ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Ceratophyllum demersum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_009962TTCCA3395439671420 %40 %0 %40 %7 %Non-Coding
2NC_009962TCTCT351985211140 %60 %0 %40 %7 %159161142
3NC_009962TGTAT3535153641420 %60 %20 %0 %7 %159161142
4NC_009962ATTCT3730873211420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
5NC_009962GGAAT3888689001540 %20 %40 %0 %6 %Non-Coding
6NC_009962CTCTT31468714700140 %60 %0 %40 %7 %Non-Coding
7NC_009962CAAGA326535265481460 %0 %20 %20 %7 %159161152
8NC_009962TTCCT34319743210140 %60 %0 %40 %7 %Non-Coding
9NC_009962ATCAA346655466691560 %20 %0 %20 %0 %Non-Coding
10NC_009962AAGTT368671686841440 %40 %20 %0 %7 %Non-Coding
11NC_009962CATTC377546775591420 %40 %0 %40 %7 %159161184
12NC_009962AATTA380589806021460 %40 %0 %0 %7 %159161184
13NC_009962TTCTT49669296711200 %80 %0 %20 %10 %159161184
14NC_009962TTTTC39917599190160 %80 %0 %20 %6 %159161184
15NC_009962TTTCG39919399206140 %60 %20 %20 %7 %159161184
16NC_009962TTTCT4101044101063200 %80 %0 %20 %10 %159161185
17NC_009962AGAAA31126601126731480 %0 %20 %0 %7 %159161185
18NC_009962TTTTG3126870126883140 %80 %20 %0 %7 %159161185
19NC_009962GATAA31277201277331460 %20 %20 %0 %7 %159161185
20NC_009962TTCTT3128607128621150 %80 %0 %20 %6 %159161185
21NC_009962GAAAA31436701436851680 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding