ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Carica papaya chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_010323ACA42222341366.67 %0 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
2NC_010323TGTA32472581225 %50 %25 %0 %0 %Non-Coding
3NC_010323TAAA33413521275 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
4NC_010323TAAA43643791675 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
5NC_010323T14389402140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
6NC_010323T16433448160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
7NC_010323TTAT35445551225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
8NC_010323AAGT3129113011150 %25 %25 %0 %9 %167391785
9NC_010323AT6178017911250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
10NC_010323TGAA4182718431750 %25 %25 %0 %5 %Non-Coding
11NC_010323TAA4216721781266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
12NC_010323AATG3218321941250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
13NC_010323CTT423762387120 %66.67 %0 %33.33 %8 %167391786
14NC_010323TTCC344304442130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
15NC_010323CAAAA3464246561580 %0 %0 %20 %6 %Non-Coding
16NC_010323TCTTAT4480948322416.67 %66.67 %0 %16.67 %8 %Non-Coding
17NC_010323TTAT10482948673925 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
18NC_010323AAAAT3511351261480 %20 %0 %0 %7 %Non-Coding
19NC_010323TTCA3524152521225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
20NC_010323T1252885299120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_010323T1362376249130 %100 %0 %0 %0 %167391787
22NC_010323TTTC362526263120 %75 %0 %25 %0 %167391787
23NC_010323GAAA3820682161175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
24NC_010323ATAA3851585261275 %25 %0 %0 %8 %167391789
25NC_010323T1285398550120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
26NC_010323A128755876612100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
27NC_010323ATT4881488241133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
28NC_010323ATT4882988391133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
29NC_010323TA6885088621350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
30NC_010323TTAT4927692901525 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
31NC_010323TAT6932693421733.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
32NC_010323AAT4934393531166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
33NC_010323AAAGA3947494881580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
34NC_010323GTTA3949395041225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
35NC_010323TTATTT310286103031816.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
36NC_010323AAAG310610106221375 %0 %25 %0 %7 %Non-Coding
37NC_010323TA710864108781550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
38NC_010323TTAAA310966109801560 %40 %0 %0 %0 %Non-Coding
39NC_010323TATT411003110181625 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
40NC_010323T141101311026140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
41NC_010323GTTT31114111152120 %75 %25 %0 %8 %167391790
42NC_010323T141316013173140 %100 %0 %0 %0 %167391791
43NC_010323CT61319713207110 %50 %0 %50 %9 %167391791
44NC_010323TAG413521135311133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %167391791
45NC_010323ATTT313595136051125 %75 %0 %0 %9 %167391791
46NC_010323T131398713999130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
47NC_010323TTCTAT314017140331716.67 %66.67 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
48NC_010323AT614034140451250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
49NC_010323ATG414163141731133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
50NC_010323AAAT314764147751275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
51NC_010323AAT414865148761266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
52NC_010323AT814943149591750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
53NC_010323AT614952149681750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
54NC_010323TTTA315036150471225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
55NC_010323CT61531715327110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
56NC_010323TTC41537015380110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
57NC_010323GAT417125171371333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %167391794
58NC_010323AG617658176681150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
59NC_010323ATGT317897179071125 %50 %25 %0 %9 %167391795
60NC_010323T151988919903150 %100 %0 %0 %6 %167391795
61NC_010323TTCA324007240181225 %50 %0 %25 %8 %167391796
