ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Tetranychus urticae mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010526	TTAA	3	244	254	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	171260058
2	NC_010526	GAG	4	659	670	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	0 %	171260058
3	NC_010526	GTTA	3	760	770	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	171260058
4	NC_010526	AT	8	1189	1203	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	171260058
5	NC_010526	TAA	4	1206	1217	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	171260058
6	NC_010526	TA	6	1329	1340	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	171260058
7	NC_010526	TAAA	4	1529	1545	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	171260058
8	NC_010526	ATAAAA	3	2288	2306	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
9	NC_010526	ATTT	3	2442	2453	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010526	AATA	3	2551	2562	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_010526	ATT	4	2755	2765	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_010526	A	12	3303	3314	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	171260060
13	NC_010526	TTAAA	3	3315	3328	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	171260060
14	NC_010526	TAA	4	3374	3385	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	171260060
15	NC_010526	TAAAA	4	3395	3413	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	171260060
16	NC_010526	TTAA	3	3532	3542	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_010526	TAA	4	3545	3555	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	171260061
18	NC_010526	TAT	4	3636	3647	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	171260061
19	NC_010526	A	12	3653	3664	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	171260061
20	NC_010526	AAAT	3	4039	4050	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	171260061
21	NC_010526	T	13	4107	4119	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	171260061
22	NC_010526	A	13	4202	4214	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	171260061
23	NC_010526	A	18	4425	4442	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	171260062
24	NC_010526	TAAAAT	3	4637	4654	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	171260062
25	NC_010526	A	13	4863	4875	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	171260062
26	NC_010526	A	14	4900	4913	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	171260062
27	NC_010526	TAAAAT	4	5037	5060	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	171260063
28	NC_010526	TCATT	3	5609	5622	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	171260064
29	NC_010526	AATTT	3	5908	5921	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_010526	ATTAA	3	5974	5988	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_010526	TAAA	3	5999	6011	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_010526	AAAATT	3	6069	6086	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_010526	A	12	6332	6343	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_010526	TAA	4	6363	6374	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_010526	GAAAA	3	6528	6543	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_010526	TAAA	3	6551	6562	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_010526	TAT	4	6759	6771	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	171260065
38	NC_010526	AAAT	3	6941	6952	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	171260065
39	NC_010526	AAAG	3	7113	7123	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	171260065
40	NC_010526	A	16	7143	7158	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	171260065
41	NC_010526	A	12	8544	8555	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	171260066
42	NC_010526	TTA	4	8581	8592	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	171260066
43	NC_010526	TTTA	3	8775	8786	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	171260067
44	NC_010526	AAT	4	8889	8900	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	171260067
45	NC_010526	ATTA	3	9027	9037	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	171260067
46	NC_010526	ATA	4	9109	9120	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	171260067
47	NC_010526	TA	6	9178	9189	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	171260068
48	NC_010526	ATT	4	9362	9372	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	171260068
49	NC_010526	TAA	4	9372	9383	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	171260068
50	NC_010526	TAT	4	9384	9395	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	171260068
51	NC_010526	T	12	9760	9771	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	171260068
52	NC_010526	T	12	9789	9800	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	171260068
53	NC_010526	AAT	4	9871	9882	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	171260068
54	NC_010526	AT	9	10118	10135	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	171260068
55	NC_010526	TTTC	3	10546	10556	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	171260069
56	NC_010526	T	13	10633	10645	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	171260069
57	NC_010526	TAA	4	10802	10812	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	171260069
58	NC_010526	GATT	3	10818	10829	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	171260069
59	NC_010526	T	13	11179	11191	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	171260069
60	NC_010526	ATA	4	11277	11289	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	171260069
61	NC_010526	ATTT	3	11462	11472	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	171260069
62	NC_010526	TA	6	11768	11778	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	171260069
63	NC_010526	TTTA	3	11851	11861	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	171260069
64	NC_010526	ATAA	3	11862	11872	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	171260069
65	NC_010526	AAT	4	12139	12150	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	171260070
66	NC_010526	TA	6	12205	12217	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	171260070
67	NC_010526	ATTT	3	12239	12250	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	171260070
68	NC_010526	AAT	4	12396	12407	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	171260070
69	NC_010526	AATTT	3	12740	12754	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	171260070
70	NC_010526	AAATT	3	12842	12857	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	171260070
71	NC_010526	AGAA	3	13051	13061	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Tetranychus urticae mitochondrion