ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Oenothera glazioviana chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_010360GAAC31091191150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
2NC_010360CAG49589691233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %169142840
3NC_010360AAGT3106410741150 %25 %25 %0 %9 %169142840
4NC_010360AT6156715771150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
5NC_010360TACTCT3178117971716.67 %50 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
6NC_010360GAA4276327741266.67 %0 %33.33 %0 %8 %169142841
7NC_010360TCTTTC330313047170 %66.67 %0 %33.33 %5 %169142841
8NC_010360A143724373714100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
9NC_010360TAA4474847591266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
10NC_010360CT648524862110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
11NC_010360TTTA3502850381125 %75 %0 %0 %9 %169142842
12NC_010360TCTCT350685081140 %60 %0 %40 %7 %169142842
13NC_010360T1256825693120 %100 %0 %0 %0 %169142842
14NC_010360TTA4576057711233.33 %66.67 %0 %0 %8 %169142842
15NC_010360CCAT3649265031225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
16NC_010360CCAT3657865891225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
17NC_010360CCAT3682068311225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
18NC_010360CCAT3694469551225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
19NC_010360AAAG3894589561275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
20NC_010360AGA411406114161166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
21NC_010360ATC411590116001133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
22NC_010360AAGA312243122531175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
23NC_010360A14123011231414100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
24NC_010360AAGA513163131811975 %0 %25 %0 %10 %Non-Coding
25NC_010360TTG41363113641110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
26NC_010360CAATT313666136791440 %40 %0 %20 %7 %Non-Coding
27NC_010360ATA415859158691166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
28NC_010360AGG415877158871133.33 %0 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
29NC_010360AAAAG315911159251580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
30NC_010360A17162881630417100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
31NC_010360AACAA416501165191980 %0 %0 %20 %10 %Non-Coding
32NC_010360T131698116993130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
33NC_010360TTTA317644176551225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
34NC_010360TA617803178131150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
35NC_010360TCTA317982179921125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
36NC_010360C121835918370120 %0 %0 %100 %0 %Non-Coding
37NC_010360AATGA319879198931560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
38NC_010360CA620120201301150 %0 %0 %50 %9 %Non-Coding
39NC_010360ATT420618206291233.33 %66.67 %0 %0 %8 %169142850
40NC_010360AAAG320674206841175 %0 %25 %0 %9 %169142850
41NC_010360AT622750227611250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
42NC_010360TTCA322895229061225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
43NC_010360AATA323022230331275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
44NC_010360TACT328702287131225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
45NC_010360TCATT328956289691420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
46NC_010360AG628995290051150 %0 %50 %0 %9 %169142854
47NC_010360TAA429249292591166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
48NC_010360CT62961129621110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
49NC_010360CTTTTT32973329750180 %83.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
50NC_010360T162974029755160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
51NC_010360CTG42990029911120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %169142855
52NC_010360AAGC330394304041150 %0 %25 %25 %9 %169142855
53NC_010360AATC332512325221150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
54NC_010360AT633059330701250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
55NC_010360A13331123312413100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
56NC_010360T173336233378170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
57NC_010360A12342623427312100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
58NC_010360TTTTC43533235350190 %80 %0 %20 %5 %Non-Coding
59NC_010360TAAAAA336736367541983.33 %16.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
60NC_010360TTCTT33719437207140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
61NC_010360ATT438730387411233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
62NC_010360AT639348393581150 %50 %0 %0 %9 %169142859
63NC_010360TATC339504395141125 %50 %0 %25 %9 %169142859
64NC_010360TAGG341450414601125 %25 %50 %0 %9 %169142859
65NC_010360AAC442384423951266.67 %0 %0 %33.33 %8 %169142860
66NC_010360ATTT343283432931125 %75 %0 %0 %9 %169142860
67NC_010360TA644718447281150 %50 %0 %0 %9 %169142860
68NC_010360AT646048460591250 %50 %0 %0 %8 %169142861
69NC_010360AAAAG349450494631480 %0 %20 %0 %7 %169142861
70NC_010360T134963049642130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
71NC_010360GTT55119751211150 %66.67 %33.33 %0 %6 %169142863
72NC_010360AAG751661516822266.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
73NC_010360AGTT352168521781125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
74NC_010360ATTT352249522601225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
75NC_010360A18528425285918100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
76NC_010360A12537885379912100 %0 %0 %0 %8 %169142865
77NC_010360TGT45460054611120 %66.67 %33.33 %0 %8 %169142866
78NC_010360TCT45475254762110 %66.67 %0 %33.33 %9 %169142866
79NC_010360AGAC354897549081250 %0 %25 %25 %0 %169142866
80NC_010360TAT456064560751233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
81NC_010360A16567995681416100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
82NC_010360CTTT35697856989120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
83NC_010360AAAT557433574511975 %25 %0 %0 %10 %Non-Coding
84NC_010360TAA457622576331266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
85NC_010360TA757897579091350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
86NC_010360AT757917579291350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
87NC_010360A15585195853315100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
88NC_010360T135906259074130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
89NC_010360ATA459110591201166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
90NC_010360ATGG360459604701225 %25 %50 %0 %0 %Non-Coding
91NC_010360ATGG360736607471225 %25 %50 %0 %0 %Non-Coding
92NC_010360AAGCAA461363613862466.67 %0 %16.67 %16.67 %8 %Non-Coding
93NC_010360TAT462159621701233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
94NC_010360CAAGAT362354623711850 %16.67 %16.67 %16.67 %0 %Non-Coding
95NC_010360GAG462717627281233.33 %0 %66.67 %0 %8 %169142869
96NC_010360GAG462753627641233.33 %0 %66.67 %0 %8 %169142869
97NC_010360TAATTA363987640051950 %50 %0 %0 %10 %169142869
98NC_010360TTA464952649621133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
99NC_010360GATC365383653951325 %25 %25 %25 %7 %169142871
100NC_010360TC66596965980120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
101NC_010360A15664936650715100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
102NC_010360AT667429674391150 %50 %0 %0 %9 %169142873
103NC_010360TCT46841568427130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
104NC_010360AAAG368925689361275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
105NC_010360T157060570619150 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
106NC_010360GTAA370649706591150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
107NC_010360T127101371024120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
