Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Trachelium caeruleum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_010442GAA4301730281266.67 %0 %33.33 %0 %0 %170784723
2NC_010442TTC41214712158120 %66.67 %0 %33.33 %8 %170784728
3NC_010442ATC416055160651133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %170784730
4NC_010442ACG420181201911133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %170784735
5NC_010442TAT422106221171233.33 %66.67 %0 %0 %8 %170784739
6NC_010442AGA422811228221266.67 %0 %33.33 %0 %8 %170784739
7NC_010442TCT42419524205110 %66.67 %0 %33.33 %9 %170784740
8NC_010442AGA426940269521366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
9NC_010442GAA427202272131266.67 %0 %33.33 %0 %8 %170784745
10NC_010442CAA427837278471166.67 %0 %0 %33.33 %9 %170784745
11NC_010442GAA429159291701266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
12NC_010442GAA429174291851266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
13NC_010442GAA429189292001266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
14NC_010442GAA529222292361566.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
15NC_010442AGA429269292801266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
16NC_010442TCT43267632687120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
17NC_010442GAA532698327131666.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
18NC_010442ATA433253332651366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
19NC_010442AAT434604346151266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
20NC_010442AGA437100371111266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
21NC_010442AGA437128371391266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
22NC_010442CTT44893148941110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
23NC_010442GAA450494505051266.67 %0 %33.33 %0 %0 %170784763
24NC_010442CTC45122551235110 %33.33 %0 %66.67 %9 %170784763
25NC_010442TCT45304953061130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
26NC_010442TAC454022540321133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
27NC_010442TCA459867598771133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
28NC_010442ATA462517625291366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
29NC_010442TTA462819628301233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
30NC_010442ATA465139651501266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_010442TTA467506675171233.33 %66.67 %0 %0 %8 %170784773
32NC_010442TTC46935269363120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
33NC_010442GAA474617746281266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
34NC_010442AAC478190782011266.67 %0 %0 %33.33 %8 %170784778
35NC_010442AGA579650796631466.67 %0 %33.33 %0 %7 %170784778
36NC_010442TCT48318183191110 %66.67 %0 %33.33 %9 %170784779
37NC_010442GTT58710087114150 %66.67 %33.33 %0 %6 %170784781
38NC_010442ATT494775947851133.33 %66.67 %0 %0 %9 %170784802
39NC_010442TCG49601896029120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %170784802
40NC_010442AAG496898969081166.67 %0 %33.33 %0 %9 %170784802
41NC_010442GAA41098391098501266.67 %0 %33.33 %0 %8 %170784802
42NC_010442GAA41098541098651266.67 %0 %33.33 %0 %8 %170784802
43NC_010442GAA41098691098801266.67 %0 %33.33 %0 %8 %170784802
44NC_010442GAA51099021099161566.67 %0 %33.33 %0 %6 %170784802
45NC_010442AGA41099491099601266.67 %0 %33.33 %0 %8 %170784802
46NC_010442GAA41126131126241266.67 %0 %33.33 %0 %8 %170784802
47NC_010442AGA51168411168541466.67 %0 %33.33 %0 %7 %170784801
48NC_010442ATT41217031217141233.33 %66.67 %0 %0 %8 %170784801
49NC_010442AGA51250951251091566.67 %0 %33.33 %0 %6 %170784801
50NC_010442TAA41296311296411166.67 %33.33 %0 %0 %9 %170784801
51NC_010442TTA41302191302301233.33 %66.67 %0 %0 %8 %170784801
52NC_010442TTC5137308137322150 %66.67 %0 %33.33 %6 %170784801
53NC_010442TAA41407031407141266.67 %33.33 %0 %0 %8 %170784801
54NC_010442TCT5145564145577140 %66.67 %0 %33.33 %7 %170784801
55NC_010442CTT4149793149804120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
56NC_010442TAT41512751512871333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
57NC_010442TCT4152458152469120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
58NC_010442CTT4152507152518120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
59NC_010442CTT4152540152551120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
60NC_010442CTT4152555152566120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
61NC_010442CTT4152570152581120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding