ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pleurotus ostreatus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009905	AAAC	3	103	113	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_009905	TA	6	318	329	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	15825172
3	NC_009905	AAAAT	3	1228	1241	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	15825172
4	NC_009905	ATT	4	2285	2295	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	15825172
5	NC_009905	AAT	4	3132	3144	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	15825172
6	NC_009905	TAA	4	3501	3512	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15825172
7	NC_009905	TAA	4	3666	3677	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15825172
8	NC_009905	T	15	3812	3826	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009905	T	12	3884	3895	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009905	T	15	4176	4190	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_009905	TTAT	3	4425	4436	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_009905	TAAA	3	4440	4450	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_009905	TAT	4	4821	4832	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_009905	GCA	4	5448	5458	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
15	NC_009905	AT	6	5495	5506	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_009905	ATAAAA	5	5605	5635	31	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_009905	TCC	4	6273	6283	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
18	NC_009905	CTC	4	6343	6354	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
19	NC_009905	TAT	4	6536	6546	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_009905	AAAT	3	7578	7588	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_009905	A	16	7644	7659	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_009905	ATA	4	7705	7716	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_009905	TTTA	3	7734	7744	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_009905	CTTT	3	8249	8261	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	15825172
25	NC_009905	ATTT	3	10836	10847	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	15825173
26	NC_009905	TA	6	11424	11434	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_009905	TCCA	4	11666	11681	16	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
28	NC_009905	AGGTTT	3	12841	12858	18	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	5 %	15825173
29	NC_009905	TAA	4	13122	13133	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15825173
30	NC_009905	TTAG	4	13606	13622	17	25 %	50 %	25 %	0 %	5 %	15825173
31	NC_009905	TTAA	3	13778	13789	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	15825173
32	NC_009905	TAT	4	14123	14134	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15825173
33	NC_009905	ACCAA	3	14264	14277	14	60 %	0 %	0 %	40 %	7 %	15825173
34	NC_009905	TTTTA	4	14607	14626	20	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
35	NC_009905	AT	6	14880	14891	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_009905	AT	11	15432	15453	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_009905	A	12	15926	15937	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009905	AGC	4	16064	16075	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_009905	AGG	4	16111	16121	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_009905	T	15	17328	17342	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_009905	AATTTA	3	18350	18368	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
42	NC_009905	AAAT	3	18568	18578	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_009905	C	15	18590	18604	15	0 %	0 %	0 %	100 %	6 %	Non-Coding
44	NC_009905	GTAA	3	19319	19330	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009905	ATT	4	19345	19355	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_009905	T	12	19512	19523	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009905	AAATA	4	20699	20719	21	80 %	20 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
48	NC_009905	TAAAA	4	20769	20788	20	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
49	NC_009905	ATAAA	4	20789	20808	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
50	NC_009905	AAAT	3	20819	20829	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_009905	TCT	4	20981	20991	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	15825173
52	NC_009905	TTA	4	21106	21116	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	15825173
53	NC_009905	TAA	4	21134	21146	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_009905	TAAA	5	21305	21323	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
55	NC_009905	AAATAA	3	21468	21486	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
56	NC_009905	TAGCA	3	21549	21563	15	40 %	20 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009905	GAG	4	21564	21574	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_009905	AAAG	3	21741	21751	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	15825173
59	NC_009905	TTC	4	21858	21870	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	15825173
60	NC_009905	ATT	4	22044	22055	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15825173
61	NC_009905	TTAA	3	22115	22126	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	15825173
62	NC_009905	TACTAT	6	22383	22423	41	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	9 %	15825173
63	NC_009905	AGC	4	23045	23056	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
64	NC_009905	GCCT	3	23095	23106	12	0 %	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009905	TAAAA	3	23319	23333	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_009905	ATA	4	23377	23389	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_009905	TAA	6	24191	24207	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_009905	ATTT	6	24274	24296	23	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_009905	AT	6	24405	24415	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_009905	AT	7	24808	24821	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_009905	ATA	4	24827	24837	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_009905	AAATA	4	24838	24858	21	80 %	20 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_009905	ATAAAA	3	24876	24893	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
