ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Tilletia indica mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_009880	TA	6	68	79	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_009880	AT	6	509	520	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_009880	TAAA	3	623	633	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_009880	TTAT	3	798	808	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_009880	ATA	4	1693	1703	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_009880	AT	6	1789	1800	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_009880	TA	6	2221	2231	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_009880	TA	6	2529	2539	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_009880	TAA	5	2616	2629	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_009880	AT	7	3137	3149	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_009880	GTA	4	4624	4635	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_009880	AAAT	3	5038	5048	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_009880	TAT	4	6268	6279	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_009880	TAA	4	6380	6390	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_009880	TTA	5	6487	6502	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_009880	T	12	7133	7144	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_009880	TAAA	3	7207	7219	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_009880	TAA	4	7862	7874	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_009880	TA	6	10506	10516	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_009880	ATT	4	10855	10866	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_009880	TA	7	11080	11093	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_009880	TA	6	11506	11516	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_009880	AAT	4	11850	11862	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_009880	TA	8	12068	12083	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_009880	ATA	4	12110	12121	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_009880	TTA	5	12818	12832	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_009880	CTTT	3	13226	13236	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
28	NC_009880	ATT	4	13237	13248	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_009880	GCTATT	4	13923	13945	23	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	8 %	15781626
30	NC_009880	TA	6	14940	14950	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_009880	TA	7	15192	15205	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_009880	TTC	4	15772	15784	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
33	NC_009880	TTTA	5	15787	15806	20	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
34	NC_009880	TA	6	15809	15820	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_009880	ATAA	3	15848	15859	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009880	TA	6	16161	16171	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_009880	CAAA	3	16276	16287	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
38	NC_009880	TATT	3	16381	16391	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_009880	TTCT	3	16997	17008	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	15781626
40	NC_009880	TAAA	3	17874	17886	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_009880	TTA	4	18021	18031	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_009880	GAT	4	18195	18206	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	15781626
43	NC_009880	TA	8	19023	19037	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_009880	TTTA	3	19189	19199	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_009880	TA	6	19215	19225	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_009880	TTTA	3	19361	19372	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_009880	ATA	4	20311	20323	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_009880	GAAA	3	20638	20648	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_009880	TTTA	3	20703	20713	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_009880	TAT	4	20767	20778	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_009880	ATTATA	3	20926	20944	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
52	NC_009880	TA	6	20974	20985	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_009880	TA	6	21302	21312	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_009880	CATA	3	21348	21358	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
55	NC_009880	AAG	4	21466	21477	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_009880	TAAATA	3	22189	22207	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
57	NC_009880	TTTA	3	22998	23008	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_009880	TA	7	23151	23163	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_009880	TA	6	23322	23333	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_009880	ATGTAT	12	23388	23465	78	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_009880	TA	7	23882	23894	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_009880	TA	7	24753	24765	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	15781626
63	NC_009880	TAA	4	24870	24884	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_009880	TAA	4	25323	25335	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_009880	ATT	4	25404	25415	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_009880	AT	7	26547	26559	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	15781626
67	NC_009880	TAATA	3	28389	28403	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	15781626
68	NC_009880	CTT	4	28736	28748	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	15781626
69	NC_009880	TAATA	3	29902	29915	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	15781626
70	NC_009880	TAAAA	3	30071	30085	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_009880	TA	14	30960	30987	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_009880	ATT	5	31415	31429	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_009880	TAT	5	31459	31473	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_009880	ATT	4	31501	31511	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_009880	ATA	4	31540	31551	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_009880	TTA	4	31715	31726	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_009880	TA	7	31884	31896	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_009880	GAA	4	31918	31929	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_009880	TA	6	31943	31953	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_009880	TA	7	32255	32268	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_009880	TAAA	3	32773	32785	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_009880	AT	6	33596	33607	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_009880	TATT	3	34361	34372	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_009880	TTA	4	34434	34445	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_009880	ATA	4	34715	34725	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_009880	TAA	4	35123	35134	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_009880	G	16	35447	35462	16	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_009880	TAA	4	36212	36223	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_009880	TATG	3	36962	36972	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	15781626
90	NC_009880	TCTT	3	37293	37303	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	15781626
91	NC_009880	GCT	4	37480	37491	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	15781626
92	NC_009880	ATTAT	3	37555	37570	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	15781626
93	NC_009880	GTAT	3	38090	38101	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	15781626
94	NC_009880	TAT	4	38469	38479	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_009880	CCCT	3	38857	38868	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
96	NC_009880	T	12	38940	38951	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_009880	TAA	4	39058	39070	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_009880	TTTA	3	39269	39279	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_009880	TA	11	39703	39723	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_009880	TAAAA	3	39823	39837	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009880	TA	8	39994	40008	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_009880	TTAAC	3	40389	40403	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
103	NC_009880	TGGAAT	3	40494	40511	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	15781626
104	NC_009880	AAT	4	41678	41689	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_009880	TAAT	3	41817	41827	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_009880	TTAT	3	42531	42542	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_009880	TTA	4	42614	42624	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_009880	TAT	4	42813	42823	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_009880	ATA	4	42890	42901	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_009880	ATTTT	3	44389	44403	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	15781626
111	NC_009880	CAT	4	44854	44864	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	15781626
112	NC_009880	AAT	4	46129	46139	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_009880	TTTTAT	3	46525	46543	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
114	NC_009880	TAA	4	46939	46950	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_009880	ATA	4	48466	48477	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15781627
116	NC_009880	T	13	49056	49068	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	15781627
117	NC_009880	AGT	4	52054	52064	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	15781627
118	NC_009880	TAGA	3	52823	52833	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	15781627
119	NC_009880	TAA	4	53024	53034	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	15781627
120	NC_009880	AGT	4	53181	53192	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	15781627
121	NC_009880	TAA	4	53342	53353	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15781627
122	NC_009880	ATA	4	56111	56123	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_009880	TTTATT	3	56142	56160	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
124	NC_009880	AT	7	56352	56364	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_009880	TA	6	56374	56385	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_009880	TA	6	56388	56398	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_009880	TCT	4	56568	56579	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
128	NC_009880	TA	6	56611	56621	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_009880	TA	7	56949	56961	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_009880	TA	7	57167	57179	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_009880	TAT	4	57549	57560	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_009880	TCT	4	58096	58106	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
133	NC_009880	AAAGA	3	58259	58273	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
134	NC_009880	TTA	4	58786	58797	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_009880	CCTA	3	58897	58909	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
136	NC_009880	CCTT	3	59188	59199	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
137	NC_009880	TA	7	59200	59213	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
138	NC_009880	GA	6	59336	59347	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_009880	CAT	4	60475	60487	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	15781627
140	NC_009880	AAAG	3	60594	60605	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009880	TA	6	60682	60692	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_009880	A	12	61282	61293	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
143	NC_009880	AATTA	3	61491	61504	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
144	NC_009880	TTAT	3	61519	61531	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
145	NC_009880	TAT	4	61919	61930	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15781627
146	NC_009880	ACT	4	62417	62428	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	15781627
147	NC_009880	TTTTA	3	62777	62790	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
148	NC_009880	AAAT	3	63075	63085	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
149	NC_009880	TTA	4	63249	63260	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
150	NC_009880	AT	7	63265	63277	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
151	NC_009880	AT	6	63588	63598	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
152	NC_009880	CTT	4	63606	63617	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
153	NC_009880	CTA	4	64660	64670	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	15781627
154	NC_009880	CTTA	3	64770	64780	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	15781627
155	NC_009880	TTAT	3	65133	65145	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	15781627

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Tilletia indica mitochondrion