Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Manihot esculenta chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_010433CTA479891133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
2NC_010433CAG4105510661233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %169794053
3NC_010433CTT455815591110 %66.67 %0 %33.33 %9 %169794055
4NC_010433TAT5905990741633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
5NC_010433TAT4908490941133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
6NC_010433ATT410428104401333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
7NC_010433TAT410458104701333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
8NC_010433AAT410704107141166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
9NC_010433TAA910777108042866.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
10NC_010433ATA410810108221366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
11NC_010433TTA411161111721233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
12NC_010433TTC41130711318120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169794058
13NC_010433GTT41298612998130 %66.67 %33.33 %0 %7 %169794059
14NC_010433TAA413647136581266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
15NC_010433ATA414775147861266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
16NC_010433TTC41486814878110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
17NC_010433GTT42456224573120 %66.67 %33.33 %0 %8 %169794064
18NC_010433TTA435584355951233.33 %66.67 %0 %0 %8 %169794068
19NC_010433GGA436980369911233.33 %0 %66.67 %0 %8 %171259285
20NC_010433ATA438943389531166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
21NC_010433ATA538958389711466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
22NC_010433ATA438985389951166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
23NC_010433TAA738999390192166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
24NC_010433ATA439041390511166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_010433TAA439107391171166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
26NC_010433GCA443344433551233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %169794073
27NC_010433TAT851316513402533.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
28NC_010433ATA451362513721166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
29NC_010433CAA453269532791166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
30NC_010433TAT553760537731433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
31NC_010433TAT453912539241333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
32NC_010433ATT754133541522033.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
33NC_010433ATA757310573312266.67 %33.33 %0 %0 %9 %169794080
34NC_010433TTG45801758027110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
35NC_010433ATG461019610301233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %169794082
36NC_010433ATG461040610511233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %169794082
37NC_010433ATG561058610721533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %169794082
38NC_010433ATG461118611291233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %169794082
39NC_010433ATG561136611501533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %169794082
40NC_010433ATA462763627741266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
41NC_010433TAT467159671691133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
42NC_010433TAA467237672471166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
43NC_010433TAT467772677831233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
44NC_010433TAA471205712151166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
45NC_010433TAT471790718021333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
46NC_010433TAA472409724201266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
47NC_010433TAA474595746051166.67 %33.33 %0 %0 %9 %169794097
48NC_010433ATA474945749571366.67 %33.33 %0 %0 %7 %169794097
49NC_010433ATT477122771331233.33 %66.67 %0 %0 %8 %169794097
50NC_010433TCT48318183192120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169794097
51NC_010433CTT48957689587120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169794097
52NC_010433GAT490044900541133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %169794097
53NC_010433GAT491433914431133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %169794097
54NC_010433GAT494480944911233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %169794097
55NC_010433TCT4105678105689120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169794131
56NC_010433GAA51149771149911566.67 %0 %33.33 %0 %6 %169794131
57NC_010433TTA41187971188091333.33 %66.67 %0 %0 %7 %169794131
58NC_010433ATT41199271199371133.33 %66.67 %0 %0 %9 %169794131
59NC_010433TAT41203941204051233.33 %66.67 %0 %0 %8 %169794131
60NC_010433AAT41247341247451266.67 %33.33 %0 %0 %8 %169794131
61NC_010433TTC5126472126486150 %66.67 %0 %33.33 %6 %169794131
62NC_010433TAA41299401299511266.67 %33.33 %0 %0 %8 %169794131
63NC_010433TTC4131182131193120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169794131
64NC_010433TTG4132233132244120 %66.67 %33.33 %0 %8 %169794131
65NC_010433AAC41322471322581266.67 %0 %0 %33.33 %8 %169794131
66NC_010433ATT41327751327861233.33 %66.67 %0 %0 %8 %169794131
67NC_010433ATT41333821333931233.33 %66.67 %0 %0 %8 %169794131
68NC_010433TCT6133568133585180 %66.67 %0 %33.33 %0 %169794131
69NC_010433TCT6133595133612180 %66.67 %0 %33.33 %0 %169794131
70NC_010433GAA41350141350251266.67 %0 %33.33 %0 %8 %169794131
71NC_010433TTC6135714135732190 %66.67 %0 %33.33 %10 %169794131
72NC_010433TCA41363851363951133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %169794131
73NC_010433AGA41450201450311266.67 %0 %33.33 %0 %8 %169794131
74NC_010433CTT4152794152805120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
75NC_010433ACC41547421547521133.33 %0 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
76NC_010433ATC41562181562291233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
77NC_010433ATC41592661592761133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
78NC_010433ATC41606551606651133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %169794135
79NC_010433GAA51611211611351566.67 %0 %33.33 %0 %6 %169794135