ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Lemna minor chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_010109ATT42622731233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
2NC_010109ATA42812921266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
3NC_010109CTTTTT3401419190 %83.33 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
4NC_010109CAG4114911601233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %161784174
5NC_010109AAGT3125512651150 %25 %25 %0 %9 %161784174
6NC_010109TGT436223632110 %66.67 %33.33 %0 %9 %161784173
7NC_010109TTAAA3453945531560 %40 %0 %0 %0 %Non-Coding
8NC_010109T1548354849150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
9NC_010109TTTA3508850981125 %75 %0 %0 %9 %161784172
10NC_010109TCTCT351285141140 %60 %0 %40 %7 %161784172
11NC_010109TTAA3528352931150 %50 %0 %0 %9 %161784172
12NC_010109TTAAA4535253701960 %40 %0 %0 %5 %161784172
13NC_010109A165368538316100 %0 %0 %0 %6 %161784172
14NC_010109AAAC3608560971375 %0 %0 %25 %7 %161784172
15NC_010109CAAA3639864091275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
16NC_010109GGATTT3753375511916.67 %50 %33.33 %0 %10 %Non-Coding
17NC_010109ACTT3759176011125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
18NC_010109TTTA3806280731225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
19NC_010109TAA4823282421166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
20NC_010109GA6861486251250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
21NC_010109AATTT3880388161440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
22NC_010109TAA4906590761266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
23NC_010109TAT4909191021233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
24NC_010109ATA4910191111166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_010109ATA4912091301166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
26NC_010109AT7918191941450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
27NC_010109AT7926292751450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
28NC_010109TTTA3962296321125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
29NC_010109TAT4971297241333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
30NC_010109AAAGA310013100261480 %0 %20 %0 %7 %Non-Coding
31NC_010109TTAT310180101901125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
32NC_010109TTCT31073610747120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
33NC_010109TA811205112191550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
34NC_010109TTTA513785138052125 %75 %0 %0 %9 %161784178
35NC_010109TA613804138141150 %50 %0 %0 %9 %161784178
36NC_010109A16142811429616100 %0 %0 %0 %6 %161784178
37NC_010109T141456514578140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
38NC_010109TAATT314606146191440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
39NC_010109TTTA514626146441925 %75 %0 %0 %5 %Non-Coding
40NC_010109A14152241523714100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
41NC_010109TA615676156871250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
42NC_010109ATA415770157811266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
43NC_010109AT616718167281150 %50 %0 %0 %9 %161784180
44NC_010109TAA516991170051566.67 %33.33 %0 %0 %6 %161784181
45NC_010109A15177381775215100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
46NC_010109AATC317936179471250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
47NC_010109TCAA318170181811250 %25 %0 %25 %8 %161784182
48NC_010109CTAT319525195351125 %50 %0 %25 %9 %161784182
49NC_010109T131993719949130 %100 %0 %0 %7 %161784182
50NC_010109GAAT320342203521150 %25 %25 %0 %9 %161784182
51NC_010109GA620559205701250 %0 %50 %0 %8 %161784182
52NC_010109TTCA324035240461225 %50 %0 %25 %8 %161784183
53NC_010109GAAT324143241531150 %25 %25 %0 %9 %161784183
54NC_010109GTT42495724968120 %66.67 %33.33 %0 %8 %161784183
55NC_010109CTT42683926850120 %66.67 %0 %33.33 %8 %161784184
56NC_010109TTTA327299273091125 %75 %0 %0 %9 %161784184
57NC_010109AGAAA327612276261580 %0 %20 %0 %6 %161784184
58NC_010109AT728323283351350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
59NC_010109CATA328858288691250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
60NC_010109ATA428939289501266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
61NC_010109TATTGA329085291031933.33 %50 %16.67 %0 %10 %Non-Coding
62NC_010109CTTT32926529276120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
63NC_010109TAAA429301293171775 %25 %0 %0 %5 %Non-Coding
64NC_010109A12299682997912100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
