Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cycas taitungensis mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_010303TGC480658075110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %16689563
2NC_010303TGC581148127140 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %16689563
3NC_010303AAT411694117051266.67 %33.33 %0 %0 %8 %16689563
4NC_010303CAT413894139051233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %16689563
5NC_010303AGA415060150711266.67 %0 %33.33 %0 %8 %16689563
6NC_010303GTG41737617386110 %33.33 %66.67 %0 %9 %16689563
7NC_010303GAG424236242471233.33 %0 %66.67 %0 %8 %16689563
8NC_010303GAA427981279931366.67 %0 %33.33 %0 %7 %16689563
9NC_010303CAT430242302521133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %16689563
10NC_010303ATA430321303321266.67 %33.33 %0 %0 %0 %16689563
11NC_010303ATT430779307901233.33 %66.67 %0 %0 %8 %16689563
12NC_010303ATC430788307991233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %16689563
13NC_010303GCC43134231352110 %0 %33.33 %66.67 %9 %16689563
14NC_010303GCG43494034950110 %0 %66.67 %33.33 %9 %16689563
15NC_010303TTC43998739998120 %66.67 %0 %33.33 %8 %16689563
16NC_010303GAA444377443881266.67 %0 %33.33 %0 %8 %16689563
17NC_010303ATA444745447561266.67 %33.33 %0 %0 %8 %16689563
18NC_010303AAG446495465051166.67 %0 %33.33 %0 %9 %16689563
19NC_010303CGA448499485101233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %16689563
20NC_010303CTT45510255114130 %66.67 %0 %33.33 %7 %16689563
21NC_010303ATA456682566941366.67 %33.33 %0 %0 %7 %16689563
22NC_010303GAA467748677591266.67 %0 %33.33 %0 %8 %16689563
23NC_010303TCT46853168542120 %66.67 %0 %33.33 %8 %16689563
24NC_010303GAA470217702281266.67 %0 %33.33 %0 %8 %16689563
25NC_010303CTG47482274833120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %16689563
26NC_010303TGC47646676476110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %16689563
27NC_010303CGG48588085891120 %0 %66.67 %33.33 %8 %16689563
28NC_010303ATG486121861331333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %16689563
29NC_010303GCT48767387684120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %16689563
30NC_010303GAA597450974631466.67 %0 %33.33 %0 %7 %16689563
31NC_010303TTG4103145103156120 %66.67 %33.33 %0 %0 %16689563
32NC_010303CGG4106962106972110 %0 %66.67 %33.33 %9 %16689563
33NC_010303TCT4119026119036110 %66.67 %0 %33.33 %9 %16689563
34NC_010303GGC4123811123822120 %0 %66.67 %33.33 %8 %16689563
35NC_010303TTA41270731270851333.33 %66.67 %0 %0 %7 %16689563
36NC_010303AGA41285261285381366.67 %0 %33.33 %0 %7 %16689563
37NC_010303TGC4137752137762110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %16689563
38NC_010303GCC4138301138311110 %0 %33.33 %66.67 %9 %16689563
39NC_010303TTC4144487144499130 %66.67 %0 %33.33 %7 %16689563
40NC_010303AAG41473391473491166.67 %0 %33.33 %0 %9 %16689563
41NC_010303CAG41483061483171233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %16689563
42NC_010303ATG41536141536251233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %16689563
43NC_010303TAA71536271536472166.67 %33.33 %0 %0 %9 %16689563
44NC_010303GCC4159502159512110 %0 %33.33 %66.67 %9 %16689563
45NC_010303CTG4165042165053120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %16689563
46NC_010303GCC4165549165561130 %0 %33.33 %66.67 %7 %16689563
47NC_010303TCA41682911683011133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %16689563
48NC_010303GGC4170039170051130 %0 %66.67 %33.33 %7 %16689563
49NC_010303CGC4170170170180110 %0 %33.33 %66.67 %9 %16689563
50NC_010303TTC4170491170501110 %66.67 %0 %33.33 %9 %16689563
51NC_010303GAA41726001726121366.67 %0 %33.33 %0 %7 %16689563
52NC_010303TAT41739871739971133.33 %66.67 %0 %0 %9 %16689563
53NC_010303TGC5174548174563160 %33.33 %33.33 %33.33 %6 %16689563
54NC_010303TCG4175532175544130 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %16689563
55NC_010303GAC41773671773791333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %16689563
56NC_010303GAA41804401804501166.67 %0 %33.33 %0 %9 %16689563
57NC_010303GAG41853501853611233.33 %0 %66.67 %0 %8 %16689563
58NC_010303GCC4187226187236110 %0 %33.33 %66.67 %9 %16689563
59NC_010303TAT41881261881381333.33 %66.67 %0 %0 %7 %16689563
60NC_010303CGC4190349190359110 %0 %33.33 %66.67 %9 %16689564
61NC_010303TTA51937191937331533.33 %66.67 %0 %0 %6 %16689564
62NC_010303TAG52031292031441633.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %16689564
63NC_010303GGA52034242034381533.33 %0 %66.67 %0 %6 %16689564
64NC_010303GAA42048712048831366.67 %0 %33.33 %0 %7 %16689564
65NC_010303CGA42097612097721233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %16689564
66NC_010303TTG4214478214492150 %66.67 %33.33 %0 %6 %16689564
67NC_010303TTA42201412201531333.33 %66.67 %0 %0 %7 %16689564
68NC_010303ATC42210692210801233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %16689564
