ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lemna minor chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010109	ATT	4	262	273	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_010109	ATA	4	281	292	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_010109	CAG	4	1149	1160	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	161784174
4	NC_010109	TGT	4	3622	3632	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	161784173
5	NC_010109	TAA	4	8232	8242	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_010109	TAA	4	9065	9076	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_010109	TAT	4	9091	9102	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_010109	ATA	4	9101	9111	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_010109	ATA	4	9120	9130	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_010109	TAT	4	9712	9724	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_010109	ATA	4	15770	15781	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_010109	TAA	5	16991	17005	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	161784181
13	NC_010109	GTT	4	24957	24968	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	161784183
14	NC_010109	CTT	4	26839	26850	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	161784184
15	NC_010109	ATA	4	28939	28950	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_010109	AAT	4	31012	31022	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_010109	ATT	4	31669	31681	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_010109	ATA	4	31870	31882	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_010109	TTA	4	32434	32444	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_010109	AAT	4	32555	32566	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_010109	ATA	4	32982	32994	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_010109	AAT	4	33067	33078	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_010109	ATT	4	33576	33587	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_010109	TAT	4	34422	34434	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_010109	AAT	4	35515	35525	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_010109	TTG	4	37949	37959	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	171259350
27	NC_010109	TCT	4	40285	40295	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	161784190
28	NC_010109	TAT	5	40337	40350	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_010109	AAG	4	42933	42943	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	161784192
30	NC_010109	CTA	4	43402	43413	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	161784192
31	NC_010109	ATT	4	45097	45107	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_010109	TTC	4	46189	46201	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	161784193
33	NC_010109	AAT	4	51786	51798	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_010109	ATT	4	59328	59340	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_010109	TAA	4	63473	63485	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_010109	TCC	4	65013	65024	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
37	NC_010109	AAT	4	66873	66884	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010109	AAT	4	68195	68205	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_010109	GTT	4	72486	72497	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_010109	TAA	4	73384	73394	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_010109	TTA	4	75710	75722	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	161784216
42	NC_010109	TTA	4	83869	83879	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	161784216
43	NC_010109	GAA	4	85761	85771	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	161784216
44	NC_010109	ATT	4	86537	86548	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	161784216
45	NC_010109	ATT	5	88930	88945	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	161784216
46	NC_010109	ATT	5	88952	88966	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	161784216
47	NC_010109	ATT	4	88973	88985	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	161784216
48	NC_010109	TAT	5	88998	89013	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	161784216
49	NC_010109	TAT	4	89039	89050	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	161784216
50	NC_010109	GAT	4	91411	91421	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	161784216
51	NC_010109	GAA	4	93073	93084	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	161784216
52	NC_010109	GAT	4	94471	94482	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	161784216
53	NC_010109	TGA	4	96210	96221	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	161784216
54	NC_010109	ATA	4	99886	99896	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	161784216
55	NC_010109	TAA	4	99920	99931	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	161784216
56	NC_010109	TAC	4	104079	104090	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	161784216
57	NC_010109	TTA	4	114781	114792	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	161784256
58	NC_010109	ATT	4	115133	115144	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	161784256
59	NC_010109	GAA	4	115422	115433	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	161784256
60	NC_010109	GAG	4	116904	116915	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	161784256
61	NC_010109	ATT	4	119893	119904	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	161784256
62	NC_010109	ATT	4	120947	120958	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	161784256
63	NC_010109	TTC	4	122030	122040	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	161784256
64	NC_010109	AAG	4	122630	122641	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	161784256
65	NC_010109	TTG	4	123373	123384	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	161784256
66	NC_010109	GAA	4	123550	123561	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	161784256
67	NC_010109	TTA	4	126759	126770	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	161784256
68	NC_010109	GAT	4	128945	128956	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	161784256
69	NC_010109	AAT	4	134905	134916	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	161784256
70	NC_010109	TCT	4	140428	140439	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	161784256
71	NC_010109	AAT	4	140719	140730	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	161784256
72	NC_010109	GTA	4	151773	151784	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	161784256
73	NC_010109	TAT	4	155933	155944	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_010109	ATC	4	161381	161392	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	161784254
75	NC_010109	TCT	4	162780	162791	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	161784254
76	NC_010109	ATC	4	164442	164452	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

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