ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Oenothera biennis chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_010361GAAC31091191150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
2NC_010361CAG49589691233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %169142925
3NC_010361AAGT3106410741150 %25 %25 %0 %9 %169142925
4NC_010361AT6156715771150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
5NC_010361GAA4276327741266.67 %0 %33.33 %0 %8 %169142926
6NC_010361TCTTTC330313047170 %66.67 %0 %33.33 %5 %169142926
7NC_010361A123724373512100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
8NC_010361A124410442112100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
9NC_010361TAA4475447651266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
10NC_010361CT648574867110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
11NC_010361TTTA3489049011225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
12NC_010361TTTA3505750671125 %75 %0 %0 %9 %169142927
13NC_010361TCTCT350975110140 %60 %0 %40 %7 %169142927
14NC_010361T1257115722120 %100 %0 %0 %0 %169142927
15NC_010361TTA4578958001233.33 %66.67 %0 %0 %8 %169142927
16NC_010361CCAT3652365341225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
17NC_010361CCAT3662966401225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
18NC_010361CCAT3687868891225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
19NC_010361CCAT3700270131225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
20NC_010361AAAG3900390141275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
21NC_010361AATATA411462114842366.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
22NC_010361ATC411668116781133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
23NC_010361AAGA312321123311175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
24NC_010361A16123791239416100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
25NC_010361AAGA513244132621975 %0 %25 %0 %10 %Non-Coding
26NC_010361TTG41371213722110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
27NC_010361CAATT313747137601440 %40 %0 %20 %7 %Non-Coding
28NC_010361ATA415949159591166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
29NC_010361AGG415967159771133.33 %0 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
30NC_010361AAAAG316001160151580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
31NC_010361A17163721638817100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
32NC_010361AACAA416585166031980 %0 %0 %20 %10 %Non-Coding
33NC_010361T151706517079150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
34NC_010361TTTA317730177411225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
35NC_010361AGA417795178051166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
36NC_010361TA617897179071150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
37NC_010361TCTA318076180861125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
38NC_010361AATGA319971199851560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
39NC_010361CA620212202221150 %0 %0 %50 %9 %Non-Coding
40NC_010361ATT420710207211233.33 %66.67 %0 %0 %8 %169142935
41NC_010361AAAG320766207761175 %0 %25 %0 %9 %169142935
42NC_010361T152260322617150 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
43NC_010361AT622844228551250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
44NC_010361TTCA322989230001225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
45NC_010361AATA323116231271275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
46NC_010361TACT328799288101225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
47NC_010361TCATT329053290661420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
48NC_010361AG629092291021150 %0 %50 %0 %9 %169142939
49NC_010361TAA429346293561166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
50NC_010361CT62970829718110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
51NC_010361CTTTTT32982729844180 %83.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
52NC_010361CTG42999130002120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %169142940
53NC_010361AAGC330485304951150 %0 %25 %25 %9 %169142940
