ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Cycas taitungensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010303	G	14	7321	7334	14	0 %	0 %	100 %	0 %	16689563
2	NC_010303	ATGA	3	15383	15394	12	50 %	25 %	25 %	0 %	16689563
3	NC_010303	ATGAA	3	17222	17236	15	60 %	20 %	20 %	0 %	16689563
4	NC_010303	ACCC	3	21452	21463	12	25 %	0 %	0 %	75 %	16689563
5	NC_010303	TATTC	3	27373	27387	15	20 %	60 %	0 %	20 %	16689563
6	NC_010303	AAGA	3	27720	27731	12	75 %	0 %	25 %	0 %	16689563
7	NC_010303	ATA	4	30321	30332	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16689563
8	NC_010303	G	13	33436	33448	13	0 %	0 %	100 %	0 %	16689563
9	NC_010303	TGGC	3	36913	36924	12	0 %	25 %	50 %	25 %	16689563
10	NC_010303	G	12	45210	45221	12	0 %	0 %	100 %	0 %	16689563
11	NC_010303	TA	9	54170	54187	18	50 %	50 %	0 %	0 %	16689563
12	NC_010303	CCCA	3	72155	72166	12	25 %	0 %	0 %	75 %	16689563
13	NC_010303	CCTA	4	74782	74797	16	25 %	25 %	0 %	50 %	16689563
14	NC_010303	AGGT	3	82897	82908	12	25 %	25 %	50 %	0 %	16689563
15	NC_010303	AATAG	3	86558	86572	15	60 %	20 %	20 %	0 %	16689563
16	NC_010303	G	12	101864	101875	12	0 %	0 %	100 %	0 %	16689563
17	NC_010303	TTG	4	103145	103156	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16689563
18	NC_010303	C	15	109269	109283	15	0 %	0 %	0 %	100 %	16689563
19	NC_010303	TTAT	3	112091	112102	12	25 %	75 %	0 %	0 %	16689563
20	NC_010303	C	12	116244	116255	12	0 %	0 %	0 %	100 %	16689563
21	NC_010303	AT	6	146823	146834	12	50 %	50 %	0 %	0 %	16689563
22	NC_010303	C	13	150270	150282	13	0 %	0 %	0 %	100 %	16689563
23	NC_010303	G	15	164615	164629	15	0 %	0 %	100 %	0 %	16689563
24	NC_010303	TA	7	171361	171374	14	50 %	50 %	0 %	0 %	16689563
25	NC_010303	TA	6	171609	171620	12	50 %	50 %	0 %	0 %	16689563
26	NC_010303	A	13	172745	172757	13	100 %	0 %	0 %	0 %	16689563
27	NC_010303	TAGG	3	173245	173256	12	25 %	25 %	50 %	0 %	16689563
28	NC_010303	TCCA	3	173729	173740	12	25 %	25 %	0 %	50 %	16689563
29	NC_010303	CGCC	3	174363	174374	12	0 %	0 %	25 %	75 %	16689563
30	NC_010303	TGC	4	174548	174559	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16689563
31	NC_010303	AATAG	3	175914	175928	15	60 %	20 %	20 %	0 %	16689563
32	NC_010303	TAGG	4	178020	178035	16	25 %	25 %	50 %	0 %	16689563
33	NC_010303	CTTTT	3	178334	178348	15	0 %	80 %	0 %	20 %	16689563
34	NC_010303	GACG	3	185878	185889	12	25 %	0 %	50 %	25 %	16689563
35	NC_010303	C	14	194916	194929	14	0 %	0 %	0 %	100 %	16689564
36	NC_010303	AAGA	3	201729	201740	12	75 %	0 %	25 %	0 %	16689564
37	NC_010303	ATAG	3	206676	206687	12	50 %	25 %	25 %	0 %	16689564
38	NC_010303	CATT	3	207599	207610	12	25 %	50 %	0 %	25 %	16689564
39	NC_010303	CATT	3	209735	209746	12	25 %	50 %	0 %	25 %	16689564
40	NC_010303	TTG	4	214478	214489	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16689564
41	NC_010303	ATTG	3	219175	219186	12	25 %	50 %	25 %	0 %	16689564
42	NC_010303	TA	7	223308	223321	14	50 %	50 %	0 %	0 %	16689564
43	NC_010303	C	15	224196	224210	15	0 %	0 %	0 %	100 %	16689564
44	NC_010303	C	12	225094	225105	12	0 %	0 %	0 %	100 %	16689564
45	NC_010303	ACCT	3	228099	228110	12	25 %	25 %	0 %	50 %	16689564
46	NC_010303	TTCT	3	228528	228539	12	0 %	75 %	0 %	25 %	16689564
47	NC_010303	TGGG	3	229129	229140	12	0 %	25 %	75 %	0 %	16689564
48	NC_010303	CAG	4	232563	232574	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16689564
49	NC_010303	AAG	5	234543	234557	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16689564
50	NC_010303	G	14	235782	235795	14	0 %	0 %	100 %	0 %	16689564
51	NC_010303	CAA	4	237910	237921	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16689564
52	NC_010303	CCTTC	3	242099	242113	15	0 %	40 %	0 %	60 %	16689564
53	NC_010303	AGTGC	3	242821	242835	15	20 %	20 %	40 %	20 %	16689564
54	NC_010303	GTA	4	258070	258081	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16689564
55	NC_010303	CATT	3	258785	258796	12	25 %	50 %	0 %	25 %	16689564
56	NC_010303	CTGG	3	264819	264830	12	0 %	25 %	50 %	25 %	16689564
57	NC_010303	ATCT	3	268466	268477	12	25 %	50 %	0 %	25 %	16689564
58	NC_010303	ATCA	3	269313	269324	12	50 %	25 %	0 %	25 %	16689564
59	NC_010303	TTCG	3	279313	279324	12	0 %	50 %	25 %	25 %	16689564
60	NC_010303	AG	7	279546	279559	14	50 %	0 %	50 %	0 %	16689564
61	NC_010303	TGGC	3	280600	280611	12	0 %	25 %	50 %	25 %	16689564
62	NC_010303	CGCT	3	284703	284714	12	0 %	25 %	25 %	50 %	16689564
63	NC_010303	GTT	4	285000	285011	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16689564
64	NC_010303	T	18	286184	286201	18	0 %	100 %	0 %	0 %	16689564
65	NC_010303	TAGAT	3	288473	288487	15	40 %	40 %	20 %	0 %	16689564
66	NC_010303	T	13	291006	291018	13	0 %	100 %	0 %	0 %	16689564
67	NC_010303	TCTT	3	293100	293111	12	0 %	75 %	0 %	25 %	16689564
68	NC_010303	C	12	294050	294061	12	0 %	0 %	0 %	100 %	16689564
69	NC_010303	CCAT	3	294287	294298	12	25 %	25 %	0 %	50 %	16689564
70	NC_010303	ACCT	3	296837	296848	12	25 %	25 %	0 %	50 %	16689564
71	NC_010303	TGCC	3	297179	297190	12	0 %	25 %	25 %	50 %	16689564
72	NC_010303	GGGT	3	297832	297843	12	0 %	25 %	75 %	0 %	16689564
73	NC_010303	CAT	4	299855	299866	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16689564
74	NC_010303	GAA	5	301752	301766	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16689564
75	NC_010303	G	14	307657	307670	14	0 %	0 %	100 %	0 %	16689564
76	NC_010303	TTA	4	313776	313787	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16689564
77	NC_010303	TTA	4	314530	314541	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16689564
78	NC_010303	AT	7	316509	316522	14	50 %	50 %	0 %	0 %	16689564
79	NC_010303	CAA	4	316988	316999	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16689564
80	NC_010303	TCTT	3	326848	326859	12	0 %	75 %	0 %	25 %	16689564
81	NC_010303	CTC	4	329683	329694	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16689564
82	NC_010303	AAGA	3	348476	348487	12	75 %	0 %	25 %	0 %	16689564
83	NC_010303	CCCG	3	355204	355215	12	0 %	0 %	25 %	75 %	16689564
84	NC_010303	ATTC	4	356995	357010	16	25 %	50 %	0 %	25 %	16689564
85	NC_010303	TGGA	3	357084	357095	12	25 %	25 %	50 %	0 %	16689564
86	NC_010303	ATTGAG	3	357339	357356	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16689564
87	NC_010303	ATGA	3	360618	360629	12	50 %	25 %	25 %	0 %	16689564
88	NC_010303	CTCG	3	361561	361572	12	0 %	25 %	25 %	50 %	16689564
89	NC_010303	CAATA	3	362440	362454	15	60 %	20 %	0 %	20 %	16689564
90	NC_010303	TCTT	3	372275	372286	12	0 %	75 %	0 %	25 %	16689564
91	NC_010303	TTTC	3	373903	373914	12	0 %	75 %	0 %	25 %	16689564
92	NC_010303	ATAA	3	375274	375285	12	75 %	25 %	0 %	0 %	16689564
93	NC_010303	ATA	4	383149	383160	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16689564
94	NC_010303	GCTT	3	384982	384993	12	0 %	50 %	25 %	25 %	16689564
95	NC_010303	AGGG	3	386243	386254	12	25 %	0 %	75 %	0 %	16689564
96	NC_010303	AT	6	389238	389249	12	50 %	50 %	0 %	0 %	16689564
97	NC_010303	TA	7	400514	400527	14	50 %	50 %	0 %	0 %	16689564
98	NC_010303	TA	6	400714	400725	12	50 %	50 %	0 %	0 %	16689564
99	NC_010303	AGGT	3	406241	406252	12	25 %	25 %	50 %	0 %	16689563
100	NC_010303	TCCA	4	406632	406647	16	25 %	25 %	0 %	50 %	16689563
101	NC_010303	CCCG	3	407316	407327	12	0 %	0 %	25 %	75 %	16689563
102	NC_010303	GTGG	3	409100	409111	12	0 %	25 %	75 %	0 %	16689563
103	NC_010303	G	14	409781	409794	14	0 %	0 %	100 %	0 %	16689563
104	NC_010303	AAGT	3	412088	412099	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Cycas taitungensis mitochondrion