ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Haemonchus contortus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010383	ATT	4	2027	2037	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	169160119
2	NC_010383	CGT	4	2378	2389	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	169160119
3	NC_010383	ATA	5	2625	2638	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_010383	ATA	4	2809	2819	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_010383	ATA	4	2966	2977	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_010383	ATT	5	4138	4151	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	195972421
7	NC_010383	AAT	4	4403	4414	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	195972421
8	NC_010383	ATT	4	5659	5669	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_010383	ATA	4	5764	5774	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_010383	TAT	4	5827	5837	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_010383	ATA	4	6014	6025	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_010383	ATT	5	6037	6051	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_010383	GTT	4	6658	6669	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	169160122
14	NC_010383	ATA	4	7134	7144	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_010383	TAT	4	8490	8502	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	195972423
16	NC_010383	ATA	6	8769	8785	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	195972423
17	NC_010383	TTG	4	9028	9038	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	169160125
18	NC_010383	TAA	4	9866	9877	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	169160126
19	NC_010383	TAA	4	10413	10424	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	169160126
20	NC_010383	ATA	4	10741	10752	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_010383	TAA	4	11315	11326	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	169160127
22	NC_010383	ATT	4	11812	11823	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	169160127
23	NC_010383	ATA	5	11821	11835	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	169160127
24	NC_010383	ATT	4	12313	12323	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	195972424
25	NC_010383	ATA	8	12809	12832	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	195972425
26	NC_010383	ATA	4	13011	13021	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	195972425
27	NC_010383	TAT	4	13515	13526	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	195972425
28	NC_010383	TAA	4	13566	13577	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	195972425
29	NC_010383	TAT	4	13765	13776	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	195972425
30	NC_010383	ATT	4	13837	13847	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	195972425
31	NC_010383	ATA	5	13896	13910	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	195972425

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Haemonchus contortus mitochondrion