65NC_010109AAT431012310221166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
66NC_010109ATTT331350313621325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
67NC_010109ATT431669316811333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
68NC_010109ATA431870318821366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
69NC_010109TTA432434324441133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
70NC_010109AAT432555325661266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
71NC_010109TATT332956329671225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
72NC_010109ATA432982329941366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
73NC_010109AAT433067330781266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
74NC_010109ATT433576335871233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
75NC_010109TAAAA334073340871580 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
76NC_010109TTAT334356343681325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
77NC_010109TAT434422344341333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
78NC_010109AAATA334630346441580 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
79NC_010109A15348433485715100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
80NC_010109AAT435515355251166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
81NC_010109TG63582735838120 %50 %50 %0 %8 %Non-Coding
82NC_010109GAAA337544375551275 %0 %25 %0 %8 %171259350
83NC_010109TTG43794937959110 %66.67 %33.33 %0 %9 %171259350
84NC_010109AATA338601386121275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
85NC_010109GA638628386391250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
86NC_010109TA638805388161250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
87NC_010109ATCAT439359393771940 %40 %0 %20 %10 %Non-Coding
88NC_010109AT1139477394962050 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
89NC_010109TAGA339722397321150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
90NC_010109TCTA339755397651125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
91NC_010109TCT44028540295110 %66.67 %0 %33.33 %9 %161784190
92NC_010109TAT540337403501433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
93NC_010109AACT340450404611250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
94NC_010109AAG442933429431166.67 %0 %33.33 %0 %9 %161784192
95NC_010109AATG343332433431250 %25 %25 %0 %8 %161784192
96NC_010109CTA443402434131233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %161784192
97NC_010109TATC345057450671125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
98NC_010109ATT445097451071133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
99NC_010109TTATT345600456141520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
100NC_010109TTC44618946201130 %66.67 %0 %33.33 %7 %161784193
101NC_010109TA646204462141150 %50 %0 %0 %9 %161784193
102NC_010109CTTT44656846582150 %75 %0 %25 %6 %161784193
103NC_010109T134696646978130 %100 %0 %0 %7 %161784193
104NC_010109T144748847501140 %100 %0 %0 %7 %161784193
105NC_010109A18475484756518100 %0 %0 %0 %5 %161784193
106NC_010109A12478054781612100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
107NC_010109ATAA348308483181175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
108NC_010109CT64862648636110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
109NC_010109AT650397504071150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
110NC_010109AT650427504371150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
111NC_010109TA750485504991550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
112NC_010109GGAAA350960509731460 %0 %40 %0 %7 %Non-Coding
113NC_010109TA851645516601650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
114NC_010109AAT451786517981366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
115NC_010109CATAAA354192542101966.67 %16.67 %0 %16.67 %10 %161784197
116NC_010109TTCTA354372543861520 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
117NC_010109A13544505446213100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
118NC_010109A13555965560813100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
119NC_010109TA655607556191350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
120NC_010109TA655625556351150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
121NC_010109ATT459328593401333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
122NC_010109TAAATC361395614131950 %33.33 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
123NC_010109ATTT363122631321125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
124NC_010109AT1063367633872150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