69NC_010303ATT42230752230861233.33 %66.67 %0 %0 %8 %16689564
70NC_010303TAG42249452249551133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %16689564
71NC_010303TAG42251112251221233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %16689564
72NC_010303CAG52325632325771533.33 %0 %33.33 %33.33 %6 %16689564
73NC_010303CGG4232597232608120 %0 %66.67 %33.33 %8 %16689564
74NC_010303AAT42333292333391166.67 %33.33 %0 %0 %9 %16689564
75NC_010303AAG62345432345601866.67 %0 %33.33 %0 %5 %16689564
76NC_010303ATC42355032355131133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %16689564
77NC_010303CAA42379102379211266.67 %0 %0 %33.33 %0 %16689564
78NC_010303GTA42388112388211133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %16689564
79NC_010303ATA42392892393001266.67 %33.33 %0 %0 %8 %16689564
80NC_010303CAA42396002396101166.67 %0 %0 %33.33 %9 %16689564
81NC_010303AAC42484112484221266.67 %0 %0 %33.33 %8 %16689564
82NC_010303AGA42492372492471166.67 %0 %33.33 %0 %9 %16689564
83NC_010303GTC4252243252254120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %16689564
84NC_010303TCT4254870254880110 %66.67 %0 %33.33 %9 %16689564
85NC_010303GTA72580612580812133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %16689564
86NC_010303CAA42608482608591266.67 %0 %0 %33.33 %8 %16689564
87NC_010303TCT4269386269396110 %66.67 %0 %33.33 %9 %16689564
88NC_010303TAG42716852716961233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %16689564
89NC_010303TCT5278158278171140 %66.67 %0 %33.33 %7 %16689564
90NC_010303GTT5285000285014150 %66.67 %33.33 %0 %6 %16689564
91NC_010303CAA42858822858921166.67 %0 %0 %33.33 %9 %16689564
92NC_010303TAA42874882874991266.67 %33.33 %0 %0 %8 %16689564
93NC_010303TCT4288550288560110 %66.67 %0 %33.33 %9 %16689564
94NC_010303TGC4290312290322110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %16689564
95NC_010303CTG4291415291426120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %16689564
96NC_010303TCT4292172292182110 %66.67 %0 %33.33 %9 %16689564
97NC_010303CAT52998512998661633.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %16689564
98NC_010303GAA53017523017661566.67 %0 %33.33 %0 %0 %16689564
99NC_010303TCG4305754305764110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %16689564
100NC_010303GAA43120003120121366.67 %0 %33.33 %0 %7 %16689564
101NC_010303TTA43137763137871233.33 %66.67 %0 %0 %0 %16689564
102NC_010303TTA43145303145411233.33 %66.67 %0 %0 %0 %16689564
103NC_010303GAG43167233167341233.33 %0 %66.67 %0 %8 %16689564
104NC_010303CAA53169883170021566.67 %0 %0 %33.33 %6 %16689564
105NC_010303TTC4329408329419120 %66.67 %0 %33.33 %8 %16689564
106NC_010303CTC4329683329694120 %33.33 %0 %66.67 %0 %16689564
107NC_010303ATG43331003331101133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %16689564
108NC_010303GAT43333583333681133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %16689564
109NC_010303ATT43361943362041133.33 %66.67 %0 %0 %9 %16689564
110NC_010303GGA43406213406321233.33 %0 %66.67 %0 %8 %16689564
111NC_010303GAA43427723427821166.67 %0 %33.33 %0 %9 %16689564
112NC_010303CTC4343543343554120 %33.33 %0 %66.67 %8 %16689564
113NC_010303TTG4343741343753130 %66.67 %33.33 %0 %7 %16689564
114NC_010303GAA43528773528871166.67 %0 %33.33 %0 %9 %16689564
115NC_010303GAG43542313542411133.33 %0 %66.67 %0 %9 %16689564
116NC_010303TTC4364027364038120 %66.67 %0 %33.33 %8 %16689564
117NC_010303TAA43660983661081166.67 %33.33 %0 %0 %9 %16689564
118NC_010303ATT43661803661921333.33 %66.67 %0 %0 %7 %16689564
119NC_010303CAC43703193703291133.33 %0 %0 %66.67 %9 %16689564
120NC_010303AAT43749143749251266.67 %33.33 %0 %0 %8 %16689564
121NC_010303TAA43776443776551266.67 %33.33 %0 %0 %8 %16689564
122NC_010303GCC4378167378178120 %0 %33.33 %66.67 %8 %16689564
123NC_010303GCA43811133811241233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %16689564
124NC_010303TAA43812913813021266.67 %33.33 %0 %0 %8 %16689564
125NC_010303TCA43816843816951233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %16689564
126NC_010303ATA43831493831601266.67 %33.33 %0 %0 %0 %16689564
127NC_010303TCC4384211384222120 %33.33 %0 %66.67 %8 %16689564
128NC_010303AAG43861323861431266.67 %0 %33.33 %0 %8 %16689564
129NC_010303CGG4386277386287110 %0 %66.67 %33.33 %9 %16689564
130NC_010303CGC4387666387677120 %0 %33.33 %66.67 %8 %16689564
131NC_010303TCA43900313900421233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %16689564
132NC_010303GCT4400203400214120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %16689564
133NC_010303AGG44072394072501233.33 %0 %66.67 %0 %8 %16689563
134NC_010303GGA44087404087511233.33 %0 %66.67 %0 %8 %16689563
135NC_010303GCC4410699410711130 %0 %33.33 %66.67 %7 %16689563
136NC_010303CTA44130244130341133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding