ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Oenothera argillicola chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_010358GAAC31091191150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
2NC_010358CAG49479581233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %169142690
3NC_010358AAGT3105310631150 %25 %25 %0 %9 %169142690
4NC_010358AT6155615661150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
5NC_010358GAA4275227631266.67 %0 %33.33 %0 %8 %169142691
6NC_010358TCTTTC330203036170 %66.67 %0 %33.33 %5 %169142691
7NC_010358A153713372715100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
8NC_010358C1241064117120 %0 %0 %100 %0 %Non-Coding
9NC_010358A164118413316100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
10NC_010358TAA4471947301266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
11NC_010358CT648224832110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
12NC_010358TTTA3499850081125 %75 %0 %0 %9 %169142692
13NC_010358TCTCT350385051140 %60 %0 %40 %7 %169142692
14NC_010358T1456455658140 %100 %0 %0 %0 %169142692
15NC_010358TTA4572557361233.33 %66.67 %0 %0 %8 %169142692
16NC_010358CCAT3645764681225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
17NC_010358T1266246635120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
18NC_010358AGA411037110471166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
19NC_010358ATC411221112311133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
20NC_010358AAGA311874118841175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
21NC_010358A15119321194615100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
22NC_010358AAGA512795128131975 %0 %25 %0 %10 %Non-Coding
23NC_010358TTG41326313273110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
24NC_010358CAATT313298133111440 %40 %0 %20 %7 %Non-Coding
25NC_010358ATA415491155011166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
26NC_010358AGG415509155191133.33 %0 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
27NC_010358AAAAG315543155571580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
28NC_010358A12159141592512100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
29NC_010358AACAA416121161391980 %0 %0 %20 %10 %Non-Coding
30NC_010358TTTA317262172731225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_010358TA617421174311150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
32NC_010358TTCTAT317432174481716.67 %66.67 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
33NC_010358TA617472174821150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
34NC_010358TCTA317652176621125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
35NC_010358C161802918044160 %0 %0 %100 %0 %Non-Coding
36NC_010358AATGA319552195661560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
37NC_010358CA619793198031150 %0 %0 %50 %9 %Non-Coding
38NC_010358ATT420292203031233.33 %66.67 %0 %0 %8 %169142700
39NC_010358AAAG320348203581175 %0 %25 %0 %9 %169142700
40NC_010358T122218522196120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
41NC_010358AT622424224351250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
42NC_010358TTCA322569225801225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
43NC_010358AATA322696227071275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
44NC_010358TACT328375283861225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
45NC_010358TCATT328602286151420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
46NC_010358AG628641286511150 %0 %50 %0 %9 %169142704
47NC_010358TAA428895289051166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
48NC_010358CT62925729267110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
49NC_010358CTTTTT32937629393180 %83.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
50NC_010358T162938329398160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
51NC_010358CTG42954329554120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %169142705
52NC_010358AAGC330037300471150 %0 %25 %25 %9 %169142705
53NC_010358AATC332155321651150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
54NC_010358TCAATA332659326771950 %33.33 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