62NC_010323CTTT32443824448110 %75 %0 %25 %9 %167391796
63NC_010323TAA424570245801166.67 %33.33 %0 %0 %9 %167391796
64NC_010323GTT42500225013120 %66.67 %33.33 %0 %8 %167391796
65NC_010323T122762327634120 %100 %0 %0 %8 %167391797
66NC_010323TCTT42886028875160 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
67NC_010323TTA429897299081233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
68NC_010323GAAA331879318891175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
69NC_010323TCTTT33227632289140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
70NC_010323TA633359333691150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
71NC_010323ATT534703347171533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
72NC_010323GAAA336414364251275 %0 %25 %0 %8 %171259360
73NC_010323TTGC33681536825110 %50 %25 %25 %9 %171259360
74NC_010323TGC43730837319120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %171259360
75NC_010323GA637606376171250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
76NC_010323GAGAT337833378461440 %20 %40 %0 %7 %Non-Coding
77NC_010323AAAC338384383941175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
78NC_010323AAAT338444384541175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
79NC_010323AT638477384881250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
80NC_010323AAAAT338581385951580 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
81NC_010323TA738624386391650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
82NC_010323AT738677386891350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
83NC_010323AATG342617426281250 %25 %25 %0 %8 %167391805
84NC_010323TG64305943069110 %50 %50 %0 %9 %167391805
85NC_010323CCAT344340443511225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
86NC_010323AT844700447141550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
87NC_010323TA644714447251250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
88NC_010323AT644918449281150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
89NC_010323A16449314494616100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
90NC_010323A18453594537618100 %0 %0 %0 %5 %167391806
91NC_010323TTG44650746517110 %66.67 %33.33 %0 %9 %167391806
92NC_010323CTTT34674046750110 %75 %0 %25 %9 %167391806
93NC_010323A14468074682014100 %0 %0 %0 %7 %167391806
94NC_010323AAT447442474521166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
95NC_010323A19474534747119100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
96NC_010323ACTTA348045480601640 %40 %0 %20 %6 %Non-Coding
97NC_010323AAATC349077490901460 %20 %0 %20 %7 %Non-Coding
98NC_010323ATT449439494491133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
99NC_010323TAT849451494722233.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
100NC_010323TAAA349645496551175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
101NC_010323ATTA949803498373550 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
102NC_010323ATA549838498521566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
103NC_010323AT650016500271250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
104NC_010323T175063250648170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
105NC_010323TAT451017510291333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
106NC_010323TA651044510541150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
107NC_010323AATT351356513671250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
108NC_010323CATA351378513881150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
109NC_010323ATA451880518921366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
110NC_010323TAGAA351932519461560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
111NC_010323CAAA352445524561275 %0 %0 %25 %8 %167391808
112NC_010323GTCT35304253053120 %50 %25 %25 %8 %167391809
113NC_010323CTTT35329053300110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
114NC_010323GATT353853538641225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
115NC_010323A12540055401612100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
116NC_010323AAAAAT354108541261983.33 %16.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
117NC_010323TCTA354138541481125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
118NC_010323TTTATA354215542321833.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
119NC_010323ATT454697547071133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
120NC_010323TTTA354808548181125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
121NC_010323TTTA454825548401625 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