54NC_010361AATC332603326131150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
55NC_010361AT633150331611250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
56NC_010361A13332033321513100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
57NC_010361T133345233464130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
58NC_010361A12343513436212100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
59NC_010361T133450134513130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
60NC_010361TTGA334520345301125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
61NC_010361TTTTC43542235440190 %80 %0 %20 %5 %Non-Coding
62NC_010361TAAAAA336826368441983.33 %16.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
63NC_010361TTCTT33728437297140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
64NC_010361ATT438819388301233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
65NC_010361AT639437394471150 %50 %0 %0 %9 %169142944
66NC_010361TATC339593396031125 %50 %0 %25 %9 %169142944
67NC_010361TAGG341539415491125 %25 %50 %0 %9 %169142944
68NC_010361AAC442473424841266.67 %0 %0 %33.33 %8 %169142945
69NC_010361ATTT343372433821125 %75 %0 %0 %9 %169142945
70NC_010361TA644807448171150 %50 %0 %0 %9 %169142945
71NC_010361AT646136461471250 %50 %0 %0 %8 %169142946
72NC_010361AAAAG349538495511480 %0 %20 %0 %7 %169142946
73NC_010361GTT55128251296150 %66.67 %33.33 %0 %6 %169142948
74NC_010361AAG751740517602166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
75NC_010361AGTT352246522561125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
76NC_010361T185232852345180 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
77NC_010361A14529225293514100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
78NC_010361A13538645387613100 %0 %0 %0 %7 %169142950
79NC_010361TGT45467754688120 %66.67 %33.33 %0 %8 %169142951
80NC_010361AGAC354974549851250 %0 %25 %25 %0 %169142951
81NC_010361TAT456141561521233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
82NC_010361A15568915690515100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
83NC_010361CTTT35706957080120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
84NC_010361AAAT557524575421975 %25 %0 %0 %10 %Non-Coding
85NC_010361TAA457713577241266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
86NC_010361TA757988580001350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
87NC_010361AT758008580201350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
88NC_010361AT758030580421350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
89NC_010361AT758052580641350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
90NC_010361T125841858429120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
91NC_010361T125868358694120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
92NC_010361A13586965870813100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
93NC_010361T135923659248130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
94NC_010361T155934459358150 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
95NC_010361ATGG360646606571225 %25 %50 %0 %0 %Non-Coding
96NC_010361ATGG360719607301225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
97NC_010361TTA460843608541233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
98NC_010361TAATTA363467634851950 %50 %0 %0 %10 %169142954
99NC_010361TTA464423644331133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
100NC_010361GATC364854648661325 %25 %25 %25 %7 %169142956
101NC_010361T136558965601130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
102NC_010361A17659576597317100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
103NC_010361AT666895669051150 %50 %0 %0 %9 %169142958
104NC_010361TCT46788167893130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
105NC_010361AAAG368434684451275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
106NC_010361T177011670132170 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
107NC_010361AGT570556705701533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
108NC_010361AAAT370625706361275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
109NC_010361A24706497067224100 %0 %0 %0 %4 %Non-Coding
