ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Manihot esculenta chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010433	C	12	4360	4371	12	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_010433	TTTATA	3	10406	10423	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010433	TA	6	10629	10640	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010433	TAA	4	10781	10792	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010433	T	18	12784	12801	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010433	A	15	12803	12817	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010433	T	15	13544	13558	15	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010433	TA	6	14759	14770	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010433	TAAA	3	15080	15091	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010433	T	13	15239	15251	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010433	GAAA	3	16187	16198	12	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010433	TAAAA	3	17392	17406	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010433	T	14	19451	19464	14	0 %	100 %	0 %	0 %	169794063
14	NC_010433	T	12	27183	27194	12	0 %	100 %	0 %	0 %	169794065
15	NC_010433	A	13	30237	30249	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010433	CTTTA	3	31167	31181	15	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010433	AAATC	3	33313	33327	15	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010433	A	13	38750	38762	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010433	ATA	4	38960	38971	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010433	TAAT	3	39335	39346	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010433	A	12	40029	40040	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010433	TAT	4	51316	51327	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010433	T	12	52771	52782	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010433	TA	7	53690	53703	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010433	AGTAAT	3	60460	60477	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	169794082
26	NC_010433	ATG	4	61061	61072	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169794082
27	NC_010433	ATG	4	61139	61150	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169794082
28	NC_010433	C	18	63211	63228	18	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_010433	TTATT	3	69728	69742	15	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010433	A	14	70053	70066	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010433	ATAA	3	72317	72328	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010433	AT	6	72423	72434	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010433	A	12	72888	72899	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010433	A	13	72975	72987	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010433	ATAGAT	3	82021	82038	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	169794097
36	NC_010433	T	12	85601	85612	12	0 %	100 %	0 %	0 %	169794097
37	NC_010433	A	12	86801	86812	12	100 %	0 %	0 %	0 %	169794097
38	NC_010433	AT	6	86982	86993	12	50 %	50 %	0 %	0 %	169794097
39	NC_010433	AT	6	86995	87006	12	50 %	50 %	0 %	0 %	169794097
40	NC_010433	TTTC	3	87481	87492	12	0 %	75 %	0 %	25 %	169794097
41	NC_010433	AT	7	88703	88716	14	50 %	50 %	0 %	0 %	169794097
42	NC_010433	T	14	89477	89490	14	0 %	100 %	0 %	0 %	169794097
43	NC_010433	G	13	109702	109714	13	0 %	0 %	100 %	0 %	169794131
44	NC_010433	A	12	113550	113561	12	100 %	0 %	0 %	0 %	169794131
45	NC_010433	ATTAA	3	118720	118734	15	60 %	40 %	0 %	0 %	169794131
46	NC_010433	TTTG	3	119836	119847	12	0 %	75 %	25 %	0 %	169794131
47	NC_010433	A	13	120272	120284	13	100 %	0 %	0 %	0 %	169794131
48	NC_010433	TCAA	3	125379	125390	12	50 %	25 %	0 %	25 %	169794131
49	NC_010433	AT	6	130330	130341	12	50 %	50 %	0 %	0 %	169794131
50	NC_010433	TCT	6	133568	133585	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169794131
51	NC_010433	TCT	6	133595	133612	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169794131
52	NC_010433	A	14	133759	133772	14	100 %	0 %	0 %	0 %	169794131
53	NC_010433	T	12	137148	137159	12	0 %	100 %	0 %	0 %	169794131
54	NC_010433	C	13	140995	141007	13	0 %	0 %	0 %	100 %	169794131
55	NC_010433	A	14	161219	161232	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Manihot esculenta chloroplast