122NC_010323TAAA454837548521675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
123NC_010323ATTA454888549031650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
124NC_010323T155591755931150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
125NC_010323ATA657928579441766.67 %33.33 %0 %0 %5 %167391812
126NC_010323ATT458431584431333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
127NC_010323TTG55867758690140 %66.67 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
128NC_010323TTTA360175601851125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
129NC_010323AT760378603901350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
130NC_010323AATTGA360649606671950 %33.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
131NC_010323AAT762826628472266.67 %33.33 %0 %0 %4 %Non-Coding
132NC_010323AT662934629461350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
133NC_010323TA762961629731350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
134NC_010323T126418864199120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
135NC_010323TTA465456654671233.33 %66.67 %0 %0 %8 %167391817
136NC_010323AT666043660531150 %50 %0 %0 %9 %167391818
137NC_010323T126704167052120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
138NC_010323GGGT36716167171110 %25 %75 %0 %9 %Non-Coding
139NC_010323TTA467634676451233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
140NC_010323T136874768759130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
141NC_010323AAATT369418694321560 %40 %0 %0 %6 %Non-Coding
142NC_010323T157037770391150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
143NC_010323T137062170633130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
144NC_010323AAAG371210712201175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
145NC_010323TTA471672716831233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
146NC_010323TTTA471686717001525 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
147NC_010323TACA372015720261250 %25 %0 %25 %8 %167391826
148NC_010323AAAT572136721562175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
149NC_010323ATAA472227722421675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
150NC_010323TGTCG37273072743140 %40 %40 %20 %7 %Non-Coding
151NC_010323AAGA372745727561275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
152NC_010323TGAA373278732891250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
153NC_010323TCTT37343173441110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
154NC_010323CTAA373506735161150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
155NC_010323TCAA373618736291250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
156NC_010323TACTGA374017740351933.33 %33.33 %16.67 %16.67 %10 %Non-Coding
157NC_010323TATT374361743711125 %75 %0 %0 %9 %167391829
158NC_010323TTTA374863748741225 %75 %0 %0 %8 %167391829
159NC_010323TAT475117751291333.33 %66.67 %0 %0 %7 %167391829
160NC_010323TTCAT375947759601420 %60 %0 %20 %7 %167391829
161NC_010323CAATT376250762631440 %40 %0 %20 %7 %167391829
162NC_010323ATA476492765021166.67 %33.33 %0 %0 %9 %167391829
163NC_010323TGAA376646766561150 %25 %25 %0 %9 %167391829
164NC_010323AGGG376833768431125 %0 %75 %0 %9 %167391829
165NC_010323TCT47829778308120 %66.67 %0 %33.33 %8 %167391829
166NC_010323CAAA378572785831275 %0 %0 %25 %8 %167391829
167NC_010323TTTC37935679367120 %75 %0 %25 %0 %167391829
168NC_010323TTAT379589796001225 %75 %0 %0 %8 %167391829
169NC_010323TTTA381305813161225 %75 %0 %0 %8 %167391829
170NC_010323CTT48284282852110 %66.67 %0 %33.33 %9 %167391829
171NC_010323ATA483548835591266.67 %33.33 %0 %0 %8 %167391829
172NC_010323TTTA384108841191225 %75 %0 %0 %8 %167391829
173NC_010323TA885217852321650 %50 %0 %0 %6 %167391829
174NC_010323AT785244852561350 %50 %0 %0 %7 %167391829
175NC_010323ATATTA385289853051750 %50 %0 %0 %5 %167391829
176NC_010323A16857998581416100 %0 %0 %0 %6 %167391829
177NC_010323TCAGAA386700867171850 %16.67 %16.67 %16.67 %5 %167391829
178NC_010323T128693086941120 %100 %0 %0 %8 %167391829
179NC_010323TTTCTT38713387150180 %83.33 %0 %16.67 %5 %167391829
180NC_010323T148714387156140 %100 %0 %0 %7 %167391829
181NC_010323AT687192872021150 %50 %0 %0 %9 %167391829
182NC_010323AATT387912879221150 %50 %0 %0 %9 %167391829
183NC_010323AT687934879441150 %50 %0 %0 %9 %167391829
184NC_010323ACTA388334883441150 %25 %0 %25 %9 %167391829
185NC_010323TTTC38855688566110 %75 %0 %25 %9 %167391829
186NC_010323CTT48901789028120 %66.67 %0 %33.33 %8 %167391829
187NC_010323GAT489485894951133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %167391829
188NC_010323ATATG390814908281540 %40 %20 %0 %6 %167391829