110NC_010361TGAT370844708551225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
111NC_010361ATTA371407714181250 %50 %0 %0 %0 %169142964
112NC_010361AT771990720021350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
113NC_010361TAT472030720421333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
114NC_010361AT872037720511550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
115NC_010361ATT472802728131233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
116NC_010361TTTC37290272913120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
117NC_010361ACAA373153731641275 %0 %0 %25 %8 %169142966
118NC_010361TGAA374367743781250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
119NC_010361T137452774539130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
120NC_010361T127570375714120 %100 %0 %0 %0 %169143008
121NC_010361AAGA376284762951275 %0 %25 %0 %8 %169143008
122NC_010361GTC47642576435110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %169143008
123NC_010361TCT47835178362120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169143008
124NC_010361T147852078533140 %100 %0 %0 %7 %169143008
125NC_010361GTTT38012080130110 %75 %25 %0 %9 %169143008
126NC_010361ATTCA382369823831540 %40 %0 %20 %6 %169143008
127NC_010361ACGTAA483966839892450 %16.67 %16.67 %16.67 %0 %169143008
128NC_010361TTTAAA384849848661850 %50 %0 %0 %0 %169143008
129NC_010361TCCTT38488784902160 %60 %0 %40 %6 %169143008
130NC_010361A17858138582917100 %0 %0 %0 %5 %169143008
131NC_010361A16858408585516100 %0 %0 %0 %6 %169143008
132NC_010361CTTT38588285892110 %75 %0 %25 %9 %169143008
133NC_010361TTCT38650786518120 %75 %0 %25 %8 %169143008
134NC_010361GAAT386743867541250 %25 %25 %0 %8 %169143008
135NC_010361TTCT38708187092120 %75 %0 %25 %0 %169143008
136NC_010361ACTA388439884491150 %25 %0 %25 %9 %169143008
137NC_010361AT688620886311250 %50 %0 %0 %8 %169143008
138NC_010361TTTTC38866088673140 %80 %0 %20 %7 %169143008
139NC_010361CTT48919389204120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169143008
140NC_010361ATATG390990910041540 %40 %20 %0 %6 %169143008
141NC_010361AT691006910161150 %50 %0 %0 %9 %169143008
142NC_010361GAT491056910661133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %169143008
143NC_010361TTCT49245492468150 %75 %0 %25 %6 %169143008
144NC_010361ATCG393102931141325 %25 %25 %25 %7 %169143008
145NC_010361CGTT39357593586120 %50 %25 %25 %8 %169143008
146NC_010361CTTT39362493634110 %75 %0 %25 %9 %169143008
147NC_010361TGG49532495334110 %33.33 %66.67 %0 %9 %169143008
148NC_010361ACA496604966151266.67 %0 %0 %33.33 %0 %169143008
149NC_010361GAC897706977292433.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %169143008
150NC_010361GAAGAG397982979991850 %0 %50 %0 %5 %169143008
151NC_010361GAGGAA998027980805450 %0 %50 %0 %7 %169143008
152NC_010361GAGGAA598084981133050 %0 %50 %0 %3 %169143008
153NC_010361GAA498186981971266.67 %0 %33.33 %0 %8 %169143008
154NC_010361CTT59831898332150 %66.67 %0 %33.33 %6 %169143008
155NC_010361AAG498387983991366.67 %0 %33.33 %0 %7 %169143008
156NC_010361AGAT31001691001791150 %25 %25 %0 %9 %169143008
157NC_010361TTTC3100437100448120 %75 %0 %25 %8 %169143008
158NC_010361TTC4104564104575120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169142969
159NC_010361T14104591104604140 %100 %0 %0 %0 %169142969
160NC_010361ACG41080721080831233.33 %0 %33.33 %33.33 %0 %169142969
161NC_010361ACG81083861084082333.33 %0 %33.33 %33.33 %4 %169142969
162NC_010361ATCC31088241088351225 %25 %0 %50 %8 %169142969
163NC_010361TCTA31092191092301225 %50 %0 %25 %8 %169142969
164NC_010361AAGG31093581093681150 %0 %50 %0 %9 %169142969
165NC_010361GAGG31120951121061225 %0 %75 %0 %8 %169142969
166NC_010361AGGT31123071123181225 %25 %50 %0 %8 %169142969
167NC_010361TAAG31134271134371150 %25 %25 %0 %9 %169142969
168NC_010361ATT41160441160561333.33 %66.67 %0 %0 %7 %169142969
169NC_010361AAG41167011167121266.67 %0 %33.33 %0 %8 %169142969
170NC_010361AAAT31168751168851175 %25 %0 %0 %9 %169142969
171NC_010361ATAG31173741173851250 %25 %25 %0 %8 %169142969
172NC_010361TAA51176491176631566.67 %33.33 %0 %0 %6 %169142969
173NC_010361AATATT31176681176851850 %50 %0 %0 %5 %169142969
174NC_010361TA81177561177701550 %50 %0 %0 %6 %169142969
175NC_010361T15117996118010150 %100 %0 %0 %0 %169142969
176NC_010361AAAT41186711186861675 %25 %0 %0 %6 %169142969
177NC_010361ACTA31188151188251150 %25 %0 %25 %9 %169142969
178NC_010361AT101202111202291950 %50 %0 %0 %10 %169142969
179NC_010361AGT41203031203131133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %169142969
180NC_010361TTA41203681203791233.33 %66.67 %0 %0 %8 %169142969
181NC_010361TCTT3120508120518110 %75 %0 %25 %9 %169142969
182NC_010361AAT41208251208361266.67 %33.33 %0 %0 %8 %169142969
183NC_010361AAGA31209841209951275 %0 %25 %0 %8 %169142969
184NC_010361AT71220811220941450 %50 %0 %0 %7 %169142969
185NC_010361ATGA31224931225041250 %25 %25 %0 %8 %169142969
186NC_010361TGAAA31231121231261560 %20 %20 %0 %6 %169142969
187NC_010361A1912400212402019100 %0 %0 %0 %5 %169142969
188NC_010361CTTT3124637124648120 %75 %0 %25 %8 %169142969
189NC_010361TTC5125074125088150 %66.67 %0 %33.33 %6 %169142969
190NC_010361AT71253811253931350 %50 %0 %0 %7 %169142969
191NC_010361ATA41254591254701266.67 %33.33 %0 %0 %8 %169142969
192NC_010361AATC31260521260631250 %25 %0 %25 %8 %169142969
193NC_010361CTTT3128403128413110 %75 %0 %25 %9 %169142969
194NC_010361T19128459128477190 %100 %0 %0 %5 %169142969
195NC_010361AT61284761284871250 %50 %0 %0 %8 %169142969
196NC_010361TTTTCT3129637129654180 %83.33 %0 %16.67 %5 %169142969
197NC_010361TCT4129668129679120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169142969
198NC_010361ATAC31307151307261250 %25 %0 %25 %0 %169142969
199NC_010361T24131363131386240 %100 %0 %0 %8 %169142969
200NC_010361TCTT3131706131717120 %75 %0 %25 %0 %169142969
201NC_010361TCT4133272133282110 %66.67 %0 %33.33 %9 %169142969
202NC_010361T12134058134069120 %100 %0 %0 %8 %169142969
203NC_010361T14134114134127140 %100 %0 %0 %7 %169142969
204NC_010361TTC4134930134940110 %66.67 %0 %33.33 %9 %169142969
205NC_010361TCTTTA41360861361082316.67 %66.67 %0 %16.67 %4 %169142969
206NC_010361TCTA31363861363971225 %50 %0 %25 %8 %169142969
207NC_010361ATA41368691368801266.67 %33.33 %0 %0 %8 %169142969
208NC_010361ATTT31368871368971125 %75 %0 %0 %9 %169142969
209NC_010361CATT31373081373181125 %50 %0 %25 %9 %169142969
210NC_010361AAT41377161377281366.67 %33.33 %0 %0 %7 %169142969
211NC_010361TTC4138487138498120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169142969
212NC_010361TAA41397511397621266.67 %33.33 %0 %0 %8 %169142969
213NC_010361CTTA31403351403451125 %50 %0 %25 %9 %169142969
214NC_010361GGAT31449371449481225 %25 %50 %0 %8 %169142969
215NC_010361TCG9145363145387250 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %169142969
216NC_010361CGT4145553145563110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %169142969
217NC_010361TCG5145688145701140 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %169142969
218NC_010361A1714916814918417100 %0 %0 %0 %5 %169142969
219NC_010361GAA41491971492081266.67 %0 %33.33 %0 %8 %169142969
220NC_010361GAAA31533241533351275 %0 %25 %0 %8 %169143004
221NC_010361CATAC31549471549601440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding
222NC_010361CTT4155373155385130 %66.67 %0 %33.33 %7 %169143005
223NC_010361AAG51554401554541566.67 %0 %33.33 %0 %6 %169143005
224NC_010361TCCTCT5155660155689300 %50 %0 %50 %3 %169143005
225NC_010361TCCTCT9155693155746540 %50 %0 %50 %7 %169143005
226NC_010361CTCTTC3155773155790180 %50 %0 %50 %5 %169143005
227NC_010361TCG7156044156064210 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %169143005
228NC_010361TGT4157157157168120 %66.67 %33.33 %0 %0 %169143005
229NC_010361CGAT31583701583821325 %25 %25 %25 %7 %169143005
230NC_010361CCA41584381584481133.33 %0 %0 %66.67 %9 %169143005
231NC_010361AAAG31601381601481175 %0 %25 %0 %9 %169143005
232NC_010361AACG31601861601971250 %0 %25 %25 %8 %169143005
233NC_010361CGAT31606581606701325 %25 %25 %25 %7 %169143005
234NC_010361AATGA31624441624581560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
235NC_010361ATC41627061627161133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
236NC_010361AT61627561627661150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
237NC_010361GAA51645671645811566.67 %0 %33.33 %0 %6 %169143007