ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Aneura mirabilis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010359	GGGAGG	3	964	981	18	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	5 %	169142813
2	NC_010359	AGGG	4	983	997	15	25 %	0 %	75 %	0 %	6 %	169142813
3	NC_010359	GAT	4	3508	3518	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	169142813
4	NC_010359	GGAT	3	4275	4285	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	169142813
5	NC_010359	ATC	4	10256	10267	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	169142813
6	NC_010359	A	13	10460	10472	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	169142813
7	NC_010359	GATA	3	14154	14164	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	169142813
8	NC_010359	GAAA	3	14761	14772	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	169142813
9	NC_010359	CTT	4	15671	15681	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	169142813
10	NC_010359	CCTT	3	17136	17147	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	169142813
11	NC_010359	GAAA	3	17148	17159	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	169142813
12	NC_010359	TTTA	3	17494	17505	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	169142813
13	NC_010359	AT	7	20612	20625	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	169142813
14	NC_010359	C	16	20849	20864	16	0 %	0 %	0 %	100 %	6 %	169142813
15	NC_010359	CT	6	20906	20916	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	169142813
16	NC_010359	AT	9	21527	21543	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	169142813
17	NC_010359	CTTT	3	21544	21555	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	169142813
18	NC_010359	TC	6	22095	22106	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	169142813
19	NC_010359	TAGA	3	22872	22882	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	169142813
20	NC_010359	ATT	4	25121	25132	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	169142813
21	NC_010359	ATAG	3	26182	26192	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	169142813
22	NC_010359	ATGA	3	28635	28646	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	169142813
23	NC_010359	TG	6	28769	28780	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	169142813
24	NC_010359	G	14	28778	28791	14	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	169142813
25	NC_010359	C	13	28921	28933	13	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	169142813
26	NC_010359	C	15	38762	38776	15	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	169142813
27	NC_010359	AG	6	40758	40768	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	169142813
28	NC_010359	TGA	4	40871	40882	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	169142813
29	NC_010359	CGTCAT	4	40915	40938	24	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	8 %	169142813
30	NC_010359	ACT	4	40971	40981	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	169142813
31	NC_010359	ATGT	4	41351	41366	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	169142813
32	NC_010359	ATCC	3	42206	42217	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	169142813
33	NC_010359	TCA	4	44162	44172	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	169142813
34	NC_010359	GGGA	3	45025	45037	13	25 %	0 %	75 %	0 %	7 %	169142813
35	NC_010359	AATT	3	46394	46405	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	169142813
36	NC_010359	TA	6	47090	47103	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	169142813
37	NC_010359	CAT	4	48364	48374	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	169142813
38	NC_010359	A	15	48975	48989	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	169142813
39	NC_010359	GTC	4	50847	50857	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	169142813
40	NC_010359	AATT	3	51752	51763	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	169142813
41	NC_010359	G	12	51986	51997	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	169142813
42	NC_010359	ATGT	3	52240	52252	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	169142813
43	NC_010359	ATCC	3	52931	52942	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	169142813
44	NC_010359	TGCA	3	53398	53410	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	169142813
45	NC_010359	ATT	4	55883	55893	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	169142813
46	NC_010359	TATT	3	56860	56870	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	169142813
47	NC_010359	AAT	4	56940	56951	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	169142813
48	NC_010359	TAT	4	57811	57822	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	169142813
49	NC_010359	TA	12	57830	57852	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	169142813
50	NC_010359	CCCT	3	59196	59206	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	169142813
51	NC_010359	C	13	59608	59620	13	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	169142813
52	NC_010359	AC	6	59914	59925	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	169142813
53	NC_010359	TGATAG	3	60163	60180	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	169142813
54	NC_010359	AATT	3	60698	60709	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	169142813
55	NC_010359	TGAA	3	61878	61888	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	169142813
56	NC_010359	CCCT	3	62268	62278	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	169142813
57	NC_010359	TGGA	3	62665	62676	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	169142813
58	NC_010359	CATT	3	63109	63121	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	169142813
59	NC_010359	ATTT	3	65208	65218	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	169142814
60	NC_010359	TA	6	65316	65326	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_010359	TCG	4	66311	66321	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
62	NC_010359	AAAT	4	67129	67144	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_010359	ACTC	3	68160	68171	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
64	NC_010359	AG	6	68384	68394	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_010359	AATT	3	69501	69512	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	169142818
66	NC_010359	G	14	69626	69639	14	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	169142818
67	NC_010359	TGAA	3	70601	70612	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	169142819
68	NC_010359	CTGTTT	3	71770	71787	18	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	169142821
69	NC_010359	ATTT	3	73058	73068	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	169142824
70	NC_010359	TGC	4	73213	73224	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	169142825
71	NC_010359	T	12	74165	74176	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010359	GGA	4	81985	81996	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_010359	GAGG	3	83236	83247	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_010359	AGGT	3	83455	83466	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010359	ATTG	3	85333	85344	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_010359	AATC	3	87122	87133	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	169142832
77	NC_010359	TCA	4	87937	87948	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
78	NC_010359	CTAA	3	88194	88205	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010359	TTCC	3	88327	88338	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
80	NC_010359	TA	6	88385	88395	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_010359	CATT	3	88849	88860	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
82	NC_010359	TTC	4	90326	90336	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
83	NC_010359	AACC	3	90392	90403	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
84	NC_010359	AT	8	92170	92185	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_010359	GAA	4	93077	93088	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_010359	TTTC	3	93675	93686	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
87	NC_010359	CCAT	3	95422	95433	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	169142835
88	NC_010359	CTT	4	96297	96308	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	169142835
89	NC_010359	ATA	4	96395	96405	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	169142835
90	NC_010359	TAA	4	96540	96551	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	169142835
91	NC_010359	GAA	4	96567	96578	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	169142835
92	NC_010359	CCT	4	97104	97115	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
93	NC_010359	TC	6	97606	97617	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	169142836
94	NC_010359	ACAT	3	98516	98527	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	169142836
95	NC_010359	GAA	4	98542	98554	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_010359	TGA	4	99035	99045	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	169142837
97	NC_010359	ACAT	3	99084	99094	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	169142837
98	NC_010359	CAAT	3	100217	100228	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
99	NC_010359	CTAC	3	102093	102104	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010359	CTC	4	103564	103575	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
101	NC_010359	ATA	4	107915	107925	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

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