108NC_010360AGT571045710591533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
109NC_010360AAAT371114711251275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
110NC_010360A20711387115720100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
111NC_010360TGAT371329713401225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
112NC_010360ATTA371892719031250 %50 %0 %0 %0 %169142879
113NC_010360AT872470724841550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
114NC_010360AT772526725381350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
115NC_010360TAT772562725832233.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
116NC_010360AT872582725961550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
117NC_010360TTTA373381733921225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
118NC_010360TTTC37346773478120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
119NC_010360ACAA373719737301275 %0 %0 %25 %8 %169142881
120NC_010360TGAA374974749851250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
121NC_010360T157513475148150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
122NC_010360AAGA376886768971275 %0 %25 %0 %8 %169142923
123NC_010360CGT47703177042120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %169142923
124NC_010360TCT47705177062120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169142923
125NC_010360TCT47896678977120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169142923
126NC_010360ATTCA382995830091540 %40 %0 %20 %6 %169142923
127NC_010360ACGTAA484592846152450 %16.67 %16.67 %16.67 %0 %169142923
128NC_010360TTTAAA385475854921850 %50 %0 %0 %0 %169142923
129NC_010360A19864398645719100 %0 %0 %0 %5 %169142923
130NC_010360A13864688648013100 %0 %0 %0 %7 %169142923
131NC_010360CTTT38650986519110 %75 %0 %25 %9 %169142923
132NC_010360TTCT38713487145120 %75 %0 %25 %8 %169142923
133NC_010360GAAT387370873811250 %25 %25 %0 %8 %169142923
134NC_010360TTCT38770887719120 %75 %0 %25 %0 %169142923
135NC_010360ACTA389066890761150 %25 %0 %25 %9 %169142923
136NC_010360AT689247892581250 %50 %0 %0 %8 %169142923
137NC_010360TTTTC38928789300140 %80 %0 %20 %7 %169142923
138NC_010360CTT48982089831120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169142923
139NC_010360ATATG391617916311540 %40 %20 %0 %6 %169142923
140NC_010360AT691633916431150 %50 %0 %0 %9 %169142923
141NC_010360GAT491683916931133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %169142923
142NC_010360TTCT49322993243150 %75 %0 %25 %6 %169142923
143NC_010360ATCG393877938891325 %25 %25 %25 %7 %169142923
144NC_010360CGTT39435094361120 %50 %25 %25 %8 %169142923
145NC_010360CTTT39439994409110 %75 %0 %25 %9 %169142923
146NC_010360TGG49609996109110 %33.33 %66.67 %0 %9 %169142923
147NC_010360ACA497379973901266.67 %0 %0 %33.33 %0 %169142923
148NC_010360GAC898613986362433.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %169142923
149NC_010360GAAGAG398889989061850 %0 %50 %0 %5 %169142923
150NC_010360GAGGAA1098934989936050 %0 %50 %0 %6 %169142923
151NC_010360GAGGAA598997990263050 %0 %50 %0 %3 %169142923
152NC_010360GAA499099991101266.67 %0 %33.33 %0 %8 %169142923
153NC_010360CTT59923199245150 %66.67 %0 %33.33 %6 %169142923
154NC_010360AAG499300993121366.67 %0 %33.33 %0 %7 %169142923
155NC_010360AGAT31011001011101150 %25 %25 %0 %9 %169142923
156NC_010360TTTC3101368101379120 %75 %0 %25 %8 %169142923
157NC_010360TTC4105460105471120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169142884
158NC_010360ATCC31093561093671225 %25 %0 %50 %8 %169142884
159NC_010360TCTA31097511097621225 %50 %0 %25 %8 %169142884
160NC_010360AAGG31098901099001150 %0 %50 %0 %9 %169142884
161NC_010360GAGG31126271126381225 %0 %75 %0 %8 %169142884
162NC_010360AGGT31128391128501225 %25 %50 %0 %8 %169142884
163NC_010360TAAG31139591139691150 %25 %25 %0 %9 %169142884
164NC_010360ATT41165761165881333.33 %66.67 %0 %0 %7 %169142884
165NC_010360AAG41172331172441266.67 %0 %33.33 %0 %8 %169142884
166NC_010360AAAT31174071174171175 %25 %0 %0 %9 %169142884
167NC_010360ATAG31179061179171250 %25 %25 %0 %8 %169142884
