ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Oxya chinensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010219	GTAAA	3	36	49	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_010219	TAT	4	413	424	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164420922
3	NC_010219	TTAATT	3	829	846	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	164420922
4	NC_010219	AAAC	3	850	861	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	164420922
5	NC_010219	TTA	4	928	939	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164420922
6	NC_010219	AAT	4	1504	1515	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164420923
7	NC_010219	TAT	5	1989	2003	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	164420923
8	NC_010219	TGG	4	2077	2088	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	164420923
9	NC_010219	TAT	5	2812	2825	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	164420923
10	NC_010219	TAT	4	3107	3118	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164420924
11	NC_010219	AATT	3	3905	3917	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	164420925
12	NC_010219	TAT	4	4596	4607	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164420926
13	NC_010219	TAA	4	6072	6082	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_010219	AATAA	7	6304	6336	33	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	164420929
15	NC_010219	CAAA	3	6342	6352	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	164420929
16	NC_010219	TA	6	6407	6418	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	164420929
17	NC_010219	AAAAAT	3	6886	6904	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	164420929
18	NC_010219	TTA	4	7180	7191	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164420929
19	NC_010219	TGAA	3	7373	7383	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	164420929
20	NC_010219	CCAA	3	7541	7551	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	164420929
21	NC_010219	AAT	4	7763	7774	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164420929
22	NC_010219	AAAT	3	7956	7966	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	164420929
23	NC_010219	TAA	4	8165	8175	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	164420930
24	NC_010219	ATAA	3	8284	8295	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	164420930
25	NC_010219	AAT	4	9144	9154	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	164420930
26	NC_010219	ATAA	3	9426	9437	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	164420930
27	NC_010219	AAT	4	9564	9575	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164420931
28	NC_010219	TAA	4	9601	9612	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164420931
29	NC_010219	TAA	4	9876	9887	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164420932
30	NC_010219	TTTA	3	10063	10074	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	164420932
31	NC_010219	AAT	5	10303	10317	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	164420932
32	NC_010219	ATTT	3	10316	10327	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	164420932
33	NC_010219	TA	6	10731	10742	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	164420933
34	NC_010219	TAG	4	11389	11400	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	164420933
35	NC_010219	TAAAA	3	12240	12253	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	164420934
36	NC_010219	AAATTT	3	13388	13406	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
37	NC_010219	ATT	4	13529	13540	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_010219	TAAA	3	13554	13564	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_010219	TAAA	3	13583	13594	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_010219	TAAT	4	13858	13874	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
41	NC_010219	TAAA	3	14095	14106	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_010219	ATAATT	3	14107	14124	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
43	NC_010219	AATTA	4	14172	14190	19	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
44	NC_010219	AATTA	3	14728	14742	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010219	A	16	14891	14906	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_010219	ACA	4	14952	14963	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
47	NC_010219	TA	7	14969	14982	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_010219	T	12	15045	15056	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_010219	TAA	8	15110	15132	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_010219	AGAA	3	15400	15410	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Oxya chinensis mitochondrion