74	NC_009905	AAAT	13	24886	24937	52	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_009905	ATAA	4	24945	24960	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009905	ATAA	3	24974	24985	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009905	TAAA	3	24993	25004	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009905	TAA	5	25073	25086	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_009905	CCTTT	3	25323	25336	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
80	NC_009905	TAAA	3	25399	25409	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_009905	CCTT	3	25693	25705	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
82	NC_009905	TTAA	3	25850	25861	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_009905	CCTT	3	26059	26071	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
84	NC_009905	AAT	4	26230	26242	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	15825173
85	NC_009905	TAACAA	3	26244	26261	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	15825173
86	NC_009905	ATGT	3	26283	26293	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	15825173
87	NC_009905	TTTTA	3	26475	26488	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	15825173
88	NC_009905	TAAG	3	27512	27522	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_009905	ATTA	4	27630	27644	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_009905	TAAAA	3	27906	27920	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_009905	AT	6	28162	28172	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	15825173
92	NC_009905	ATA	7	28191	28211	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	15825173
93	NC_009905	ATA	4	28606	28616	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	15825173
94	NC_009905	TAA	4	29141	29152	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15825173
95	NC_009905	ATA	4	29266	29276	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	15825173
96	NC_009905	TATT	3	29511	29522	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	15825173
97	NC_009905	TAAAAT	3	29861	29878	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	15825173
98	NC_009905	TAAAA	3	30098	30111	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	15825173
99	NC_009905	AAAC	3	30217	30228	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
100	NC_009905	GTTT	3	30745	30756	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_009905	TTTTA	3	30757	30770	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_009905	TTAA	3	30868	30879	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_009905	TATT	3	30997	31007	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_009905	TCCT	3	31180	31191	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009905	AAAT	3	31343	31354	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_009905	TTA	4	31726	31736	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	15825173
107	NC_009905	AAAT	3	32610	32620	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_009905	C	13	32626	32638	13	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
109	NC_009905	ATT	4	32778	32789	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_009905	CCT	4	32854	32864	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
111	NC_009905	TAAA	3	32990	33001	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_009905	T	14	33019	33032	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_009905	TTCC	3	33099	33109	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
114	NC_009905	ATT	4	33345	33357	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_009905	TAT	4	33936	33947	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15825173
116	NC_009905	ATT	4	35365	35375	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_009905	TAAA	3	36087	36097	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	15825173
118	NC_009905	A	14	36316	36329	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	15825173
119	NC_009905	TCCTC	5	36746	36770	25	0 %	40 %	0 %	60 %	4 %	Non-Coding
120	NC_009905	CTC	4	36805	36815	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
121	NC_009905	AGT	4	37197	37207	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_009905	CTTT	3	37267	37278	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
123	NC_009905	AAT	4	37449	37459	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	15825174
124	NC_009905	TAAATA	28	38333	38506	174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_009905	ATATAA	3	38336	38353	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
126	NC_009905	A	12	38635	38646	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_009905	ATT	4	38812	38823	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15825174
128	NC_009905	TTA	4	38912	38923	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15825174
129	NC_009905	TA	6	38968	38978	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	15825174
130	NC_009905	ATT	4	39079	39089	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	15825174
131	NC_009905	TAT	4	39707	39719	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	15825174
132	NC_009905	ATT	4	40077	40088	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15825174
133	NC_009905	ATTT	3	40389	40400	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	15825174
134	NC_009905	CTAT	3	40634	40645	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	15825174
135	NC_009905	ATT	4	40751	40761	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	15825174
136	NC_009905	AATT	3	41133	41143	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_009905	TAAA	3	41502	41513	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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181	NC_009905	TTAA	3	55352	55363	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
182	NC_009905	TAAA	3	55540	55550	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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219	NC_009905	TCCTC	5	72207	72231	25	0 %	40 %	0 %	60 %	8 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pleurotus ostreatus mitochondrion