ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lolium perenne chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009950	CAG	4	680	691	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	159106844
2	NC_009950	AGA	4	3272	3282	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_009950	TAA	4	3563	3574	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_009950	TCT	4	4521	4532	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_009950	GAA	4	8349	8360	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_009950	TTG	4	10649	10659	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	159106850
7	NC_009950	TAT	4	14631	14641	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_009950	TAT	4	16878	16888	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_009950	AAC	4	22555	22566	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	159106855
10	NC_009950	ATT	4	29340	29352	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_009950	GTT	6	31022	31039	18	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	159106858
12	NC_009950	TGC	4	31752	31763	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	159106859
13	NC_009950	AAG	4	41949	41960	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	159106865
14	NC_009950	AGT	4	42352	42362	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	159106865
15	NC_009950	ATT	4	46837	46847	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_009950	TAA	4	47538	47548	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_009950	GAA	4	57957	57967	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_009950	AAG	4	58230	58240	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_009950	TTC	4	60156	60167	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	159106876
20	NC_009950	TTC	5	64749	64763	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
21	NC_009950	AGA	4	73829	73840	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	159106887
22	NC_009950	TAT	4	74893	74903	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	159106887
23	NC_009950	ATT	4	75483	75493	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	159106887
24	NC_009950	CTT	5	79870	79883	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	159106887
25	NC_009950	TTC	4	80988	80998	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	159106887
26	NC_009950	TAC	4	89384	89395	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	159106887
27	NC_009950	CAA	4	108010	108020	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	159106927
28	NC_009950	TTA	4	111956	111967	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	159106927
29	NC_009950	GTA	4	125852	125863	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	159106927

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lolium perenne chloroplast