ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Manihot esculenta chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_010433TCTCT353595372140 %60 %0 %40 %7 %169794055
2NC_010433GATAA3820382171560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
3NC_010433CAAAA413715137342080 %0 %0 %20 %10 %Non-Coding
4NC_010433TAAAA317392174061580 %20 %0 %0 %0 %Non-Coding
5NC_010433TAAAA318610186231480 %20 %0 %0 %7 %169794063
6NC_010433CTTTA331167311811520 %60 %0 %20 %0 %Non-Coding
7NC_010433AGAAA332514325281580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
8NC_010433ATTAT333026330401540 %60 %0 %0 %6 %Non-Coding
9NC_010433AAATC333313333271560 %20 %0 %20 %0 %Non-Coding
10NC_010433TTTCT34464844661140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
11NC_010433TTTTA450424504421920 %80 %0 %0 %10 %Non-Coding
12NC_010433TTATT355214552291620 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
13NC_010433ATTTT357351573651520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
14NC_010433TTATT369728697421520 %80 %0 %0 %0 %Non-Coding
15NC_010433TCCTT38533085345160 %60 %0 %40 %6 %169794097
16NC_010433ATATG391390914041540 %40 %20 %0 %6 %169794097
17NC_010433TCCGG3100165100179150 %20 %40 %40 %6 %169794097
18NC_010433ATTAA31187201187341560 %40 %0 %0 %0 %169794131
19NC_010433GAAAA31271611271751580 %0 %20 %0 %6 %169794131
20NC_010433TATTT31315711315841420 %80 %0 %0 %7 %169794131
21NC_010433ACCGG31505291505431520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
22NC_010433TATAA41507991508182060 %40 %0 %0 %10 %Non-Coding
23NC_010433CATAC31518971519101440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding
24NC_010433ATATA41614281614482160 %40 %0 %0 %4 %Non-Coding