ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Hydra oligactis mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010214	AAAT	3	1646	1657	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_010214	TAA	4	2174	2184	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_010214	ATT	4	3199	3210	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_010214	TTTA	3	3274	3284	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	164420810
5	NC_010214	TAT	4	3546	3557	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164420810
6	NC_010214	TAT	4	4038	4052	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	164420811
7	NC_010214	ATTT	4	4405	4419	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	164420812
8	NC_010214	TTTA	3	4428	4439	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	164420812
9	NC_010214	TAA	4	4787	4798	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164420812
10	NC_010214	CTT	4	5177	5187	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	164420813
11	NC_010214	TTTA	3	5408	5418	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	164420813
12	NC_010214	TA	8	5653	5668	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	164420813
13	NC_010214	ATA	4	5908	5919	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164420814
14	NC_010214	TAT	4	5964	5974	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	164420814
15	NC_010214	AAT	5	5976	5990	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	164420814
16	NC_010214	TTA	4	6004	6015	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164420814
17	NC_010214	TATT	4	6578	6593	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	164420814
18	NC_010214	TAT	4	6606	6617	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164420814
19	NC_010214	AAT	4	6676	6686	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	164420814
20	NC_010214	TAA	4	6701	6712	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164420814
21	NC_010214	TTATA	3	6962	6976	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	164420814
22	NC_010214	ATTT	4	6979	6993	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	164420814
23	NC_010214	TTTA	3	8017	8029	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	164420815
24	NC_010214	AAT	4	8354	8365	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164420815
25	NC_010214	TTAA	3	8459	8469	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	164420815
26	NC_010214	TTAT	3	8618	8628	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	164420815
27	NC_010214	TTAAT	3	8862	8876	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	164420815
28	NC_010214	GAAA	3	9036	9047	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_010214	GATT	3	9209	9219	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_010214	TTATT	3	9247	9260	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_010214	TTAA	3	9324	9334	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_010214	T	16	9776	9791	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	164420816
33	NC_010214	AT	6	9935	9945	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	164420816
34	NC_010214	TAA	4	10258	10269	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164420816
35	NC_010214	ATTT	5	10325	10344	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	164420817
36	NC_010214	TAT	4	10599	10609	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	164420817
37	NC_010214	AAT	4	10718	10730	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	164420818
38	NC_010214	TAT	4	10768	10779	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164420818
39	NC_010214	AT	6	10845	10855	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	164420818
40	NC_010214	TAA	5	11001	11015	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	164420819
41	NC_010214	TATT	3	11738	11749	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	164420819
42	NC_010214	ATAAT	3	11980	11993	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	164420820
43	NC_010214	ATT	5	12051	12064	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	164420820
44	NC_010214	ATT	4	12285	12296	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164420820
45	NC_010214	TAA	4	12533	12544	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	164420820
46	NC_010214	ATT	4	12769	12780	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	164420820
47	NC_010214	ATT	4	12963	12975	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	164420820
48	NC_010214	AACA	3	16268	16279	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Hydra oligactis mitochondrion