ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ceratophyllum demersum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009962	CTA	4	2574	2585	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	159161141
2	NC_009962	TAT	4	14710	14720	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_009962	TTA	4	14770	14782	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_009962	TGT	4	16924	16934	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	159161150
5	NC_009962	TCT	4	22410	22420	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	159161151
6	NC_009962	GTT	4	23892	23903	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	159161151
7	NC_009962	ATG	4	29204	29216	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_009962	ATC	6	32007	32025	19	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
9	NC_009962	ATA	4	33645	33656	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_009962	GCA	4	41894	41905	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	159161160
11	NC_009962	ATT	4	46730	46740	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_009962	AGT	4	47289	47300	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	159161162
13	NC_009962	ATG	4	48214	48224	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_009962	ATT	4	53480	53491	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_009962	ATA	4	56525	56535	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	159161167
16	NC_009962	GAA	4	62705	62717	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_009962	TAT	4	66440	66451	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009962	ATA	4	69144	69155	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_009962	TTC	4	72491	72502	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	159161184
20	NC_009962	TTA	4	73129	73140	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	159161184
21	NC_009962	GGA	4	82366	82378	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	159161184
22	NC_009962	GAT	4	87160	87170	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	159161184
23	NC_009962	GAT	4	88537	88547	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	159161184
24	NC_009962	GAT	4	91583	91594	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	159161184
25	NC_009962	TGA	4	93310	93321	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	159161184
26	NC_009962	CTC	4	95932	95942	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	159161184
27	NC_009962	TAC	4	100509	100520	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	159161184
28	NC_009962	CTT	4	112461	112472	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159161185
29	NC_009962	AAG	4	113329	113340	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	159161185
30	NC_009962	GAA	4	114091	114101	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	159161185
31	NC_009962	TAA	4	114275	114286	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	159161185
32	NC_009962	TTA	4	114536	114547	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	159161185
33	NC_009962	TAT	4	115981	115991	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	159161185
34	NC_009962	CTT	4	116799	116809	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	159161185
35	NC_009962	TTG	4	126409	126420	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159161185
36	NC_009962	GTA	4	142340	142351	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	159161185
37	NC_009962	ATC	4	151266	151277	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	159161222
38	NC_009962	ATC	4	154313	154323	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
39	NC_009962	ATC	4	155690	155700	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	159161224

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ceratophyllum demersum chloroplast