ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pleurotus ostreatus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009905	ATT	4	2285	2295	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	15825172
2	NC_009905	AAT	4	3132	3144	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	15825172
3	NC_009905	TAA	4	3501	3512	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15825172
4	NC_009905	TAA	4	3666	3677	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15825172
5	NC_009905	TAT	4	4821	4832	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_009905	GCA	4	5448	5458	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_009905	TCC	4	6273	6283	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
8	NC_009905	CTC	4	6343	6354	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
9	NC_009905	TAT	4	6536	6546	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_009905	ATA	4	7705	7716	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_009905	TAA	4	13122	13133	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15825173
12	NC_009905	TAT	4	14123	14134	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15825173
13	NC_009905	AGC	4	16064	16075	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_009905	AGG	4	16111	16121	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_009905	ATT	4	19345	19355	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_009905	TCT	4	20981	20991	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	15825173
17	NC_009905	TTA	4	21106	21116	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	15825173
18	NC_009905	TAA	4	21134	21146	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_009905	GAG	4	21564	21574	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_009905	TTC	4	21858	21870	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	15825173
21	NC_009905	ATT	4	22044	22055	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15825173
22	NC_009905	AGC	4	23045	23056	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_009905	ATA	4	23377	23389	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_009905	TAA	6	24191	24207	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_009905	ATA	4	24827	24837	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_009905	TAA	5	25073	25086	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_009905	AAT	4	26230	26242	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	15825173
28	NC_009905	ATA	7	28191	28211	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	15825173
29	NC_009905	ATA	4	28606	28616	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	15825173
30	NC_009905	TAA	4	29141	29152	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15825173
31	NC_009905	ATA	4	29266	29276	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	15825173
32	NC_009905	TTA	4	31726	31736	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	15825173
33	NC_009905	ATT	4	32778	32789	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_009905	CCT	4	32854	32864	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
35	NC_009905	ATT	4	33345	33357	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_009905	TAT	4	33936	33947	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15825173
37	NC_009905	ATT	4	35365	35375	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_009905	CTC	4	36805	36815	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
39	NC_009905	AGT	4	37197	37207	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_009905	AAT	4	37449	37459	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	15825174
41	NC_009905	ATT	4	38812	38823	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15825174
42	NC_009905	TTA	4	38912	38923	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15825174
43	NC_009905	ATT	4	39079	39089	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	15825174
44	NC_009905	TAT	4	39707	39719	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	15825174
45	NC_009905	ATT	4	40077	40088	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15825174
46	NC_009905	ATT	4	40751	40761	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	15825174
47	NC_009905	TAA	4	42284	42294	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_009905	TAT	4	42331	42342	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_009905	ATT	5	45342	45355	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_009905	TTG	4	47743	47754	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_009905	TGT	5	47753	47767	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_009905	TGT	4	47783	47794	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_009905	AAT	4	48684	48694	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_009905	TAT	4	52190	52200	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_009905	AAT	4	54675	54685	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_009905	AAT	4	54901	54912	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_009905	TAA	5	55679	55693	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_009905	AGG	4	55804	55814	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_009905	TAT	6	57907	57923	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	15825174
60	NC_009905	TCT	5	59273	59287	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	15825174
61	NC_009905	CTT	4	59403	59414	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	15825174
62	NC_009905	TTA	4	59968	59978	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	15825174
63	NC_009905	AGT	4	62023	62034	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	15825174
64	NC_009905	AAT	4	63226	63237	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15825174
65	NC_009905	TAT	4	63375	63385	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	15825174
66	NC_009905	ATA	4	65053	65064	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15825174
67	NC_009905	ATA	4	66075	66086	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15825174
68	NC_009905	TAT	4	66892	66903	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15825174
69	NC_009905	AAT	4	68185	68196	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15825174
70	NC_009905	TAT	4	69625	69638	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	15825175
71	NC_009905	ATT	5	69719	69733	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	15825175
72	NC_009905	TAT	4	72696	72707	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15825175
73	NC_009905	TAT	4	73093	73103	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	15825175

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pleurotus ostreatus mitochondrion