ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phthonandria atrilineata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010522	AAT	4	533	545	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	170787329
2	NC_010522	AATT	3	693	704	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	170787329
3	NC_010522	AATT	3	788	798	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	170787329
4	NC_010522	T	16	887	902	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	170787329
5	NC_010522	TTAA	3	1044	1054	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	170787329
6	NC_010522	TAA	4	1345	1357	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_010522	ATA	4	1414	1425	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_010522	TAT	5	2055	2069	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	170787330
9	NC_010522	GGA	4	2147	2157	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	170787330
10	NC_010522	GAAA	3	2266	2276	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	170787330
11	NC_010522	TTTA	3	2720	2732	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	170787330
12	NC_010522	TTAA	3	3205	3215	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	170787331
13	NC_010522	ATT	4	3330	3340	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	170787331
14	NC_010522	TTAA	3	3364	3376	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	170787331
15	NC_010522	TAT	4	3951	3962	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	170787332
16	NC_010522	TAAA	3	4022	4032	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	170787332
17	NC_010522	TAATT	3	4100	4113	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	170787333
18	NC_010522	AATT	3	4418	4428	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	170787333
19	NC_010522	ATT	4	4896	4907	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	170787334
20	NC_010522	AATT	3	5532	5543	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	170787334
21	NC_010522	AAT	4	5625	5636	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	170787335
22	NC_010522	ATT	4	5647	5658	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	170787335
23	NC_010522	ATA	4	5668	5679	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	170787335
24	NC_010522	TAT	4	5904	5915	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	170787335
25	NC_010522	TAT	4	6378	6389	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	170787336
26	NC_010522	TAAA	3	6416	6427	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	170787336
27	NC_010522	TAA	4	6677	6687	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	170787336
28	NC_010522	ATA	5	6812	6826	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	170787336
29	NC_010522	ATA	5	7346	7360	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	170787336
30	NC_010522	AT	6	7549	7559	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	170787336
31	NC_010522	ATA	4	7812	7822	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	170787336
32	NC_010522	AAATAA	3	8052	8069	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	170787336
33	NC_010522	ATA	4	8458	8469	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	170787337
34	NC_010522	ATC	4	8470	8481	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	170787337
35	NC_010522	TA	6	8914	8924	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	170787337
36	NC_010522	TAAA	3	8993	9003	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	170787337
37	NC_010522	TAAA	3	9025	9036	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	170787337
38	NC_010522	AAAAT	3	9166	9179	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	170787337
39	NC_010522	TAA	4	9221	9231	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	170787337
40	NC_010522	AT	6	9356	9367	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	170787337
41	NC_010522	ATTTAT	4	9398	9421	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	170787337
42	NC_010522	TAA	4	9434	9445	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	170787337
43	NC_010522	TAT	4	9549	9562	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_010522	AAT	4	9706	9716	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	170787338
45	NC_010522	A	12	9717	9728	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	170787338
46	NC_010522	TA	8	9830	9845	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	170787338
47	NC_010522	AAAT	3	9896	9906	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_010522	ATT	5	10169	10183	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	170787339
49	NC_010522	TAT	4	10258	10271	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	170787339
50	NC_010522	ATTT	4	10284	10299	16	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	170787339
51	NC_010522	AAT	4	10383	10394	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	170787339
52	NC_010522	ATA	5	10431	10445	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	170787339
53	NC_010522	ATTT	5	10446	10465	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	170787339
54	NC_010522	AAAT	3	10533	10543	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	170787340
55	NC_010522	TAA	5	11111	11125	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	170787340
56	NC_010522	ATTT	3	11235	11245	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	170787340
57	NC_010522	TTAA	3	11257	11269	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	170787340
58	NC_010522	TTA	4	11580	11590	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	170787340
59	NC_010522	A	15	12365	12379	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	170787341
60	NC_010522	TAA	4	12404	12414	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	170787341
61	NC_010522	TTTA	3	13132	13143	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_010522	TA	16	13188	13218	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_010522	ATA	5	13213	13226	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_010522	TTAA	3	13522	13533	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010522	TAAA	3	13557	13568	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010522	AATTT	3	13629	13643	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_010522	ATTA	3	13788	13803	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_010522	TAT	4	14144	14155	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_010522	ATTT	3	14156	14167	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_010522	TTTTAA	3	14658	14676	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
71	NC_010522	TAATTT	3	14767	14784	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
72	NC_010522	ATA	4	14803	14813	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_010522	ATAA	4	14962	14977	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_010522	T	18	15064	15081	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010522	TAT	5	15095	15108	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_010522	TAT	8	15112	15135	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_010522	TAT	8	15139	15162	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_010522	TAT	4	15175	15186	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_010522	TAT	8	15192	15216	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_010522	TAT	5	15229	15243	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_010522	TAT	9	15247	15273	27	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_010522	TAT	9	15277	15303	27	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_010522	TAT	9	15307	15333	27	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_010522	TA	35	15402	15468	67	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Phthonandria atrilineata mitochondrion