ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pseudocellus pearsei mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009985	TTTG	3	859	869	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	160688375
2	NC_009985	ATA	4	1621	1631	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	160688377
3	NC_009985	CA	6	2540	2550	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	160688379
4	NC_009985	ATTA	3	4949	4959	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	160688382
5	NC_009985	CA	6	4961	4971	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	160688382
6	NC_009985	ATC	4	5514	5525	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	160688382
7	NC_009985	CAT	4	5600	5611	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	160688382
8	NC_009985	CAA	5	6208	6222	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	160688382
9	NC_009985	AAAAAT	3	6309	6327	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	160688382
10	NC_009985	ACA	4	7293	7303	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	160688383
11	NC_009985	AAC	4	7460	7471	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	160688383
12	NC_009985	ATAC	3	7603	7614	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	160688383
13	NC_009985	ATA	5	7668	7681	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	160688383
14	NC_009985	AAAAT	3	7852	7866	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	160688384
15	NC_009985	ACA	5	7884	7897	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	160688384
16	NC_009985	TTAA	3	7963	7973	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	160688384
17	NC_009985	TAA	4	8210	8221	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	160688385
18	NC_009985	CATA	3	8873	8884	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	160688386
19	NC_009985	ATATTA	3	8950	8967	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	160688386
20	NC_009985	TCTA	3	9699	9710	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
21	NC_009985	CAA	5	9775	9790	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	160688387
22	NC_009985	CAT	4	9827	9838	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	160688387
23	NC_009985	A	13	9879	9891	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	160688387
24	NC_009985	TAAA	3	9922	9933	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	160688387
25	NC_009985	CAAA	3	10082	10092	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	160688387
26	NC_009985	AAAG	3	10328	10339	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	160688387
27	NC_009985	TA	9	11399	11416	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_009985	TAA	4	11552	11563	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_009985	TTTA	4	11958	11973	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_009985	TACT	3	12087	12098	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
31	NC_009985	TTAA	3	12167	12177	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_009985	ACA	4	12231	12242	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_009985	TTAAA	4	12257	12276	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
34	NC_009985	TAA	4	12308	12318	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_009985	TA	7	12788	12800	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_009985	AAT	5	13831	13845	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_009985	TAAA	3	14194	14204	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	160688376
38	NC_009985	ATC	4	14859	14869	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	160688376
39	NC_009985	CAA	4	14920	14932	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	160688376
40	NC_009985	TACCA	3	14992	15005	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	160688376

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pseudocellus pearsei mitochondrion