125NC_010109TAA463473634851366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
126NC_010109TA863510635241550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
127NC_010109ATAAA363544635591680 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
128NC_010109TCC46501365024120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
129NC_010109AATTC365234652481540 %40 %0 %20 %6 %Non-Coding
130NC_010109T136575965771130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
131NC_010109AATT365841658521250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
132NC_010109TAAA365930659411275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
133NC_010109A17659816599717100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
134NC_010109AATG366660666711250 %25 %25 %0 %0 %161784204
135NC_010109AAT466873668841266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
136NC_010109AAAG367548675591275 %0 %25 %0 %8 %161784205
137NC_010109TCTT36813868150130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
138NC_010109AAT468195682051166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
139NC_010109TTAA368351683621250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
140NC_010109TTTC36921169222120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
141NC_010109TAATA370127701401460 %40 %0 %0 %7 %Non-Coding
142NC_010109TAAA370432704431275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
143NC_010109TATT370520705321325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
144NC_010109GAATTT370752707701933.33 %50 %16.67 %0 %10 %Non-Coding
145NC_010109TATT370781707921225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
146NC_010109AAGA471768717831675 %0 %25 %0 %6 %Non-Coding
147NC_010109ATTA372405724161250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
148NC_010109GTT47248672497120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
149NC_010109TATT373366733771225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
150NC_010109TAA473384733941166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
151NC_010109TCTTT37450874522150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
152NC_010109TTTA575426754441925 %75 %0 %0 %10 %161784216
153NC_010109TTA475710757221333.33 %66.67 %0 %0 %7 %161784216
154NC_010109T147574975762140 %100 %0 %0 %7 %161784216
155NC_010109CAAT376762767741350 %25 %0 %25 %7 %161784216
156NC_010109AAATT376939769521460 %40 %0 %0 %7 %161784216
157NC_010109TA677301773131350 %50 %0 %0 %7 %161784216
158NC_010109TTTAT379026790391420 %80 %0 %0 %7 %161784216
159NC_010109TAAA379196792061175 %25 %0 %0 %9 %161784216
160NC_010109TTAG379724797351225 %50 %25 %0 %8 %161784216
161NC_010109TTTC37981979830120 %75 %0 %25 %8 %161784216
162NC_010109TTTC38007280082110 %75 %0 %25 %9 %161784216
163NC_010109CATG381634816461325 %25 %25 %25 %7 %161784216
164NC_010109TTCTA381701817141420 %60 %0 %20 %7 %161784216
165NC_010109ATAC381773817831150 %25 %0 %25 %9 %161784216
166NC_010109T158278282796150 %100 %0 %0 %6 %161784216
167NC_010109TTA483869838791133.33 %66.67 %0 %0 %9 %161784216
168NC_010109ATTCT484597846172120 %60 %0 %20 %9 %161784216
169NC_010109GAA485761857711166.67 %0 %33.33 %0 %9 %161784216
170NC_010109GGTTAT386245862631916.67 %50 %33.33 %0 %10 %161784216
171NC_010109ATT486537865481233.33 %66.67 %0 %0 %8 %161784216
172NC_010109T128765787668120 %100 %0 %0 %8 %161784216
173NC_010109ATT588930889451633.33 %66.67 %0 %0 %6 %161784216
174NC_010109ATT588952889661533.33 %66.67 %0 %0 %6 %161784216
175NC_010109ATT488973889851333.33 %66.67 %0 %0 %7 %161784216
176NC_010109TAT588998890131633.33 %66.67 %0 %0 %6 %161784216
177NC_010109AT689009890191150 %50 %0 %0 %9 %161784216
178NC_010109TAT489039890501233.33 %66.67 %0 %0 %8 %161784216
179NC_010109GAT491411914211133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %161784216
180NC_010109GAA493073930841266.67 %0 %33.33 %0 %0 %161784216
181NC_010109TTCT39312393133110 %75 %0 %25 %9 %161784216
182NC_010109CTTT39431694326110 %75 %0 %25 %9 %161784216
183NC_010109GAT494471944821233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %161784216
184NC_010109TGAT396159961711325 %50 %25 %0 %7 %161784216
185NC_010109TGA496210962211233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %161784216
186NC_010109AATA397066970781375 %25 %0 %0 %7 %161784216
187NC_010109TTTC39712897139120 %75 %0 %25 %8 %161784216
188NC_010109TA1199847998682250 %50 %0 %0 %9 %161784216
189NC_010109ATA499886998961166.67 %33.33 %0 %0 %9 %161784216
190NC_010109TAA499920999311266.67 %33.33 %0 %0 %0 %161784216
191NC_010109TTTGTT3103189103207190 %83.33 %16.67 %0 %10 %161784216
192NC_010109TAC41040791040901233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %161784216
193NC_010109TTCTT3104920104934150 %80 %0 %20 %6 %161784256
194NC_010109ATCC31082511082621225 %25 %0 %50 %8 %161784256
195NC_010109GAGG31113031113141225 %0 %75 %0 %8 %161784256
196NC_010109AGGT31115151115261225 %25 %50 %0 %8 %161784256
197NC_010109TAAG31126351126451150 %25 %25 %0 %9 %161784256
198NC_010109TATATC31143751143911733.33 %50 %0 %16.67 %5 %161784256
199NC_010109AAAT31146251146351175 %25 %0 %0 %9 %161784256
200NC_010109GGAA31147251147351150 %0 %50 %0 %9 %161784256
201NC_010109TTA41147811147921233.33 %66.67 %0 %0 %8 %161784256
202NC_010109ATT41151331151441233.33 %66.67 %0 %0 %8 %161784256
203NC_010109GAA41154221154331266.67 %0 %33.33 %0 %8 %161784256
204NC_010109AGAA31155891156011375 %0 %25 %0 %7 %161784256
205NC_010109AAAT31164351164451175 %25 %0 %0 %9 %161784256
206NC_010109GGGT3116861116873130 %25 %75 %0 %7 %161784256
207NC_010109GAG41169041169151233.33 %0 %66.67 %0 %8 %161784256
208NC_010109TAAA31174271174371175 %25 %0 %0 %9 %161784256
209NC_010109ATCAA31181021181151460 %20 %0 %20 %7 %161784256
210NC_010109GAAT31183841183951250 %25 %25 %0 %8 %161784256
211NC_010109AAAG31193811193911175 %0 %25 %0 %9 %161784256
212NC_010109GATA31198021198121150 %25 %25 %0 %9 %161784256
213NC_010109ATT41198931199041233.33 %66.67 %0 %0 %8 %161784256
214NC_010109GT6120279120289110 %50 %50 %0 %9 %161784256
215NC_010109AGTG31202901203011225 %25 %50 %0 %8 %161784256
216NC_010109A1412062012063314100 %0 %0 %0 %0 %161784256
217NC_010109ATT41209471209581233.33 %66.67 %0 %0 %8 %161784256
218NC_010109TTC4122030122040110 %66.67 %0 %33.33 %9 %161784256
219NC_010109AGTA31221201221311250 %25 %25 %0 %0 %161784256
220NC_010109AAG41226301226411266.67 %0 %33.33 %0 %8 %161784256
221NC_010109TTG4123373123384120 %66.67 %33.33 %0 %8 %161784256
222NC_010109TTTA31234951235061225 %75 %0 %0 %8 %161784256
223NC_010109GAA41235501235611266.67 %0 %33.33 %0 %8 %161784256
224NC_010109AATT31258731258841250 %50 %0 %0 %8 %161784256
225NC_010109TTA41267591267701233.33 %66.67 %0 %0 %8 %161784256
226NC_010109TAATT31288181288321540 %60 %0 %0 %6 %161784256
227NC_010109GAT41289451289561233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %161784256
228NC_010109TA61291021291121150 %50 %0 %0 %9 %161784256
229NC_010109ATTG31292541292661325 %50 %25 %0 %7 %161784256
230NC_010109ATTT31298361298471225 %75 %0 %0 %8 %161784256
231NC_010109AT61307661307801550 %50 %0 %0 %6 %161784256
232NC_010109TGAT31312161312281325 %50 %25 %0 %7 %161784256
233NC_010109TC6134356134367120 %50 %0 %50 %8 %161784256
234NC_010109AAT41349051349161266.67 %33.33 %0 %0 %8 %161784256
235NC_010109T19135230135248190 %100 %0 %0 %5 %161784256
236NC_010109TA71353131353261450 %50 %0 %0 %7 %161784256
237NC_010109ATTT51353551353742025 %75 %0 %0 %10 %161784256
238NC_010109TA71355981356101350 %50 %0 %0 %7 %161784256
239NC_010109TAAT31373051373161250 %50 %0 %0 %8 %161784256
240NC_010109TTTC3138930138941120 %75 %0 %25 %8 %161784256
241NC_010109ATTT31394181394281125 %75 %0 %0 %9 %161784256
242NC_010109TTCT3139514139524110 %75 %0 %25 %9 %161784256
243NC_010109TCT4140428140439120 %66.67 %0 %33.33 %8 %161784256
244NC_010109AAT41407191407301266.67 %33.33 %0 %0 %8 %161784256
245NC_010109TTCC3141128141138110 %50 %0 %50 %9 %161784256
246NC_010109ATTT31412281412381125 %75 %0 %0 %9 %161784256
247NC_010109GATATA31414721414881750 %33.33 %16.67 %0 %5 %161784256
248NC_010109GA61425321425421150 %0 %50 %0 %9 %161784256
249NC_010109ATTTT31425861426001520 %80 %0 %0 %6 %161784256
250NC_010109AAAG31427731427831175 %0 %25 %0 %9 %161784256
251NC_010109CTTA31432181432281125 %50 %0 %25 %9 %161784256
252NC_010109GGAT31476011476121225 %25 %50 %0 %8 %161784256
253NC_010109ACTAAT31509081509241750 %33.33 %0 %16.67 %5 %161784256
254NC_010109AGAAA31509251509391580 %0 %20 %0 %6 %161784256
255NC_010109GTA41517731517841233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %161784256
256NC_010109TAT41559331559441233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
257NC_010109AT111559961560172250 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
258NC_010109TGAA31587231587341250 %25 %25 %0 %8 %161784254
259NC_010109TTCT3159595159605110 %75 %0 %25 %9 %161784254
260NC_010109ATCA31596921597041350 %25 %0 %25 %7 %161784254
261NC_010109ATC41613811613921233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %161784254
262NC_010109AAAG31615371615471175 %0 %25 %0 %9 %161784254
263NC_010109ATTT31626031626141225 %75 %0 %0 %8 %161784254
264NC_010109TCT4162780162791120 %66.67 %0 %33.33 %8 %161784254
265NC_010109ATC41644421644521133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding