ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Manihot esculenta chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_010433TTTTTA32382541716.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
2NC_010433TATAAA3915791731766.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
3NC_010433TATATT410403104252333.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_010433TATAGA311054110701750 %33.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
5NC_010433TAAAAA330230302471883.33 %16.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
6NC_010433ACTATA433893339172550 %33.33 %0 %16.67 %8 %Non-Coding
7NC_010433TGTAAT338716387341933.33 %50 %16.67 %0 %10 %Non-Coding
8NC_010433CATAGG346859468761833.33 %16.67 %33.33 %16.67 %5 %169794074
9NC_010433ATATTA453815538382450 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
10NC_010433TTATAT354049540671933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
11NC_010433AGTAAT460460604832450 %33.33 %16.67 %0 %8 %169794082
12NC_010433AATATA462722627442366.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
13NC_010433TTTTTG37600676022170 %83.33 %16.67 %0 %5 %169794097
14NC_010433ATAGAT382021820381850 %33.33 %16.67 %0 %0 %169794097
15NC_010433AAATAA385006850231883.33 %16.67 %0 %0 %5 %169794097
16NC_010433TTTTTA386924869421916.67 %83.33 %0 %0 %10 %169794097
17NC_010433TTATTT394022940391816.67 %83.33 %0 %0 %5 %169794097
18NC_010433TTTGTT3103162103180190 %83.33 %16.67 %0 %10 %169794097
19NC_010433CTTTTT3113936113954190 %83.33 %0 %16.67 %5 %169794131
20NC_010433AAAAAG31367551367731983.33 %0 %16.67 %0 %5 %169794131