168NC_010360TA121182531182752350 %50 %0 %0 %8 %169142884
169NC_010360T12118497118508120 %100 %0 %0 %0 %169142884
170NC_010360TTTG4119160119174150 %75 %25 %0 %6 %169142884
171NC_010360ATAA61191771191992375 %25 %0 %0 %4 %169142884
172NC_010360ACTA31193351193451150 %25 %0 %25 %9 %169142884
173NC_010360T12119625119636120 %100 %0 %0 %8 %169142884
174NC_010360AT101207251207431950 %50 %0 %0 %10 %169142884
175NC_010360AGT41208171208271133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %169142884
176NC_010360TTA41208821208931233.33 %66.67 %0 %0 %8 %169142884
177NC_010360TCTT3121022121032110 %75 %0 %25 %9 %169142884
178NC_010360AAT41213391213501266.67 %33.33 %0 %0 %8 %169142884
179NC_010360AAGA31214981215091275 %0 %25 %0 %8 %169142884
180NC_010360AT131225921226162550 %50 %0 %0 %8 %169142884
181NC_010360ATGA31230151230261250 %25 %25 %0 %8 %169142884
182NC_010360TGAAA31236341236481560 %20 %20 %0 %6 %169142884
183NC_010360A1512452412453815100 %0 %0 %0 %6 %169142884
184NC_010360CTTT3125155125166120 %75 %0 %25 %8 %169142884
185NC_010360TTC5125592125606150 %66.67 %0 %33.33 %6 %169142884
186NC_010360AT71258991259111350 %50 %0 %0 %7 %169142884
187NC_010360AATC31265701265811250 %25 %0 %25 %8 %169142884
188NC_010360CTTT3128921128931110 %75 %0 %25 %9 %169142884
189NC_010360T12128977128988120 %100 %0 %0 %8 %169142884
190NC_010360AT61289871289981250 %50 %0 %0 %8 %169142884
191NC_010360CTTTT4130124130142190 %80 %0 %20 %10 %169142884
192NC_010360TCT4130156130167120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169142884
193NC_010360T12130343130354120 %100 %0 %0 %0 %169142884
194NC_010360CATTTT31306281306451816.67 %66.67 %0 %16.67 %0 %169142884
195NC_010360ATAC31312091312201250 %25 %0 %25 %0 %169142884
196NC_010360T15131857131871150 %100 %0 %0 %6 %169142884
197NC_010360TCTT3132191132202120 %75 %0 %25 %0 %169142884
198NC_010360TCT4133844133854110 %66.67 %0 %33.33 %9 %169142884
199NC_010360T12134582134593120 %100 %0 %0 %8 %169142884
200NC_010360T14134638134651140 %100 %0 %0 %7 %169142884
201NC_010360TCTTTA41366551366772316.67 %66.67 %0 %16.67 %4 %169142884
202NC_010360TCTA31368991369101225 %50 %0 %25 %8 %169142884
203NC_010360ATA41373821373931266.67 %33.33 %0 %0 %8 %169142884
204NC_010360ATTT31374001374101125 %75 %0 %0 %9 %169142884
205NC_010360CATT31378211378311125 %50 %0 %25 %9 %169142884
206NC_010360AAT41382291382411366.67 %33.33 %0 %0 %7 %169142884
207NC_010360TTC4139000139011120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169142884
208NC_010360TAA41402641402751266.67 %33.33 %0 %0 %8 %169142884
209NC_010360CTTA31408481408581125 %50 %0 %25 %9 %169142884
210NC_010360GGAT31454501454611225 %25 %50 %0 %8 %169142884
211NC_010360CGT4145884145894110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %169142884
212NC_010360A1314932114933313100 %0 %0 %0 %7 %169142884
213NC_010360GAA41493461493571266.67 %0 %33.33 %0 %8 %169142884
214NC_010360GAAA31534381534491275 %0 %25 %0 %8 %169142919
215NC_010360CATAC31550791550921440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding
216NC_010360CTT4155505155517130 %66.67 %0 %33.33 %7 %169142920
217NC_010360AAG51555721555861566.67 %0 %33.33 %0 %6 %169142920
218NC_010360TCCTCT5155792155821300 %50 %0 %50 %3 %169142920
219NC_010360TCCTCT10155825155884600 %50 %0 %50 %6 %169142920
220NC_010360CTCTTC3155911155928180 %50 %0 %50 %5 %169142920
221NC_010360TCG7156182156202210 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %169142920
222NC_010360TGT4157427157438120 %66.67 %33.33 %0 %0 %169142920
223NC_010360CGAT31586401586521325 %25 %25 %25 %7 %169142920
224NC_010360CCA41587081587181133.33 %0 %0 %66.67 %9 %169142920
225NC_010360AAAG31604081604181175 %0 %25 %0 %9 %169142920
226NC_010360AACG31604561604671250 %0 %25 %25 %8 %169142920
227NC_010360CGAT31609281609401325 %25 %25 %25 %7 %169142920
228NC_010360ATC41631241631341133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
229NC_010360AT61631741631841150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
230NC_010360GAA51649851649991566.67 %0 %33.33 %0 %6 %169142922