ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Manihot esculenta chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010433	TA	6	4688	4699	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_010433	AT	9	4792	4809	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
3	NC_010433	TA	6	5150	5161	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_010433	TA	6	5508	5519	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	169794055
5	NC_010433	TA	6	7473	7483	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_010433	TA	6	9290	9300	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_010433	TA	8	10629	10643	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_010433	AT	6	11083	11094	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_010433	TA	8	14759	14773	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_010433	AT	6	16119	16129	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	169794061
11	NC_010433	CT	6	17163	17174	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
12	NC_010433	AT	6	20827	20837	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	169794063
13	NC_010433	AT	6	34450	34461	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_010433	TA	6	34486	34496	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_010433	AG	6	37984	37994	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_010433	TC	6	38542	38552	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	169794070
17	NC_010433	TG	6	43381	43391	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	169794073
18	NC_010433	TA	9	45704	45721	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	169794074
19	NC_010433	AT	6	53150	53160	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	169794078
20	NC_010433	TA	6	53425	53436	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_010433	TA	16	53685	53715	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_010433	TA	12	53776	53800	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_010433	TA	6	53814	53826	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_010433	TA	7	54093	54106	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_010433	TA	7	54155	54168	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_010433	AT	7	62362	62375	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_010433	AT	6	62562	62572	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_010433	TA	6	64060	64071	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_010433	TA	6	65626	65637	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_010433	AT	6	65857	65867	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	169794086
31	NC_010433	AT	6	67554	67564	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_010433	TA	6	71707	71717	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_010433	AT	7	72423	72436	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_010433	AT	6	84640	84651	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	169794097
35	NC_010433	TA	7	86911	86923	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	169794097
36	NC_010433	AT	13	86981	87006	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	169794097
37	NC_010433	AT	6	87603	87613	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	169794097
38	NC_010433	AT	6	88371	88381	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	169794097
39	NC_010433	AT	8	88703	88717	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	169794097
40	NC_010433	AT	6	100023	100034	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	169794097
41	NC_010433	AT	6	116713	116724	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	169794131
42	NC_010433	AT	6	123393	123403	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	169794131
43	NC_010433	CT	6	129078	129089	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	169794131
44	NC_010433	AT	7	130330	130342	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	169794131
45	NC_010433	AT	7	134000	134013	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	169794131
46	NC_010433	AT	6	150677	150688	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Manihot esculenta chloroplast