189NC_010323GAT490857908671133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %167391829
190NC_010323TTCT39255792567110 %75 %0 %25 %9 %167391829
191NC_010323AAAT392683926941275 %25 %0 %0 %8 %167391829
192NC_010323CTTT39375093760110 %75 %0 %25 %9 %167391829
193NC_010323AGA494588945981166.67 %0 %33.33 %0 %9 %167391829
194NC_010323TGAT395626956381325 %50 %25 %0 %7 %167391829
195NC_010323AATA396509965211375 %25 %0 %0 %7 %167391829
196NC_010323GAAGGA397295973121850 %0 %50 %0 %5 %167391829
197NC_010323G149881098823140 %0 %100 %0 %7 %167391829
198NC_010323TA699185991951150 %50 %0 %0 %9 %167391829
199NC_010323TCCGG39942099434150 %20 %40 %40 %6 %167391829
200NC_010323TTTGTT3102439102457190 %83.33 %16.67 %0 %10 %167391829
201NC_010323TTC4103837103848120 %66.67 %0 %33.33 %8 %167391830
202NC_010323TTAT51038531038722025 %75 %0 %0 %5 %167391830
203NC_010323TATTAG31044531044752333.33 %50 %16.67 %0 %4 %167391830
204NC_010323CTAT31080251080361225 %50 %0 %25 %8 %167391830
205NC_010323GAGG31108771108881225 %0 %75 %0 %8 %167391830
206NC_010323AGGT31110891111001225 %25 %50 %0 %8 %167391830
207NC_010323TAAG31122091122191150 %25 %25 %0 %9 %167391830
208NC_010323AAAAGA31128681128851883.33 %0 %16.67 %0 %5 %167391830
209NC_010323GAA51142861143001566.67 %0 %33.33 %0 %6 %167391830
210NC_010323A1311504011505213100 %0 %0 %0 %7 %167391830
211NC_010323AATTTA41150611150842450 %50 %0 %0 %8 %167391830
212NC_010323TAAA41151641151791675 %25 %0 %0 %6 %167391830
213NC_010323AAG41165251165361266.67 %0 %33.33 %0 %8 %167391830
214NC_010323TA61176621176731250 %50 %0 %0 %8 %167391830
215NC_010323TA61178971179071150 %50 %0 %0 %9 %167391830
216NC_010323AAGA31179431179541275 %0 %25 %0 %8 %167391830
217NC_010323TTTA31184721184821125 %75 %0 %0 %9 %167391830
218NC_010323AAAT31185481185581175 %25 %0 %0 %9 %167391830
219NC_010323TA61189491189591150 %50 %0 %0 %9 %167391830
220NC_010323TTA51193731193881633.33 %66.67 %0 %0 %6 %167391830
221NC_010323AATTG31194601194741540 %40 %20 %0 %6 %167391830
222NC_010323TTTA31203971204081225 %75 %0 %0 %8 %167391830
223NC_010323ATGA31227971228081250 %25 %25 %0 %8 %167391830
224NC_010323GTTG3122991123002120 %50 %50 %0 %8 %167391830
225NC_010323TCTT3124997125008120 %75 %0 %25 %8 %167391830
226NC_010323CCAA31252991253101250 %0 %0 %50 %8 %167391830
227NC_010323TTC5125419125433150 %66.67 %0 %33.33 %6 %167391830
228NC_010323ATT41256901257011233.33 %66.67 %0 %0 %8 %167391830
229NC_010323AATC31263941264051250 %25 %0 %25 %8 %167391830
230NC_010323ATGA31265551265651150 %25 %25 %0 %9 %167391830
231NC_010323T14128709128722140 %100 %0 %0 %7 %167391830
232NC_010323AAAATG31289401289581966.67 %16.67 %16.67 %0 %10 %167391830
233NC_010323ATT41291921292031233.33 %66.67 %0 %0 %8 %167391830
234NC_010323CTT4130368130379120 %66.67 %0 %33.33 %8 %167391830
235NC_010323ATCAT31306831306961440 %40 %0 %20 %7 %167391830
236NC_010323AAGA31310131310241275 %0 %25 %0 %8 %167391830
237NC_010323AT71313411313541450 %50 %0 %0 %7 %167391830
238NC_010323TGTT3131791131802120 %75 %25 %0 %8 %167391830
239NC_010323TTCT3132405132415110 %75 %0 %25 %9 %167391830
240NC_010323TCT4132428132438110 %66.67 %0 %33.33 %9 %167391830
241NC_010323A1213253013254112100 %0 %0 %0 %0 %167391830
242NC_010323GAAA31330221330331275 %0 %25 %0 %8 %167391830
243NC_010323CTT4133667133677110 %66.67 %0 %33.33 %9 %167391830
244NC_010323TTC6134546134564190 %66.67 %0 %33.33 %10 %167391830
245NC_010323TCTTTT3135965135982180 %83.33 %0 %16.67 %5 %167391830
246NC_010323CTTA31366311366411125 %50 %0 %25 %9 %167391830
247NC_010323GGAT31412111412221225 %25 %50 %0 %8 %167391830
248NC_010323ACTAAT41443741443962350 %33.33 %0 %16.67 %4 %167391830
249NC_010323ATAA51449781449972075 %25 %0 %0 %5 %167391830
250NC_010323GAA41450021450131266.67 %0 %33.33 %0 %8 %167391830
251NC_010323ACCGG31494151494291520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
252NC_010323C12150029150040120 %0 %0 %100 %0 %Non-Coding
253NC_010323CATAC31506671506801440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding
254NC_010323CTCCTT3151537151554180 %50 %0 %50 %5 %167391866
255NC_010323ATCA31532541532661350 %25 %0 %25 %7 %167391866
256NC_010323TGAT31533491533611325 %50 %25 %0 %7 %167391866
257NC_010323TTC4154251154261110 %66.67 %0 %33.33 %9 %167391866
258NC_010323AAAG31550901551001175 %0 %25 %0 %9 %167391866
259NC_010323TATT31561551561661225 %75 %0 %0 %8 %167391866
260NC_010323ATC41579831579931133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
261NC_010323ATC41593551593651133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %167391868
262NC_010323GAA51598211598351566.67 %0 %33.33 %0 %6 %167391868
263NC_010323A1315991715992913100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding