ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Acorus americanus chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010093	CAG	4	729	740	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	161622290
2	NC_010093	ATT	5	13599	13613	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_010093	TTA	4	15441	15453	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	161622299
4	NC_010093	GTT	4	23451	23462	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	161622301
5	NC_010093	TGA	4	27350	27361	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_010093	ATA	4	27717	27728	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_010093	AAT	4	32789	32800	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_010093	GGA	4	34662	34673	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	171259338
9	NC_010093	TCT	5	37293	37307	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	161622308
10	NC_010093	ATG	4	38847	38857	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	161622309
11	NC_010093	GCA	4	40745	40756	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	161622310
12	NC_010093	ATA	5	45358	45372	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_010093	ATT	4	45748	45759	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_010093	AGT	4	46115	46126	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	161622312
15	NC_010093	TAA	4	46943	46953	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_010093	TGA	4	53397	53407	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_010093	ATA	4	56226	56236	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_010093	TTA	4	65147	65158	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_010093	TAT	4	70235	70247	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	161622289
20	NC_010093	TCT	4	70277	70288	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	161622289
21	NC_010093	GAA	4	83669	83679	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	161622289
22	NC_010093	CTT	4	83905	83916	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	161622289
23	NC_010093	GAT	4	85749	85759	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	161622289
24	NC_010093	GAT	5	91795	91809	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	161622289
25	NC_010093	TCA	5	91975	91988	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	161622289
26	NC_010093	ACG	4	93261	93271	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	161622289
27	NC_010093	GAA	4	109043	109054	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	161622333
28	NC_010093	GAA	7	109403	109423	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	161622333
29	NC_010093	AAG	4	111073	111084	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	161622333
30	NC_010093	TAT	4	113792	113802	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	161622333
31	NC_010093	TAA	4	122976	122987	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	161622333
32	NC_010093	ATA	4	126383	126393	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	161622333
33	NC_010093	GTA	4	126856	126867	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	161622333
34	NC_010093	TGT	5	126991	127005	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	161622333
35	NC_010093	TCA	4	127495	127505	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	161622333
36	NC_010093	TCT	8	127892	127914	23	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	161622333
37	NC_010093	TCT	4	128263	128274	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	161622333
38	NC_010093	TGA	5	145328	145341	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	161622370
39	NC_010093	ATC	5	145507	145521	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	161622370
40	NC_010093	ATC	4	151557	151567	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Acorus americanus chloroplast