55NC_010358AT632710327211250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
56NC_010358A12327633277412100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
57NC_010358T173301133027170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
58NC_010358A27339353396127100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
59NC_010358TAT435000350101133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
60NC_010358TTTTC43501935037190 %80 %0 %20 %5 %Non-Coding
61NC_010358TAAAAA336423364411983.33 %16.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
62NC_010358TTCTT33688136894140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
63NC_010358ATT438417384281233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
64NC_010358AT639035390451150 %50 %0 %0 %9 %169142709
65NC_010358TATC339191392011125 %50 %0 %25 %9 %169142709
66NC_010358TAGG341137411471125 %25 %50 %0 %9 %169142709
67NC_010358AAC442071420821266.67 %0 %0 %33.33 %8 %169142710
68NC_010358ATTT342970429801125 %75 %0 %0 %9 %169142710
69NC_010358TA644405444151150 %50 %0 %0 %9 %169142710
70NC_010358AT645735457461250 %50 %0 %0 %8 %169142711
71NC_010358AAAAG349137491501480 %0 %20 %0 %7 %169142711
72NC_010358T134931749329130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
73NC_010358GTT55088450898150 %66.67 %33.33 %0 %6 %169142713
74NC_010358AAG751348513692266.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
75NC_010358AGTT351855518651125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
76NC_010358ATTTT351936519491420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
77NC_010358A19525295254719100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
78NC_010358A17534845350017100 %0 %0 %0 %5 %169142715
79NC_010358TGT45430154312120 %66.67 %33.33 %0 %8 %169142716
80NC_010358TCT45445354463110 %66.67 %0 %33.33 %9 %169142716
81NC_010358AGAC354598546091250 %0 %25 %25 %0 %169142716
82NC_010358A15564945650815100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
83NC_010358CTTT35667256683120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
84NC_010358AAAT557127571451975 %25 %0 %0 %10 %Non-Coding
85NC_010358TAA457318573291266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
86NC_010358TA757593576051350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
87NC_010358T125818058191120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
88NC_010358A14581935820614100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
89NC_010358ATA458781587911166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
90NC_010358T125884058851120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
91NC_010358A22598415986222100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
92NC_010358ATGG360141601521225 %25 %50 %0 %0 %Non-Coding
93NC_010358GAT461315613261233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
94NC_010358GATGAG362143621601833.33 %16.67 %50 %0 %5 %169142719
95NC_010358TAATTA363400634181950 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
96NC_010358TTA464366643761133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
97NC_010358GATC364797648091325 %25 %25 %25 %7 %169142721
98NC_010358T136552665538130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
99NC_010358A15659066592015100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
100NC_010358AT666842668521150 %50 %0 %0 %9 %169142723
101NC_010358TCT46782867840130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
102NC_010358AAAG368338683491275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
103NC_010358T187001870035180 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
104NC_010358AGT570056700701533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
105NC_010358AAAT370125701361275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
106NC_010358A18701517016818100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
107NC_010358TGAT370340703511225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
108NC_010358ATTA370903709141250 %50 %0 %0 %0 %169142729
109NC_010358AT771486714981350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
110NC_010358TAT471526715381333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
111NC_010358AT871533715471550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
112NC_010358ATT472299723101233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
113NC_010358TTTC37239172402120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
114NC_010358ACAA372643726541275 %0 %0 %25 %8 %169142731
115NC_010358A13732397325113100 %0 %0 %0 %0 %169142732
116NC_010358TGAA373885738961250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
117NC_010358T157404574059150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
118NC_010358AAGA375701757121275 %0 %25 %0 %8 %169142773
119NC_010358GTC47584275852110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %169142773
120NC_010358TCTTCG37586675883180 %50 %16.67 %33.33 %5 %169142773
121NC_010358ATAAAA475920759432483.33 %16.67 %0 %0 %8 %169142773
122NC_010358A22759287594922100 %0 %0 %0 %0 %169142773
123NC_010358TCT47790677917120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169142773
124NC_010358T147807578088140 %100 %0 %0 %7 %169142773
125NC_010358AT879114791301750 %50 %0 %0 %5 %169142773
126NC_010358GTTT37965279662110 %75 %25 %0 %9 %169142773
127NC_010358ATTCA381907819211540 %40 %0 %20 %6 %169142773
128NC_010358ACGTAA483504835272450 %16.67 %16.67 %16.67 %0 %169142773
129NC_010358TAAATT384389844061850 %50 %0 %0 %5 %169142773
130NC_010358TCCTT38442584440160 %60 %0 %40 %6 %169142773
131NC_010358A19853518536919100 %0 %0 %0 %5 %169142773
132NC_010358A18853808539718100 %0 %0 %0 %5 %169142773
133NC_010358CTTT38542685436110 %75 %0 %25 %9 %169142773
134NC_010358TTCT38605186062120 %75 %0 %25 %8 %169142773
135NC_010358AT686079860901250 %50 %0 %0 %8 %169142773
136NC_010358GAAT386289863001250 %25 %25 %0 %8 %169142773
137NC_010358TTCT38662786638120 %75 %0 %25 %0 %169142773
138NC_010358ACTA387986879961150 %25 %0 %25 %9 %169142773
139NC_010358AT688167881781250 %50 %0 %0 %8 %169142773
140NC_010358CTT48874288753120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169142773
141NC_010358ATATG390539905531540 %40 %20 %0 %6 %169142773
142NC_010358AT690555905651150 %50 %0 %0 %9 %169142773
143NC_010358GAT490605906151133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %169142773
144NC_010358TTCT49214392157150 %75 %0 %25 %6 %169142773
145NC_010358ATCG392791928031325 %25 %25 %25 %7 %169142773
146NC_010358CGTT39324393254120 %50 %25 %25 %8 %169142773
147NC_010358CTTT39329293302110 %75 %0 %25 %9 %169142773
148NC_010358ACA496245962561266.67 %0 %0 %33.33 %0 %169142773
149NC_010358GAC897488975112433.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %169142773
150NC_010358GAAGAG397764977811850 %0 %50 %0 %5 %169142773
151NC_010358GAGGAA897809978564850 %0 %50 %0 %8 %169142773
152NC_010358GAGGAA797860979014250 %0 %50 %0 %9 %169142773
153NC_010358GAA497968979791266.67 %0 %33.33 %0 %8 %169142773
154NC_010358CTT59810098114150 %66.67 %0 %33.33 %6 %169142773
155NC_010358AAG498169981811366.67 %0 %33.33 %0 %7 %169142773
156NC_010358AGAT399933999431150 %25 %25 %0 %9 %169142773
157NC_010358TTTC3100201100212120 %75 %0 %25 %8 %169142773
158NC_010358T13104315104327130 %100 %0 %0 %0 %169142734
159NC_010358ACG41077951078061233.33 %0 %33.33 %33.33 %0 %169142734
160NC_010358ACG61081611081771733.33 %0 %33.33 %33.33 %5 %169142734
161NC_010358ATCC31086711086821225 %25 %0 %50 %8 %169142734
162NC_010358TCTA31090661090771225 %50 %0 %25 %8 %169142734
163NC_010358AAGG31092051092151150 %0 %50 %0 %9 %169142734
164NC_010358GAGG31119421119531225 %0 %75 %0 %8 %169142734
165NC_010358AGGT31121541121651225 %25 %50 %0 %8 %169142734
166NC_010358TAAG31132741132841150 %25 %25 %0 %9 %169142734
167NC_010358ATT41158911159031333.33 %66.67 %0 %0 %7 %169142734
168NC_010358AAG41165481165591266.67 %0 %33.33 %0 %8 %169142734
169NC_010358AAAT31167221167321175 %25 %0 %0 %9 %169142734
170NC_010358ATAG31172211172321250 %25 %25 %0 %8 %169142734
171NC_010358TAA51174961175101566.67 %33.33 %0 %0 %6 %169142734
172NC_010358AT61175351175461250 %50 %0 %0 %8 %169142734
173NC_010358TA81175751175891550 %50 %0 %0 %6 %169142734
174NC_010358TATT41176521176681725 %75 %0 %0 %5 %169142734
175NC_010358C12117739117750120 %0 %0 %100 %0 %169142734
176NC_010358A1811775111776818100 %0 %0 %0 %0 %169142734
177NC_010358T15117835117849150 %100 %0 %0 %0 %169142734
178NC_010358A2711852011854627100 %0 %0 %0 %7 %169142734
179NC_010358ACTA31186731186831150 %25 %0 %25 %9 %169142734
180NC_010358A1811871811873518100 %0 %0 %0 %0 %169142734
181NC_010358T12118973118984120 %100 %0 %0 %8 %169142734
182NC_010358AT111200871201072150 %50 %0 %0 %9 %169142734
183NC_010358AGT41201821201921133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %169142734
184NC_010358TTA41202471202581233.33 %66.67 %0 %0 %8 %169142734
185NC_010358TCTT3120387120397110 %75 %0 %25 %9 %169142734
186NC_010358A1212040912042012100 %0 %0 %0 %0 %169142734
187NC_010358AAT41207061207171266.67 %33.33 %0 %0 %8 %169142734
188NC_010358AAGA31208651208761275 %0 %25 %0 %8 %169142734
189NC_010358AT81219761219911650 %50 %0 %0 %6 %169142734
190NC_010358ATGA31223921224031250 %25 %25 %0 %8 %169142734
191NC_010358TGAAA31230111230251560 %20 %20 %0 %6 %169142734
192NC_010358A1712390112391717100 %0 %0 %0 %5 %169142734
193NC_010358CTTT3124534124545120 %75 %0 %25 %8 %169142734
194NC_010358TTC5124971124985150 %66.67 %0 %33.33 %6 %169142734
195NC_010358AT71252781252901350 %50 %0 %0 %7 %169142734
196NC_010358AATC31259721259831250 %25 %0 %25 %8 %169142734
197NC_010358CTTT3128323128333110 %75 %0 %25 %9 %169142734
198NC_010358T12128379128390120 %100 %0 %0 %8 %169142734
199NC_010358CTTTT4129580129598190 %80 %0 %20 %10 %169142734
200NC_010358TCT4129612129623120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169142734
201NC_010358T12129799129810120 %100 %0 %0 %0 %169142734
202NC_010358CATTTT31300841301011816.67 %66.67 %0 %16.67 %0 %169142734
203NC_010358ATAC31306651306761250 %25 %0 %25 %0 %169142734
204NC_010358TTTC3130821130831110 %75 %0 %25 %9 %169142734
205NC_010358T15131313131327150 %100 %0 %0 %6 %169142734
206NC_010358TCTT3131647131658120 %75 %0 %25 %0 %169142734
207NC_010358TCT4133336133346110 %66.67 %0 %33.33 %9 %169142734
208NC_010358TTTTG3133611133625150 %80 %20 %0 %6 %169142734
209NC_010358T12134107134118120 %100 %0 %0 %8 %169142734
210NC_010358T14134163134176140 %100 %0 %0 %7 %169142734
211NC_010358T14136056136069140 %100 %0 %0 %7 %169142734
212NC_010358TCTTTA41361811362032316.67 %66.67 %0 %16.67 %4 %169142734
213NC_010358TCTA31363341363451225 %50 %0 %25 %8 %169142734
214NC_010358ATA41368171368281266.67 %33.33 %0 %0 %8 %169142734
215NC_010358ATTT31368351368451125 %75 %0 %0 %9 %169142734
216NC_010358CATT31372561372661125 %50 %0 %25 %9 %169142734
217NC_010358AAT41376641376761366.67 %33.33 %0 %0 %7 %169142734
218NC_010358TTC4138435138446120 %66.67 %0 %33.33 %8 %169142734
219NC_010358TAA41396991397101266.67 %33.33 %0 %0 %8 %169142734
220NC_010358CTTA31402831402931125 %50 %0 %25 %9 %169142734
221NC_010358GGAT31448851448961225 %25 %50 %0 %8 %169142734
222NC_010358GTC4145396145407120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %169142734
223NC_010358TCG4145480145490110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %169142734
224NC_010358TCG4145620145630110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %169142734
225NC_010358TCG5145760145773140 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %169142734
226NC_010358A1614924014925516100 %0 %0 %0 %6 %169142734
227NC_010358GAAA31533551533661275 %0 %25 %0 %8 %169142769
228NC_010358CATAC31549601549731440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding
229NC_010358CTT4155386155398130 %66.67 %0 %33.33 %7 %169142770
230NC_010358AAG51554531554671566.67 %0 %33.33 %0 %6 %169142770
231NC_010358TCCTCT7155667155708420 %50 %0 %50 %9 %169142770
232NC_010358TCCTCT8155712155759480 %50 %0 %50 %8 %169142770
233NC_010358CTCTTC3155786155803180 %50 %0 %50 %5 %169142770
234NC_010358TCG7156057156077210 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %169142770
235NC_010358TGT4157311157322120 %66.67 %33.33 %0 %0 %169142770
236NC_010358CGAT31585211585331325 %25 %25 %25 %7 %169142770
237NC_010358AAAG31602651602751175 %0 %25 %0 %9 %169142770
238NC_010358AACG31603131603241250 %0 %25 %25 %8 %169142770
239NC_010358CGAT31607641607761325 %25 %25 %25 %7 %169142770
240NC_010358AATGA31626901627041560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
241NC_010358ATC41629521629621133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
242NC_010358AT61630021630121150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
243NC_010358GAA51648131648271566.67 %0 %33.33 %0 %6 %169142772