ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Aedes aegypti mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010241	TAA	4	299	310	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164523400
2	NC_010241	AAT	5	327	342	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	164523400
3	NC_010241	ATTAA	3	429	443	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	164523400
4	NC_010241	TTAT	3	666	676	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	164523400
5	NC_010241	TTTAAC	3	1017	1034	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	164523400
6	NC_010241	ATT	4	1059	1071	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	164523400
7	NC_010241	TTAAT	3	1075	1088	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	164523400
8	NC_010241	CT	6	1680	1690	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	164523401
9	NC_010241	TAATTA	3	2988	3005	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	164523402
10	NC_010241	TTTAAC	4	4195	4218	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	4 %	164523404
11	NC_010241	CA	6	4262	4272	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	164523404
12	NC_010241	TTTC	3	4861	4872	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	164523405
13	NC_010241	ATTT	3	5234	5245	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	164523405
14	NC_010241	ATT	5	5438	5451	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_010241	ATT	4	5462	5473	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164523406
16	NC_010241	TTAA	3	5672	5682	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	164523406
17	NC_010241	TTTA	3	6124	6134	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_010241	ATT	4	6285	6295	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	164523407
19	NC_010241	A	22	6792	6813	22	100 %	0 %	0 %	0 %	9 %	164523407
20	NC_010241	TAA	4	7200	7211	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164523407
21	NC_010241	AAG	4	7340	7351	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	164523407
22	NC_010241	TTA	4	7640	7651	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164523407
23	NC_010241	TAAA	3	7881	7893	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	164523407
24	NC_010241	AAAT	4	8936	8950	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	164523408
25	NC_010241	AAAAT	3	9025	9038	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	164523408
26	NC_010241	A	14	9330	9343	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	164523408
27	NC_010241	AT	7	9640	9653	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	164523409
28	NC_010241	AAGA	3	9731	9741	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_010241	TTTA	3	9986	9997	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	164523410
30	NC_010241	TAA	4	10127	10138	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164523410
31	NC_010241	ATTA	4	10235	10250	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	164523410
32	NC_010241	ATT	4	10677	10687	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	164523411
33	NC_010241	AATAA	3	11583	11597	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	164523412
34	NC_010241	A	14	11688	11701	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	164523412
35	NC_010241	TAAAA	3	11714	11728	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	164523412
36	NC_010241	AT	6	11957	11967	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	164523412
37	NC_010241	TAAA	3	12009	12020	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	164523412
38	NC_010241	TAAT	6	13678	13701	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_010241	ATT	4	13848	13859	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_010241	A	15	13869	13883	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010241	TTTTAA	3	14388	14406	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
42	NC_010241	TAAA	5	14464	14482	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
43	NC_010241	ATA	5	14727	14741	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_010241	ATT	4	14790	14801	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_010241	AAAAT	3	14802	14816	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_010241	AATT	3	14840	14850	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_010241	TATT	3	14936	14947	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010241	AATT	3	15021	15031	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_010241	TATT	3	15117	15128	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010241	TATT	3	15299	15310	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010241	AATT	3	15384	15394	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_010241	TATT	3	15480	15491	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010241	AATT	3	15565	15575	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_010241	T	23	15716	15738	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_010241	AT	12	15782	15804	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_010241	TA	10	15851	15872	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_010241	TAAA	4	15881	15896	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_010241	AT	7	15929	15944	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_010241	TA	9	15956	15972	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
60	NC_010241	TAAT	3	15991	16002	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010241	TAT	4	16103	16114	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_010241	TA	7	16177	16192	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_010241	AT	8	16615	16630	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Aedes aegypti mitochondrion