ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Manduca sexta mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010266	TTTAT	3	138	152	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_010266	TTTTA	3	299	312	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	165932396
3	NC_010266	TAT	4	720	731	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	165932396
4	NC_010266	TTTA	3	860	871	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	165932396
5	NC_010266	ATT	4	1042	1054	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	165932396
6	NC_010266	TAA	4	1058	1070	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	165932396
7	NC_010266	TTTA	3	1266	1277	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	165932396
8	NC_010266	TAT	5	2051	2065	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	165932397
9	NC_010266	GGA	4	2143	2153	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	165932397
10	NC_010266	ATT	4	3326	3336	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	165932398
11	NC_010266	ATA	4	3466	3477	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	165932398
12	NC_010266	AATT	3	3746	3756	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	165932398
13	NC_010266	T	14	3964	3977	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	165932399
14	NC_010266	ATT	5	3975	3989	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	165932399
15	NC_010266	ATT	4	4006	4016	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	165932399
16	NC_010266	TAA	4	4037	4048	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	165932399
17	NC_010266	TAATT	3	4123	4136	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	165932400
18	NC_010266	TTTAAC	3	4381	4398	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	165932400
19	NC_010266	AATT	3	4441	4451	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	165932400
20	NC_010266	ATT	4	4654	4666	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	165932400
21	NC_010266	AATT	5	4757	4776	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	165932400
22	NC_010266	AAT	4	4876	4886	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	165932401
23	NC_010266	ATTT	3	4908	4919	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	165932401
24	NC_010266	TTA	4	4924	4934	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	165932401
25	NC_010266	TAA	4	5652	5663	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	165932402
26	NC_010266	TAT	5	5932	5945	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	165932402
27	NC_010266	ATT	5	6168	6183	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_010266	ATTA	4	6195	6210	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_010266	AT	6	6494	6506	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	165932403
30	NC_010266	AAT	4	6504	6515	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	165932403
31	NC_010266	TAAA	3	6530	6541	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	165932403
32	NC_010266	ATA	4	6926	6937	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	165932403
33	NC_010266	A	12	7067	7078	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	165932403
34	NC_010266	TAA	5	7461	7474	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	165932403
35	NC_010266	TGAA	3	7548	7558	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	165932403
36	NC_010266	ATA	4	7645	7656	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	165932403
37	NC_010266	ATCC	3	7859	7871	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	165932403
38	NC_010266	AAT	4	7878	7889	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	165932403
39	NC_010266	TAA	4	7898	7910	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	165932403
40	NC_010266	AT	6	7970	7980	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	165932403
41	NC_010266	AAAT	3	8111	8122	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	165932403
42	NC_010266	A	15	8176	8190	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	165932403
43	NC_010266	ATT	4	8314	8324	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	165932404
44	NC_010266	ATA	4	8345	8357	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	165932404
45	NC_010266	TAAA	3	9102	9112	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	165932404
46	NC_010266	TAA	4	9239	9251	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	165932404
47	NC_010266	AAAAT	3	9275	9288	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	165932404
48	NC_010266	TA	12	9635	9656	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_010266	ATA	4	9848	9859	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	165932405
50	NC_010266	A	13	9856	9868	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	165932405
51	NC_010266	T	14	9989	10002	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	165932405
52	NC_010266	TATAAT	3	10155	10172	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	165932406
53	NC_010266	ATTTT	4	10281	10300	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	165932406
54	NC_010266	TTTA	3	10326	10337	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	165932406
55	NC_010266	TAA	4	10377	10388	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	165932406
56	NC_010266	TTTTA	3	10400	10413	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	165932406
57	NC_010266	ATTT	4	10585	10600	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	165932406
58	NC_010266	TTAA	3	10655	10665	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	165932406
59	NC_010266	AAAT	3	10668	10679	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_010266	TCTT	3	10956	10966	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	165932407
61	NC_010266	ATT	5	11043	11056	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	165932407
62	NC_010266	ATTT	3	11281	11291	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	165932407
63	NC_010266	AATTTT	3	11585	11602	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	165932407
64	NC_010266	ATT	4	11660	11670	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	165932407
65	NC_010266	TAAT	5	11845	11865	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_010266	TATT	3	11916	11927	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_010266	TATTAA	4	11928	11951	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_010266	ATAAA	3	12552	12565	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	165932408
69	NC_010266	AAT	7	12651	12671	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	165932408
70	NC_010266	TAA	4	12802	12813	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	165932408
71	NC_010266	TA	7	12895	12908	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_010266	TA	6	13462	13472	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_010266	T	15	13713	13727	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_010266	ATTTAA	4	13810	13833	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_010266	TTAA	3	14100	14111	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010266	TTTAT	4	14319	14338	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
77	NC_010266	ATTC	3	14341	14352	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
78	NC_010266	AATT	4	14354	14368	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_010266	AAATT	3	14525	14539	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_010266	ATTT	3	14558	14569	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_010266	TA	6	15204	15215	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_010266	T	23	15217	15239	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_010266	TTAAT	3	15247	15261	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_010266	TA	11	15388	15410	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_010266	ATA	6	15429	15446	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
86	NC_010266	ATT	4	15460	15470	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

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