ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Ipomoea purpurea chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_009808TAGGT3671267261520 %40 %40 %0 %6 %Non-Coding
2NC_009808AAAAC3675667701580 %0 %0 %20 %6 %Non-Coding
3NC_009808TTGAA3722772411540 %40 %20 %0 %6 %Non-Coding
4NC_009808TTATT416100161181920 %80 %0 %0 %10 %Non-Coding
5NC_009808TTTGA317548175621520 %60 %20 %0 %6 %157325520
6NC_009808AAATA323117231301480 %20 %0 %0 %7 %157325521
7NC_009808TAAAA447265472842080 %20 %0 %0 %10 %Non-Coding
8NC_009808TTAGG356751567641420 %40 %40 %0 %7 %Non-Coding
9NC_009808CTTCT45854758565190 %60 %0 %40 %5 %Non-Coding
10NC_009808GAAAA365734657491680 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
11NC_009808ATAGA465750657681960 %20 %20 %0 %10 %Non-Coding
12NC_009808ATTTC369905699181420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
13NC_009808TTCTT37214572158140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
14NC_009808AATTG380295803081440 %40 %20 %0 %7 %157325554
15NC_009808GTTTT38069380707150 %80 %20 %0 %6 %157325554
16NC_009808TAAAA388412884261580 %20 %0 %0 %6 %157325554
17NC_009808TAAAA788527885613580 %20 %0 %0 %8 %157325554
18NC_009808CTTCT3137350137365160 %60 %0 %40 %6 %157325593
19NC_009808TTTTA71616581616923520 %80 %0 %0 %8 %Non-Coding
20NC_009808ATTTT31617421617561520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
21NC_009808ATTTT31617921618061520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
22NC_009808CATAT31620081620221540 %40 %0 %20 %6 %Non-Coding