT	3	14634	14647	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_010533	TA	11	14730	14750	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_010533	TA	18	14754	14788	35	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_010533	TAT	4	14793	14806	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_010533	AT	8	14805	14820	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_010533	TA	7	14826	14839	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_010533	T	14	14996	15009	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010533	TA	6	15087	15097	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_010533	TA	7	15102	15115	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cryptopygus antarcticus mitochondrion