ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Trigoniophthalmus alternatus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010532	TTA	4	1168	1178	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	171473586
2	NC_010532	TAA	4	1410	1420	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_010532	TAA	4	1768	1778	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	171473587
4	NC_010532	AATT	3	3014	3025	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	171473587
5	NC_010532	AATT	3	3064	3075	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_010532	AATT	3	3355	3366	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	171473588
7	NC_010532	AATT	3	3742	3753	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	171473588
8	NC_010532	ATA	4	3812	3822	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_010532	CTA	4	4635	4646	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	171473590
10	NC_010532	CCTA	3	4777	4787	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	171473591
11	NC_010532	ATT	4	4902	4912	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	171473591
12	NC_010532	TACTT	3	5271	5285	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	171473591
13	NC_010532	CAA	4	5858	5868	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	171473592
14	NC_010532	TAA	4	5967	5977	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	171473592
15	NC_010532	ATA	4	6766	6776	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	171473593
16	NC_010532	AATA	3	7088	7099	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	171473593
17	NC_010532	AAAC	3	7190	7200	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	171473593
18	NC_010532	TTCAAA	3	7412	7428	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	171473593
19	NC_010532	TAA	4	7902	7914	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	171473593
20	NC_010532	AAAC	3	8017	8029	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	171473593
21	NC_010532	AATT	3	8325	8336	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	171473594
22	NC_010532	AT	6	8436	8447	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	171473594
23	NC_010532	A	12	9160	9171	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	171473594
24	NC_010532	AAAG	3	9654	9665	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	171473595
25	NC_010532	TAA	4	9794	9804	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	171473595
26	NC_010532	TA	6	10071	10082	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	171473596
27	NC_010532	CTAT	3	10263	10274	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	171473596
28	NC_010532	CA	6	10910	10921	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	171473597
29	NC_010532	TTA	4	11182	11193	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	171473597
30	NC_010532	TCA	4	11288	11298	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	171473597
31	NC_010532	TAT	4	11309	11320	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	171473597
32	NC_010532	AATT	3	11842	11853	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	171473598
33	NC_010532	AAATA	3	11966	11980	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	171473598
34	NC_010532	AATT	3	12801	12812	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_010532	CAA	4	12818	12828	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
36	NC_010532	ATT	4	12830	12841	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_010532	AT	7	13092	13104	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_010532	ATTA	3	13629	13641	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_010532	AT	6	14402	14413	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_010532	TAAA	3	15049	15061	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_010532	TAAA	3	15266	15278	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_010532	TAAA	3	15483	15495	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_010532	ATTT	3	15730	15740	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_010532	AT	7	15827	15841	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_010532	AT	16	16063	16091	29	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Trigoniophthalmus alternatus mitochondrion