ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cuscuta exaltata chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009963	ATT	5	3329	3343	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_009963	ATA	4	5819	5830	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	159161237
3	NC_009963	TAA	4	6064	6074	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_009963	AAC	4	8630	8641	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	159161238
5	NC_009963	TAT	5	10232	10246	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_009963	TTG	4	13483	13494	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_009963	ATG	4	13581	13592	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	159161243
8	NC_009963	TTC	4	19209	19219	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	159161244
9	NC_009963	TTC	4	20477	20488	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	159161244
10	NC_009963	TAT	4	28549	28560	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_009963	TAA	7	28797	28817	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
12	NC_009963	TTG	4	30880	30890	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	159161249
13	NC_009963	GCA	4	36605	36616	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	159161253
14	NC_009963	TTA	4	40563	40574	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_009963	AGA	4	44990	45002	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_009963	TAA	4	47566	47576	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	159161260
17	NC_009963	ATA	4	48085	48095	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_009963	AAT	4	50993	51003	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	159161264
19	NC_009963	CCG	4	54240	54250	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	159161265
20	NC_009963	TAT	5	55195	55209	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	159161266
21	NC_009963	GTT	4	58367	58378	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_009963	TAA	4	59544	59556	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_009963	ATT	4	64757	64767	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	159161274
24	NC_009963	TAA	4	76428	76440	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	159161274
25	NC_009963	ATA	4	78429	78439	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	159161274
26	NC_009963	TAT	4	78580	78591	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	159161274
27	NC_009963	CTT	4	99124	99134	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	159161299
28	NC_009963	AAG	4	101212	101222	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	159161299
29	NC_009963	TTA	4	105537	105548	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	159161299
30	NC_009963	GTT	4	107391	107402	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	159161299

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cuscuta exaltata chloroplast