ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Oenothera parviflora chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_010362GAAC31091191150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
2NC_010362CAG49589691233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %169143011
3NC_010362AAGT3106410741150 %25 %25 %0 %9 %169143011
4NC_010362AT6156715771150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
5NC_010362TACTCT3178117971716.67 %50 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
6NC_010362GAA4276427751266.67 %0 %33.33 %0 %8 %169143012
7NC_010362TCTTTC330323048170 %66.67 %0 %33.33 %5 %169143012
8NC_010362A193725374319100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
9NC_010362A124418442912100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
10NC_010362TAA4472847391266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
11NC_010362CT648314841110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
12NC_010362TTTA3500750171125 %75 %0 %0 %9 %169143013
13NC_010362TCTCT350475060140 %60 %0 %40 %7 %169143013
14NC_010362T1457085721140 %100 %0 %0 %0 %169143013
15NC_010362TTA4578857991233.33 %66.67 %0 %0 %8 %169143013
16NC_010362CCAT3654065511225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
17NC_010362CCAT3672667371225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
18NC_010362AAAG3884488551275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
19NC_010362AGA411288112981166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
20NC_010362ATC411472114821133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
21NC_010362AAGA312125121351175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
22NC_010362A18121831220018100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
23NC_010362TTG41352413534110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
24NC_010362CAATT313559135721440 %40 %0 %20 %7 %Non-Coding
25NC_010362ATA415752157621166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
26NC_010362AGG415770157801133.33 %0 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
27NC_010362AAAAG315804158181580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
28NC_010362A14161751618814100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
29NC_010362AACAA416384164021980 %0 %0 %20 %10 %Non-Coding
30NC_010362T131688516897130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
31NC_010362TTTA317550175611225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
32NC_010362TA617709177191150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
33NC_010362TCTA317889178991125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
34NC_010362C121826618277120 %0 %0 %100 %0 %Non-Coding
35NC_010362AATGA319786198001560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
36NC_010362CA620027200371150 %0 %0 %50 %9 %Non-Coding
37NC_010362ATT420526205371233.33 %66.67 %0 %0 %8 %169143021
38NC_010362AAAG320582205921175 %0 %25 %0 %9 %169143021
39NC_010362T172242022436170 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
40NC_010362AT622663226741250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
41NC_010362TTCA322808228191225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
42NC_010362AATA322935229461275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
43NC_010362TACT328616286271225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
44NC_010362TCATT328872288851420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
45NC_010362AG628911289211150 %0 %50 %0 %9 %169143025
46NC_010362TAA429165291751166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
47NC_010362CT62952729537110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
48NC_010362CTTTTT42964629669240 %83.33 %0 %16.67 %8 %Non-Coding
49NC_010362CTG42981629827120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %169143026
50NC_010362AAGC330310303201150 %0 %25 %25 %9 %169143026
51NC_010362AATC332428324381150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
52NC_010362TCAATA332932329501950 %33.33 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
53NC_010362AT632983329941250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
54NC_010362A15330363305015100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
55NC_010362T163328733302160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
56NC_010362A27341973422327100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
57NC_010362TTTTC43527635295200 %80 %0 %20 %5 %Non-Coding
58NC_010362TAAAAA336681366991983.33 %16.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
59NC_010362TTTCT33714237156150 %80 %0 %20 %0 %Non-Coding
60NC_010362ATT438692387031233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
61NC_010362AT639310393201150 %50 %0 %0 %9 %169143030
62NC_010362TATC339466394761125 %50 %0 %25 %9 %169143030
63NC_010362TAGG341412414221125 %25 %50 %0 %9 %169143030
64NC_010362AAC442346423571266.67 %0 %0 %33.33 %8 %169143031
65NC_010362ATTT343245432551125 %75 %0 %0 %9 %169143031
66NC_010362TA644680446901150 %50 %0 %0 %9 %169143031
67NC_010362AT646010460211250 %50 %0 %0 %8 %169143032
68NC_010362AAAAG349412494251480 %0 %20 %0 %7 %169143032
69NC_010362T144959249605140 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
70NC_010362GTT55116051174150 %66.67 %33.33 %0 %6 %169143034
71NC_010362AAG751624516452266.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
72NC_010362AGTT352131521411125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
73NC_010362ATTT352212522231225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
74NC_010362A25528195284325100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
75NC_010362A16537695378416100 %0 %0 %0 %6 %169143036
76NC_010362TGT45458554596120 %66.67 %33.33 %0 %8 %169143037
77NC_010362TCT45473754747110 %66.67 %0 %33.33 %9 %169143037
78NC_010362AGAC354882548931250 %0 %25 %25 %0 %169143037
79NC_010362A15567785679215100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
80NC_010362TAT456910569201133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
81NC_010362CTTT35696156972120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
82NC_010362AAAT557416574341975 %25 %0 %0 %10 %Non-Coding
83NC_010362TAA457607576181266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
84NC_010362TA757882578941350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
85NC_010362A14584865849914100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
86NC_010362ATA459075590851166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
87NC_010362T135949559507130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
88NC_010362A21601486016821100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
89NC_010362GAT461411614221233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
90NC_010362ATA461511615221266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
91NC_010362TAATTA362854628721950 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
92NC_010362GATC364254642661325 %25 %25 %25 %7 %169143042
93NC_010362T126498464995120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
94NC_010362A15653596537315100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
95NC_010362AT666290663001150 %50 %0 %0 %9 %169143044
96NC_010362TCT46727667288130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
97NC_010362T146938169394140 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
98NC_010362AGT569415694291533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
99NC_010362AAAT369484694951275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
100NC_010362A15695076952115100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
101NC_010362TGAT369693697041225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
102NC_010362ATTA370256702671250 %50 %0 %0 %0 %169143050
103NC_010362AT770839708511350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
104NC_010362AT770888709001350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
105NC_010362AT870933709471550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
106NC_010362ATT471682716931233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
107NC_010362TTTC37177471785120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
108NC_010362ACAA372027720381275 %0 %0 %25 %8 %169143052
109NC_010362A12726237263412100 %0 %0 %0 %0 %169143053
110NC_010362TGAA373272732831250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
111NC_010362T137343273444130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
112NC_010362AAGA375039750501275 %0 %25 %0 %8 %169143094
113NC_010362GTC47518075190110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %169143094
114NC_010362TCT47711177122120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169143094
115NC_010362T147728077293140 %100 %0 %0 %7 %169143094
116NC_010362AT678314783261350 %50 %0 %0 %7 %169143094
117NC_010362GTTT37887578885110 %75 %25 %0 %9 %169143094
118NC_010362ATTCA381123811371540 %40 %0 %20 %6 %169143094
119NC_010362ACGTAA482720827432450 %16.67 %16.67 %16.67 %0 %169143094
120NC_010362TAAATT383605836221850 %50 %0 %0 %5 %169143094
121NC_010362TCCTT38364183656160 %60 %0 %40 %6 %169143094
122NC_010362A18845678458418100 %0 %0 %0 %5 %169143094
123NC_010362A23845958461723100 %0 %0 %0 %8 %169143094
124NC_010362CTTT38464484654110 %75 %0 %25 %9 %169143094
125NC_010362TTCT38526985280120 %75 %0 %25 %8 %169143094
126NC_010362AT685297853081250 %50 %0 %0 %8 %169143094
127NC_010362GAAT385507855181250 %25 %25 %0 %8 %169143094
128NC_010362TTCT38584585856120 %75 %0 %25 %0 %169143094
129NC_010362ACTA387183871931150 %25 %0 %25 %9 %169143094
130NC_010362AT687364873751250 %50 %0 %0 %8 %169143094
131NC_010362TTTTC38740487417140 %80 %0 %20 %7 %169143094
132NC_010362CTT48796287973120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169143094
133NC_010362ATATG389759897731540 %40 %20 %0 %6 %169143094
134NC_010362AT689775897851150 %50 %0 %0 %9 %169143094
135NC_010362GAT489825898351133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %169143094
136NC_010362TTCT49123591249150 %75 %0 %25 %6 %169143094
137NC_010362ATCG391883918951325 %25 %25 %25 %7 %169143094
138NC_010362CGTT39233592346120 %50 %25 %25 %8 %169143094
139NC_010362CTTT39238492394110 %75 %0 %25 %9 %169143094
140NC_010362TGG49410894118110 %33.33 %66.67 %0 %9 %169143094
141NC_010362ACA495385953961266.67 %0 %0 %33.33 %0 %169143094
142NC_010362GAC896442964652433.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %169143094
143NC_010362GAAGAG396718967351850 %0 %50 %0 %5 %169143094
144NC_010362GAGGAA896763968104850 %0 %50 %0 %8 %169143094
145NC_010362GAGGAA796814968554250 %0 %50 %0 %9 %169143094
146NC_010362GAA496922969331266.67 %0 %33.33 %0 %8 %169143094
147NC_010362CTT59705497068150 %66.67 %0 %33.33 %6 %169143094
148NC_010362AAG497123971351366.67 %0 %33.33 %0 %7 %169143094
149NC_010362AGAT398887988971150 %25 %25 %0 %9 %169143094
150NC_010362TTTC39915599166120 %75 %0 %25 %8 %169143094
151NC_010362TTC4103247103258120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169143055
152NC_010362T13103274103286130 %100 %0 %0 %0 %169143055
153NC_010362ACG41067541067651233.33 %0 %33.33 %33.33 %0 %169143055
154NC_010362ACG61069801069961733.33 %0 %33.33 %33.33 %5 %169143055
155NC_010362ATCC31074901075011225 %25 %0 %50 %8 %169143055
156NC_010362TCTA31078851078961225 %50 %0 %25 %8 %169143055
157NC_010362AAGG31080241080341150 %0 %50 %0 %9 %169143055
158NC_010362GAGG31107611107721225 %0 %75 %0 %8 %169143055
159NC_010362AGGT31109731109841225 %25 %50 %0 %8 %169143055
160NC_010362TAAG31120931121031150 %25 %25 %0 %9 %169143055
161NC_010362ATT41147101147221333.33 %66.67 %0 %0 %7 %169143055
162NC_010362AAG41153671153781266.67 %0 %33.33 %0 %8 %169143055
163NC_010362AAAT31155411155511175 %25 %0 %0 %9 %169143055
164NC_010362ATAG31160401160511250 %25 %25 %0 %8 %169143055
165NC_010362TAA51163141163281566.67 %33.33 %0 %0 %6 %169143055
166NC_010362TA81164161164301550 %50 %0 %0 %6 %169143055
167NC_010362TA91164331164491750 %50 %0 %0 %5 %169143055
168NC_010362T23116670116692230 %100 %0 %0 %4 %169143055
169NC_010362A1711735811737417100 %0 %0 %0 %5 %169143055
170NC_010362ACTA31175031175131150 %25 %0 %25 %9 %169143055
171NC_010362C12117785117796120 %0 %0 %100 %0 %169143055
172NC_010362AT111189031189232150 %50 %0 %0 %9 %169143055
173NC_010362AGT41190161190261133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %169143055
174NC_010362TTA41190811190921233.33 %66.67 %0 %0 %8 %169143055
175NC_010362TCTT3119221119231110 %75 %0 %25 %9 %169143055
176NC_010362AAT41195381195491266.67 %33.33 %0 %0 %8 %169143055
177NC_010362AAGA31196971197081275 %0 %25 %0 %8 %169143055
178NC_010362AT121208051208272350 %50 %0 %0 %8 %169143055
179NC_010362ATGA31212281212391250 %25 %25 %0 %8 %169143055
180NC_010362TGAAA31218471218611560 %20 %20 %0 %6 %169143055
181NC_010362A2412273412275724100 %0 %0 %0 %8 %169143055
182NC_010362CTTT3123374123385120 %75 %0 %25 %8 %169143055
183NC_010362TTC5123811123825150 %66.67 %0 %33.33 %6 %169143055
184NC_010362AT71241181241301350 %50 %0 %0 %7 %169143055
185NC_010362AATC31247891248001250 %25 %0 %25 %8 %169143055
186NC_010362CTTT3127140127150110 %75 %0 %25 %9 %169143055
187NC_010362T12127196127207120 %100 %0 %0 %8 %169143055
188NC_010362TTTTCT3128382128399180 %83.33 %0 %16.67 %5 %169143055
189NC_010362TCT4128413128424120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169143055
190NC_010362T12128600128611120 %100 %0 %0 %0 %169143055
191NC_010362CATTTT31288851289021816.67 %66.67 %0 %16.67 %0 %169143055
192NC_010362ATAC31294661294771250 %25 %0 %25 %0 %169143055
193NC_010362TTTC3129622129632110 %75 %0 %25 %9 %169143055
194NC_010362T15130114130128150 %100 %0 %0 %6 %169143055
195NC_010362TCTT3130448130459120 %75 %0 %25 %0 %169143055
196NC_010362TCT4132014132024110 %66.67 %0 %33.33 %9 %169143055
197NC_010362T12132707132718120 %100 %0 %0 %8 %169143055
198NC_010362T14132763132776140 %100 %0 %0 %7 %169143055
199NC_010362TCTTTA41348721348942316.67 %66.67 %0 %16.67 %8 %169143055
200NC_010362TCTA31350461350571225 %50 %0 %25 %8 %169143055
201NC_010362ATA41355291355401266.67 %33.33 %0 %0 %8 %169143055
202NC_010362ATTT31355471355571125 %75 %0 %0 %9 %169143055
203NC_010362CATT31359681359781125 %50 %0 %25 %9 %169143055
204NC_010362AAT41363761363881366.67 %33.33 %0 %0 %7 %169143055
205NC_010362TTC4137147137158120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169143055
206NC_010362TAA41384111384221266.67 %33.33 %0 %0 %8 %169143055
207NC_010362CTTA31389951390051125 %50 %0 %25 %9 %169143055
208NC_010362GGAT31435971436081225 %25 %50 %0 %8 %169143055
209NC_010362GTC4144108144119120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %169143055
210NC_010362TCG4144192144202110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %169143055
211NC_010362TCG5144332144345140 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %169143055
212NC_010362A1614781214782716100 %0 %0 %0 %6 %169143055
213NC_010362GAA41478401478511266.67 %0 %33.33 %0 %8 %169143055
214NC_010362GAAA31519321519431275 %0 %25 %0 %8 %169143090
215NC_010362CATAC31535371535501440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding
216NC_010362CTT4153963153975130 %66.67 %0 %33.33 %7 %169143091
217NC_010362AAG51540301540441566.67 %0 %33.33 %0 %6 %169143091
218NC_010362TCCTCT7154244154285420 %50 %0 %50 %9 %169143091
219NC_010362TCCTCT8154289154336480 %50 %0 %50 %8 %169143091
220NC_010362CTCTTC3154363154380180 %50 %0 %50 %5 %169143091
221NC_010362TCG7154634154654210 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %169143091
222NC_010362TGT4155702155713120 %66.67 %33.33 %0 %0 %169143091
223NC_010362CGAT31569121569241325 %25 %25 %25 %7 %169143091
224NC_010362CCA41569801569901133.33 %0 %0 %66.67 %9 %169143091
225NC_010362AAAG31587041587141175 %0 %25 %0 %9 %169143091
226NC_010362AACG31587521587631250 %0 %25 %25 %8 %169143091
227NC_010362CGAT31592031592151325 %25 %25 %25 %7 %169143091
228NC_010362AATGA31610011610151560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
229NC_010362ATC41612631612731133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
230NC_010362AT61613131613231150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
231NC_010362GAA51631241631381566.67 %0 %33.33 %0 %6 %169143093